新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析
本文关键词:新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析
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【摘要】:目的:对新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因的进化和变异进行分析,为进一步研究致病性禽流感的致病机制和毒力因子奠定基础。方法:从IRD数据库中下载2013年2月19日至2013年10月31日的H7N9流感病毒PB1基因序列63条,运用MEGA 5.2.1软件进行序列分析,用邻接法构建基因进化树;通过氨基酸序列分析PB1基因95~367片段的PB1-F2蛋白氨基酸位点变化;应用Excel表格对氨基酸构成进行计算;运用Predictive Analytics Software(PASW)18.0软件对氨基酸构成改变进行统计分析。结果:63株甲型H7N9毒株中有17株毒株的PB1-F2蛋白在其氨基酸序列第25位后发生断裂。新型甲型H7N9的进化主要分为两个系别,系别Ⅰ主要由完整型PB1-F2蛋白毒株构成,系别Ⅱ主要由52aa截短型PB1-F2蛋白毒株构成。完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白各类氨基酸构成存在差异。结论:H7N9流感毒株中存在着截短型PB1-F2蛋白毒株,并且H7N9流感病毒毒株PB1-F2蛋白断裂位点均在25位氨基酸后,这将成为H7N9流感毒株进化过程中重要的特征。完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白氨基酸构成的差异对于甲型H7N9流感病毒致病性的影响有待进一步研究。
【作者单位】: 东南大学公共卫生学院;
【关键词】: 甲型HN流感病毒 截短型PB-F PB-F蛋白的变异 氨基酸构成
【基金】:国家自然科学基金资助项目(81273143)
【分类号】:R373;R3416
【正文快照】: 禽流感(Bird Flu或Avian Influenza)是禽流行性感冒的简称,它是由甲型流感病毒的一种亚型(也称禽流感病毒)引起的一种急性传染病,也能感染人类,被国际兽疫局定为甲类传染病,又称真性鸡瘟或欧洲鸡瘟。到目前为止,已报道[1-6]的可引起人类感染的禽流感病毒有H7N7、H9N2和H5N1。
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