云南省大理地区HIV感染者丙型肝炎病毒基因分型研究

发布时间：2017-11-17 07:25

  本文关键词：云南省大理地区HIV感染者丙型肝炎病毒基因分型研究

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【摘要】：目的对大理地区HIV感染合并丙型肝炎患者进行丙型肝炎病毒(HCV)基因分型研究。方法采集患者血液,提取RNA,采用HCV特异性引物进行巢式RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,采用生物信息学软件进行序列分析。结果在大理州人民医院共采集疑似丙型肝炎病人血清13份,HCV核酸检测4份(24~27号)阳性。序列分析显示4株病毒之间核苷酸同源性在80.4%~95.8%之间;24号与1b型HCV核苷酸同源性在98.6%以上,而其他基因型病毒核苷酸同源性在90.2%以下;25、27号与3b型HCV核苷酸同源性在92.1%~98.6%之间,而与其他基因型核苷酸同源性均在87.4%以下;26号与3a型HCV核苷酸同源性在94.4%~94.9%之间,而与其他基因型病毒核苷酸同源性在84.6%以下。遗传进化分析显示25、27号病例为3bHCV感染,26号病例为3aHCV感染,24号为1bHCV感染。结论大理地区HIV感染人群中存在HCV基因1和基因3两个基因型,3a、3b和1b3个基因亚型HCV感染。
【作者单位】： 昆明医科大学病原生物学与免疫学系;大理州人民医院检验科;云南省畜牧兽医科学院 云南省热带亚热带动物病毒重点实验室;
【分类号】：R373.21
【正文快照】： 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是单股正链RNA病毒,属黄病毒科丙型肝炎病毒属。其RNA全长约9.4kb,基因组结构由341bp的5′非编码区(5′URT)、编码3 011个氨基酸的长开放读框和约27bp的3′非编码区(3′URT)组成。在病毒复制中,氨基端有3个蛋白(C、E1、E2/NS1),羧基端有4

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