腺病毒7型河南分离株全基因序列测定及重组分析

发布时间：2017-12-04 17:39

  本文关键词：腺病毒7型河南分离株全基因序列测定及重组分析

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【摘要】：目的了解腺病毒7型河南分离株(hAdV35/Henan/2010)全基因特征及与其他腺病毒之间的进化重组关系。方法设计39对全长引物,采用RT-PCR方法扩增河南分离株腺病毒全序列,用DNASTAR中的SeqMan拼接全序,运用BioEdit进行序列剪齐,运用Mega4.0分析基因组编码蛋白hexon、fiber、E4和penton区域氨基酸与核苷酸的同源性,并与其他腺病毒序列绘制进化树,运用Simplot软件进行序列重组分析。结果 hAdV35/Henan/2010基因组全长35 234bp,与其他腺病毒相比,基因组氨基酸和核苷酸同源性为68.0%~99.8%和46.5%~99.5%。不同编码区hexon、fiber、E4和penton的核苷酸同源性分别为72.4%~95.4%、74.1%~97.0%、55.7%~92.7%和69.9%~99.3%。进化树分析显示河南分离株与腺病毒7型疫苗株同属一支,与腺病毒3型进化分支最近,Bootsacn分析显示与B亚属腺病毒在多个区域发生重组,尤其与腺病毒3在hexon区域高度重组。结论 hAdV35/Henan/2010与B族腺病毒亲缘关系较近,与hAdV3在hexon区域存在重组。
【作者单位】： 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所;
【基金】：河南省医学科技重大攻关项目(No.132102310060)
【分类号】：R3411
【正文快照】： 人腺病毒(human adenovirus,hAdV)感染在全球范围内广泛流行,目前已知和新发现的人腺病毒共67种,分为A~F等6个亚属,其中7型腺病毒(hAdV7)属于B亚属[1]。hAdV7与人类呼吸道疾病密切相关,婴幼儿感染易导致严重的支气管炎和肺炎,甚至死亡。河南省疾病预防控制中心传染病预防控制

【共引文献】

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1 王s，

本文编号：1251813