霍乱弧菌基因表达分析中内参基因的选择

发布时间：2017-11-29 01:27

  本文关键词：霍乱弧菌基因表达分析中内参基因的选择

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【摘要】：目的确定不同实验条件下基因表达分析中的稳定内参基因。方法以霍乱弧菌O1群El Tor菌株为研究对象,利用qRT-PCR方法比较不同pH值(pH 8.0、pH 5.5)以及不同温度(37℃、30℃)等多种生理、外界环境模拟培养条件下,thyA、recA、rpoA、gyrB、16SrRNA以及VCA0862 6个候选内参基因的表达水平,利用geNorm软件评价其稳定性。结果不同培养条件下,6个候选内参基因表达水平存在差异。不同pH值条件下最佳基因是recA;不同温度条件下最佳基因是gyrB;不同pH值及温度综合评价时,最佳基因是recA。结论本研究评价和提出了细菌基因表达分析中内参基因筛选的重要性,不同实验条件下最稳定内参基因是不同的,针对不同条件下的基因转录定量分析,应分别对内参基因稳定性进行评价并选择最稳定基因。
【作者单位】： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【基金】：国家科技重大专项(No.2012ZX10004-215) 国家自然科学基金(No.30800987) 传染病预防控制国家重点实验室资助项目(No.2012SKLID203)~~
【分类号】：R378.3;R3416
【正文快照】： 基因表达的差异分析在生命科学研究领域中非 常重要。逆转录PCR定量分析(Quantitative re-verse transcription PCR,简称qRT-PCR)具有高灵敏度、高特异性、快速准确、高通量等优点,可作为基因表达分析的首选方法之一。然而很多因素能够影响基因表达的分析,如样本类型、实验处

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 王海燕;闫梅英;赵英伟;阚飙;;霍乱弧菌甘露醇PTS操纵子中mtlR为转录抑制基因[J];微生物学报;2007年03期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前6条

1 蔡文凯;胡金璐;李双双;单革;王高鸿;;辐射条件下微藻基因表达内参基因的选择[J];空间科学学报;2013年06期

2 魏毅东;陈玉;郭海萍;谢华安;张建福;王宗华;;水稻缺素胁迫下实时荧光定量RT-PCR的内参基因的选择[J];农业生物技术学报;2013年11期

3 张琳;韩吉昌;杨官品;朱葆华;潘克厚;;Association of triacylglyceride content and transcript abundance of genes involving in lipid synthesis of nitrogen deficient Phaeodactylum tricornutum[J];Chinese Journal of Oceanology and Limnology;2014年02期

4 梁未丽;陈保立;赵萌;周妍妍;阚飙;;霍乱弧菌甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因mtlD的克隆表达[J];疾病监测;2014年03期

5 Fernanda Wisnieski;Danielle Queiroz Calcagno;Mariana Ferreira Leal;Leonardo Caires dos Santos;Carolina de Oliveira Gigek;Elizabeth Suchi Chen;Thaís Brilhante Pontes;Paulo Pimentel Assump，

本文编号：1235723