E3连接酶CHIP泛素化IRE1的分子机制研究
发布时间：2024-06-04 01:27
内质网是真核细胞中蛋白质合成、折叠与分泌的重要细胞器,它的内环境稳定是细胞维持正常功能的基本需求。在某种环境因素刺激下,合成后蛋白质在内质网中发生错误的折叠和修饰,导致其稳态失衡,形成内质网压力(endoplasmic reticulum stress, ER stress)。细胞内存在一系列信号转导通路,对内质网压力实行应答,这些应激通路一般称为错误折叠蛋白质应激(unfolded protein response, UPR)。肌醇需求蛋白质1(inositol-requiring protein-1, IRE1)是一个内质网膜蛋白质,是UPR中三个重要的内质网压力感受器和信号传导蛋白质之一。尽管人们对IRE1的分子机制已有相当程度的了解,但是有关IRE1与其他蛋白质的相互作用、它的信号通路调控、以及翻译后修饰的可能性等方面的知识依然匮乏。本课题以IRE1为研究对象,通过蛋白质互作分析,发现IRE1相互作用的蛋白质,进而聚焦于IRE1相关的修饰和信号通路,试图发现和阐明内质网压力条件下IRE1的新功能和可能的分子机制。利用蛋白质组学的方法,我们在IRE1的免疫共沉淀物中发现了若干泛素...
【文章页数】：108 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
致谢
摘要
Abstract
专业词汇中英文对照表
第一章 绪论
1.1 内质网的结构和功能
1.1.1 内质网的分类与结构
1.1.2 内质网的功能
1.2 内质网压力与错误折叠蛋白应激
1.2.1 内质网压力与错误折叠蛋白应激概述
1.2.2 三条UPR通路
1.3 内质网相关的蛋白降解
1.4 内质网压力和肿瘤的关系
1.4.1 IRE1通路在肿瘤中的作用
1.4.2 PERK通路在肿瘤中的作用
1.4.3 ATF6通路在肿瘤中的作用
1.5 内质网压力和衰老
1.5.1 内质网压力与衰老的关系
1.5.2 UPR在衰老过程中的作用
1.6 细胞老化
1.6.1 复制性老化和成熟前老化
1.6.2 调节细胞老化的信号通路和分子机制
1.6.3 细胞老化与肿瘤的关系
1.6.4 细胞老化和衰老的关系
1.7 泛素和泛素化系统
1.7.1 泛素和泛素化过程
1.7.2 泛素化链接方式
1.8 泛素化酶CHIP的结构和功能
1.8.1 CHIP的结构
1.8.2 CHIP的功能
1.9 本论文研究的目的
第二章 IRE1结合蛋白的鉴定与验证
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 实验材料
2.2.2 实验方法
2.3 实验结果
2.3.1 IRE1结合蛋白的免疫沉淀及质谱鉴定
2.3.2 IRE1与CHIP相互作用的验证
2.4 小结
第三章 CHIP对IRE1作用的分子机制研究
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 实验材料
3.2.2 实验方法
3.3 实验结果
3.3.1 CHIP在体内泛素化IRE1
3.3.2 CHIP对IRE1的泛素化修饰方式的研究
3.4 小结
第四章 CHIP对IRE1的激酶活性及信号通路的影响
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 实验材料
4.2.2 实验方法
4.3 实验结果
4.3.1 GA引起的内质网压力对IRE1的激活的影响
4.3.2 CHIP对IRE1下游相关通路的影响
4.3.3 IRE1的泛素化修饰对其激酶活性和IRE1/TRAF2/JNK通路的影响
4.3.4 去泛素化酶OTUB1对IRE1/TRAF2/JNK通路的影响
4.3.5 CHIP对其他UPR通路的影响
4.3.5.1 CHIP对ATF6通路的影响
4.3.5.2 CHIP对PERK通路的影响
4.4 小结
第五章 IRE1/TRAF2/JNK通路在细胞老化过程中的作用
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 实验材料
5.2.2 实验方法
5.3 实验结果
5.3.1 IRE1/TRAF2/JNK通路对细胞老化的作用
5.3.2 CHIP在细胞老化中的作用
5.4 小结
第六章 讨论
基本结论
参考文献
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果
本文编号：3988672
【文章页数】：108 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
致谢
摘要
Abstract
专业词汇中英文对照表
第一章 绪论
1.1 内质网的结构和功能
1.1.1 内质网的分类与结构
1.1.2 内质网的功能
1.2 内质网压力与错误折叠蛋白应激
1.2.1 内质网压力与错误折叠蛋白应激概述
1.2.2 三条UPR通路
1.3 内质网相关的蛋白降解
1.4 内质网压力和肿瘤的关系
1.4.1 IRE1通路在肿瘤中的作用
1.4.2 PERK通路在肿瘤中的作用
1.4.3 ATF6通路在肿瘤中的作用
1.5 内质网压力和衰老
1.5.1 内质网压力与衰老的关系
1.5.2 UPR在衰老过程中的作用
1.6 细胞老化
1.6.1 复制性老化和成熟前老化
1.6.2 调节细胞老化的信号通路和分子机制
1.6.3 细胞老化与肿瘤的关系
1.6.4 细胞老化和衰老的关系
1.7 泛素和泛素化系统
1.7.1 泛素和泛素化过程
1.7.2 泛素化链接方式
1.8 泛素化酶CHIP的结构和功能
1.8.1 CHIP的结构
1.8.2 CHIP的功能
1.9 本论文研究的目的
第二章 IRE1结合蛋白的鉴定与验证
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 实验材料
2.2.2 实验方法
2.3 实验结果
2.3.1 IRE1结合蛋白的免疫沉淀及质谱鉴定
2.3.2 IRE1与CHIP相互作用的验证
2.4 小结
第三章 CHIP对IRE1作用的分子机制研究
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 实验材料
3.2.2 实验方法
3.3 实验结果
3.3.1 CHIP在体内泛素化IRE1
3.3.2 CHIP对IRE1的泛素化修饰方式的研究
3.4 小结
第四章 CHIP对IRE1的激酶活性及信号通路的影响
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 实验材料
4.2.2 实验方法
4.3 实验结果
4.3.1 GA引起的内质网压力对IRE1的激活的影响
4.3.2 CHIP对IRE1下游相关通路的影响
4.3.3 IRE1的泛素化修饰对其激酶活性和IRE1/TRAF2/JNK通路的影响
4.3.4 去泛素化酶OTUB1对IRE1/TRAF2/JNK通路的影响
4.3.5 CHIP对其他UPR通路的影响
4.3.5.1 CHIP对ATF6通路的影响
4.3.5.2 CHIP对PERK通路的影响
4.4 小结
第五章 IRE1/TRAF2/JNK通路在细胞老化过程中的作用
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 实验材料
5.2.2 实验方法
5.3 实验结果
5.3.1 IRE1/TRAF2/JNK通路对细胞老化的作用
5.3.2 CHIP在细胞老化中的作用
5.4 小结
第六章 讨论
基本结论
参考文献
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果
本文编号：3988672
本文链接：https://www.wllwen.com/xiyixuelunwen/3988672.html
