一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体IME-CF2的分离、测序及全基因组分析

发布时间：2017-07-07 11:02

  本文关键词：一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体IME-CF2的分离、测序及全基因组分析

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【摘要】：目的从医院污水中分离一株能裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体,观察其形态,并进行全基因组测序和全基因组分析,为治疗和控制弗氏柠檬酸杆菌感染提供基础。方法以弗氏柠檬酸杆菌为宿主,从医院污水分离噬菌体,用透射电镜观察其形态;使用Ion Torrent测序平台进行噬菌体全基因组测序,测序后进行噬菌体全基因组序列组装、注释、进化分析和比较分析。结果成功分离一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体,命名为IME-CF2;电镜观察显示,该噬菌体具有二十面体的头部,形态类似肌尾噬菌体科;IME-CF2核酸类型为DNA,基因组全长为177 685 bp,GC含量为43.2%;编码267个编码区(CDS),2个tRNA;进化分析表明,IME-CF2属于T4类噬菌体,全基因组比较分析表明,IME-CF2与柠檬酸杆菌噬菌体Miller同源性最高。结论分离鉴定了一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体,进行了全基因组测序和分析,为噬菌体治疗多重耐药细菌奠定了基础。
【作者单位】： 安徽医科大学军事医学科学院微生物流行病研究所;军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室;
【关键词】： 弗氏柠檬酸杆菌 噬菌体 全基因组测序 基因组分析
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划)(编号:2012AA022003、2014AA021402) 国家科技重大专项课题(编号:2013ZX10004605、2013ZX10004217-002-003)
【分类号】：R378
【正文快照】： 弗氏柠檬酸杆灥肠杆菌科枸橼酸杆灥,是发酵型革兰阴性菌,广泛存在于自然环境中,是人体佊正常栤,也~#髓掙。洰来,枿触}0滥用,概柠壚杆sE常M抗生素产灥药[l],给临床感染治疗带来极大挑战。噬菌体是-种能特异性感染细}0病毒,广泛存在于自然环境中,栜灥体能P宿主灥麻亡|2]。灥体

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本文编号：529894