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长角血蜱细菌群落结构及多样性研究

发布时间:2017-08-07 22:14

  本文关键词:长角血蜱细菌群落结构及多样性研究


  更多相关文章: 长角血蜱 细菌群落结构 多样性 二代测序


【摘要】:目的了解长角血蜱细菌的群落结构及种群多样性。方法应用Illumina Miseq PE300二代测序技术测定长角血蜱细菌16S r DNA基因的V3~V4高变异区段序列,分析其细菌的群落结构、种群多样性、优势菌群以及常见病原菌的分布。结果获得用于分析的序列和OTU数目分别为1 070 624条和145 479个;香农多样性指数的稀疏曲线接近平台期,说明此次测序的深度合适,可充分代表长角血蜱细菌的实际种群结构。长角血蜱微生物优势菌群依次为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门和拟杆菌门,其中以γ-变形菌纲相对丰度最高。长角血蜱的"核心微生物群",聚集成2个"蜱簇",GⅠ和GⅡ簇分别有21和11个特有微生物群。发现菌群中存在大量致病菌和条件致病菌,但未检测到螺旋体和支原体。结论野外长角血蜱携带的微生物物种组成和丰度均表现了较大差异性。
【作者单位】: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室;感染性疾病诊治协同创新中心;首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所 新发突发传染病研究北京市重点实验室;
【关键词】长角血蜱 细菌群落结构 多样性 二代测序
【基金】:国家自然科学基金青年基金(81301402) 国家高技术研究发展计划(863计划)(2014AA021505)~~
【分类号】:R384.4
【正文快照】: 2感染性疾病诊治协同创新中心,浙江杭州310003;3首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所,新发突发传染病研究北京市重点实验室,北京100015蜱是一类可在脊椎动物(包括人类)体表寄生并吸血的节肢动物,吸血时释放毒素,严重威胁人类健康并给畜牧业造成严重的经济损失;同时,其从

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本文编号:636995

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