粪肠球菌噬菌体vB_E.faecalis_IME196的生物学特性及其全基因组分析

发布时间：2017-07-26 04:04

  本文关键词：粪肠球菌噬菌体vB_E.faecalis_IME196的生物学特性及其全基因组分析

  更多相关文章： 噬菌体 粪肠球菌 生物学特性 全基因组测序 基因组分析

【摘要】：【目的】从医院污水中分离一株能裂解多耐药粪肠球菌的噬菌体,分析该噬菌体的生物学特性,并进行全基因组测序和分析,为治疗和控制多耐药粪肠球菌感染提供基础。【方法】以耐药粪肠球菌为宿主,从医院污水分离噬菌体,双层平板法检测噬菌体效价、最佳感染复数(MOI)和一步生长曲线,纯化后负染法电镜观察噬菌体形态;蛋白酶K/SDS法提取噬菌体全基因组,酶切处理后琼脂糖凝胶电泳分析,使用Ion Torrent测序平台进行噬菌体全基因组测序,测序后进行噬菌体全基因组序列组装、注释、进化分析和比较分析。【结果】分离到一株粪肠球菌噬菌体,命名为v B_E.faecalis_IME196(IME196);其最佳感染复数为0.01,一步生长曲线显示IME196的潜伏期为30 min,暴发量为50 PFU,电镜观察该噬菌体为长尾噬菌体,结合BLASTp分析确定其属于尾病毒目长尾噬菌体科,基因测序表明,噬菌体IME196核酸类型为DNA,基因组全长为38 895 bp,G+C含量为33.9%。【结论】分离鉴定一株粪肠球菌噬菌体,进行了全基因组测序和分析,为以后预防和控制粪肠球菌的感染提供了一个新的途径,为噬菌体治疗多重耐药细菌奠定了基础。
【作者单位】： 河北师范大学;军事医学科学院微生物流行病研究所;
【关键词】： 噬菌体 粪肠球菌 生物学特性 全基因组测序 基因组分析
【基金】：科技重大专项“十二五”实施计划项目(No.2013ZX10004-605,2013ZX10004-217,2013ZX10004-607,2011ZX10004-001) 国家高技术研究发展计划项目(863计划)(No.2014AA021402,2012AA022-003) 国家自然科学基金项目(No.81572045)~~
【分类号】：R378
【正文快照】： 肠道微生态系统中寄居着大量菌群,其中既有益生菌、中间型菌群,也有致病菌[1]。益生肠球菌作为一类重要的益生菌,已普遍用于食品的加工[2]。目前,粪肠球菌是最常用的益生肠球菌,主要应用于食品发酵的工艺中,许多食物中均添加了粪肠球菌,例如香肠、奶酪、橄榄油等[3]。粪肠球菌

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 羽晓瑜;陆玉霞;;粪肠球菌聚集物质的研究进展[J];中国微生态学杂志;2010年07期

2 王睿,方翼,陈迁,白艳红;粪肠球菌的抗生素后效应[J];中国医院药学杂志;1999年08期

3 潘伟光;李一凡;邓启文;张健华;;1株利奈唑胺耐药粪肠球菌的基因突变检测[J];中国感染与化疗杂志;2013年02期

4 吴利先,黄文祥;粪肠球菌sprE基因的功能研究[J];中华微生物学和免疫学杂志;2005年10期

5 孙小平;黄文祥;吴利先;;粪肠球菌基因hyl_1功能的实验研究[J];第三军医大学学报;2007年14期

6 狄婷婷;高原;;粪肠球菌主要毒力因子研究进展[J];中国病原生物学杂志;2012年03期

7 李春,张丹,张兰威,于维军;两株降胆固醇球菌生长条件的研究[J];现代食品科技;2005年04期

8 董明;;饥饿期粪肠球菌生物膜毒力因子明胶酶E表达研究[J];口腔生物医学;2013年02期

9 董明;王珊珊;王丽娜;牛卫东;;饥饿期粪肠球菌生物膜毒力因子明胶酶E表达研究[J];实用口腔医学杂志;2012年05期

10 武楠;颜向军;刘亚琴;邹礼衡;杨祚升;;粪肠球菌Ace重组蛋白的表达、纯化及黏附活性研究[J];微生物学杂志;2008年03期

中国重要会议论文全文数据库 前6条

1 刘红艳;韦曦;凌均h，

本文编号：574611