调控人骨桥蛋白的miRNA预测研究

发布时间：2017-09-01 22:35

本文关键词：调控人骨桥蛋白的miRNA预测研究

【摘要】：目的利用生物信息学方法预测调控人骨桥蛋白的微小RNA(miRNA),为进一步实验验证特定miRNA和人骨桥蛋白基因之间的关系提供依据。方法分别应用miRGen Targets和miRanda数据库确定与人骨桥蛋白有密切关系的miRNA分子。结果经miRGen Targets数据库预测出28个miRNA分子可能作用于人骨桥蛋白基因;miRanda数据库显示miR-539,miR-181,miR-340,miR-376c和miR-154 5个miRNAs在人骨桥蛋白的负调控过程可能发挥作用;将两个数据库结果交集后发现miR-539,miR-181,miR-33b和miR-377 4个miRNA分子最有可能参与调控人骨桥蛋白。结论利用生物信息学软件可对调控人骨桥蛋白的miRNA进行预测,为研究骨桥蛋白的功能和生物学特性提供新手段。
【作者单位】：包头医学院第一附属医院神经外科;
【关键词】： 微小RNA 骨桥蛋白 生物信息学 靶基因预测
【基金】：国家自然科学基金项目(81360164) 内蒙古自然科学基金项目(2014MS0806)
【分类号】：R3416
【正文快照】： 骨桥蛋白(osteopontin,OPN)是1985年Franzen和Heinegard[1]从小牛长骨分离出来的一种骨基质蛋白。OPN在人体组织细胞中分布广泛,特别是在骨的活跃沉积和矿化区,且不同阶段的成骨细胞均能合成和分泌OPN分子。OPN参与多种生理和病理过程[2]。OPN被认为是成骨细胞成熟分化的标志,

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