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基于蛋白重复序列及线性B细胞表位预测筛选间日疟原虫特异性抗原肽

发布时间:2017-11-02 05:13

  本文关键词:基于蛋白重复序列及线性B细胞表位预测筛选间日疟原虫特异性抗原肽


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【摘要】:目的建立一种基于蛋白重复序列及线性B细胞表位预测筛选间日疟原虫(Plasmodium vivax,P.vivax)特异性抗原肽的方法。方法以PlasmoDB数据为基础,建立间日疟原虫蛋白序列数据库。编写重复序列查找软件,逐一检索16 aa多肽在全部蛋白序列中的重复次数,统计出重复较高者进行连续B细胞表位预测,优选具有间日疟原虫特异性的肽进行合成,偶联钥孔戚血蓝蛋白(Keyhole limpet hemocyanin,KLH)后免疫小鼠,并检测抗体滴度。结果通过软件分析间日疟原虫全部5 432个蛋白序列中的16肽的重复次数,利用BcePred网站预测其中重复较高的1 000个序列,获得22个候选肽,经聚类分析和相似性比较,优选到5个潜在特异性肽,人工合成并偶联KLH后免疫小鼠诱生的抗体滴度均超过1:9 000。结论建立了一种基于蛋白重复序列联合线性B细胞表位预测筛选间日疟原虫特异性抗原肽的方法,得到的5个肽均能诱导小鼠产生高滴度抗体。
【作者单位】: 蚌埠医学院病原生物学教研室;安徽省感染与免疫重点实验室;江苏省血吸虫病防治研究所、卫生部寄生虫病预防与控制技术重点实验室、江苏省寄生虫分子生物学重点实验室;
【关键词】间日疟原虫 疟疾 重复蛋白序列 抗原 表位
【基金】:国家重大科技专项(2012ZX10004-220) 安徽省高等学校省级自然科学研究重点项目(KJ2012A200) 蚌埠医学院科技发展基金重点项目(Bykf13A09)
【分类号】:R392
【正文快照】: 中国血吸虫病防治杂志2014年第26卷第3期ChinJSchisto Control2014,Vol.26,No.3寻找新的间日疟原虫靶抗原,是研究开发敏感、特异的间日疟快速诊断的技术的关键。当前应用广泛的恶性疟靶抗原PfHRP-2的蛋白序列中存在着丙氨酸-组氨酸-组氨酸-丙氨酸-丙氨酸-天冬氨酸(AH-HAAD)串

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本文编号:1130120

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