BMP9调控间充质干细胞成骨分化的分子网络:生物信息学分析

发布时间：2017-10-02 00:25

  本文关键词：BMP9调控间充质干细胞成骨分化的分子网络:生物信息学分析

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【摘要】：目的探讨BMP9对间充质干细胞成骨分化的调控作用,通过系统的生物信息学分析研究BMP9诱导间充质干细胞成骨分化的分子调控网路。方法从GEO数据库获取在BMP9促进间充质干细胞成骨分化过程中表达上调或下调的基因。然后应用DAVID和GeneMANIA数据库分析这些基因与BMP9及相互之间的关系。结果通过DAVID数据库分析,这些上调或下调的基因被富集到不同的生物学过程的基因子集如"软骨发育"子集和"血管发育和骨骼系统发育"子集。这些基因也可以被富集到不同的信号通路如NOTCH和TGFbeta信号通路,其中MEF2C、DLX2、NOG、FGFR3、MSX1、KLF10、TIPARP、PTH1R、PTN和GAS1这10个基因被富集到"骨骼系统发育"这一子集。通过GeneMANIA数据库分析,建立了这10个基因和BMP9及一些预测的基因的分子网络图,显示这些基因存在直接或间接的相互作用。结论 BMP9在调控间充质干细胞成骨分化过程中与许多基因如MEF2C、DLX2、NOG、FGFR3、MSX1、KLF10、TIPARP、PTH1R、PTN和GAS1等存在相互作用,在研究BMP9调控间充质细胞成骨分化的分子调控机制时需要关注这些基因形成的调控网络。
【作者单位】： 山东医学高等专科学校;
【关键词】： BMP 间充质干细胞 成骨分化 生物信息学分析
【分类号】：R329.2
【正文快照】： 间充质干细胞(MSCs)是骨组织再生的重要细胞来源,当与一些生长因子协同作用时,可进一步促进间充质干细胞的成骨分化[1]。骨形态发生蛋白(BMPs)属于转化生长因子β(TGF-β)家族成员之一,其在胚胎发育、生长和组织分化中有着重要的作用。目前已经分离并鉴定20余种BMPs,其中BMP2

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