我国新疆首次检出西伯利亚型蜱传脑炎病毒

发布时间：2017-09-24 15:45

本文关键词：我国新疆首次检出西伯利亚型蜱传脑炎病毒

【摘要】：对新疆地区蜱传病毒类群进行调查,本研究利用Illumia深度测序技术对新疆全沟硬蜱体内的病毒小RNA分子进行筛查,从提取的蜱小RNA组份中共测得32 631条病毒特异性读序,77条读序与蜱传黄病毒基因组序列匹配,核苷酸数合计约占病毒基因组的3.8%~2.4%,其中32条读序与国内尚未发现的西伯利亚型蜱传脑炎病毒一致。为对上述结果进行确证,利用RT-PCR对此型病毒核酸进行检测,从蜱总RNA中分别扩增获得病毒包膜基因与基因组3′末端片段,测序比对表明上述片段序列与西伯利亚南部检出病毒高度近似,核苷酸与氨基酸似然率分别为97.2%~95.5%与99.4%~98.3%。综上所述,本研究利用基于深度测序的病毒筛查方法,首次从我国新疆蜱传脑炎疫源地检出西伯利亚型病毒,为下一步针对病毒的分离与流行病学调查提供了重要线索。
【作者单位】：新疆军区疾病预防控制中心;军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室;
【关键词】： 蜱传脑炎病毒 西伯利亚型 深度测序 小RNA 新疆
【基金】：国家自然基金项目(81171663,U1303104)资助
【分类号】：R373.3
【正文快照】： 蜱传脑炎病毒(Tick-borne encephalitis virus,TBEV)属于黄病毒科(Flaviviridae)黄病毒属(Flavivirus)中的蜱传群(Tick-borne complex),是亚欧大陆流行最为广泛的虫媒病毒。TBEV通过蜱叮咬感染人类,入侵中枢神经系统并引起脑炎等严重的人类疾病。病毒基因组为一条单股正链RNA

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1 杨佩英;黄志尚;;蜱传脑炎病毒分子生物学研究概况[J];国外医学(微生物学分册);1987年02期

2 徐葛林;抗蜱传脑炎病毒的两种单克隆抗体[J];国外医学.预防.诊断.治疗用生物制品分册;1987年04期

3 杨正时;;蜱传脑炎病毒传播的生态链[J];中国微生态学杂志;2012年01期

4 Mandl C.W. ,丁天兵;蜱传脑炎病毒作模型、黄病毒囊膜蛋白E抗原的分子结构[J];细胞与分子免疫学杂志;1989年04期

5 魏婧靖;康晓平;李裕昌;吴晓燕;张雨;杨银辉;;蜱传脑炎病毒对人单核细胞的致病性[J];微生物学报;2013年11期

6 侯宗柳,ＦｒａｎｚＸＨｅｉｎｚ,ＭｉｃｈｅａｌＥｃｋｅｒ,白登云,刘瑞璋,俞永新;蜱传脑炎病毒东北株E蛋白的核酸和氨基酸序列[J];病毒学报;1997年01期

7 ;[J];;年期

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1 刘全;扈荣良;;我国的蜱媒传染病[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第九次学术研讨会论文摘要集[C];2006年

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