人脂肪干细胞脂向分化中长非编码RNA的差异表达
本文关键词:人脂肪干细胞脂向分化中长非编码RNA的差异表达
更多相关文章: 腹内脂肪 间质干细胞 成脂分化 RNA 干细胞 脂肪干细胞 脂向分化 长链非编码RNA差异性表达 lncRNAs 生物信息学报告 qRT-PCR
【摘要】:背景:肥胖导致了包括高血压、冠心病、脂肪肝、高脂血症、2型糖尿病在内的诸多疾病,因此深入理解脂肪细胞分化机制对于肥胖的防治具有深远意义。目前对于脂向分化机制的研究多集中在微小RNA上,对于长非编码RNA在脂向分化过程中的作用尚且知之甚少。目的:获得脂向分化过程中差异倍数明显的长非编码RNA,并进一步筛选在脂向分化过程中可能发挥重要作用的长非编码RNA进行验证。方法:取人腹部皮下脂肪,采用组织块培养法获取脂肪干细胞,传至第3代后进行成脂诱导分化,通过微阵列技术对脂向分化过程中0,5,12 d长非编码RNA及mRNA差异性表达量进行统计,并结合生物信息学报告筛选出呈现明显差异性表达的长非编码RNA,通过qRT-PCR进行验证。结果与结论:脂向分化过程中以差异倍数1.5(P0.05)为标准,上调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 748个,12 d vs.0 d 847个,12 d vs.5 d 593个;下调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 828个,12 d vs.0 d 1 113个,12 d vs.5 d 750个;结合生物信息学分析结果,在与脂类代谢有关的28个长非编码RNA中根据诱导0,5,12 d差异表达倍数较高且其靶基因可能是已知的与成脂相关的基因中,筛选出3个长非编码RNA:AK304548、BP216319、DA852857。通过PCR验证结果显示AK304548、BP216319及其靶基因表达量呈现先下调后上调的趋势,与微阵列测序结果相符,预示其在脂向分化过程中起到调控作用。
【作者单位】: 广东医学院附属医院;
【基金】:广东医学院建博科技创新团队培育型立项资助(TD1123),课题名称:长链非编码RNA在人脂肪干细胞脂向分化过程中的差异性表达分析~~
【分类号】:R329
【正文快照】: 0引言Introduction肥胖已经成为亟待解决的世界性问题,作者试图通过微阵列芯片测序技术获得人脂肪间充质干细胞脂向分化过程中长非编码RNA(Long non-coding RNAs,lncRNAs)差异表达谱,筛选出在分化过程中可能发挥重要意义的lncRNAs进行进一步验证,初步建立lncRNAs的相关调控基
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