广西、云南、湖南三地钉螺亲缘关系的研究

发布时间：2018-05-11 20:04

  本文选题：钉螺 + 基因差异　； 参考：《广西医科大学》2005年硕士论文

【摘要】：目的:分析广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺的基因差异,揭示广西靖西钉螺与其它两地钉螺的亲缘关系,为探讨广西钉螺来源提供科学依据。 方法:采集广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺,分别提取钉螺基因组DNA,PCR 扩增线粒体DNA(mtDNA)的细胞色素C 氧化酶Ⅰ(COⅠ)和细胞色素b(Cytb)基因并测序。应用Pairwise Blast 软件比较序列的同源性。以Genebank 登录的光滑双脐螺Biomphalaria glabrata(NC_005439)mtDNA的COⅠ、Cytb 序列为种外参照,应用Clustal W(1.82)软件对钉螺COⅠ、Cytb基因序列进行排列比较。Kimura双参数法计算遗传距离。应用PHYLIP(2000)和MEGA(2.1)软件,用非加权组平均法(UPGMA)和最大简约法(MP)构建系统发生树。并且与Genebank 已知的钉螺COⅠ基因序列进行对照比较。同时收集广西、湖南和云南三地钉螺的分布情况、钉螺孳生地和古地理等资料,从流行病学、地理学的宏观角度与分子生物学的微观角度进行综合分析。 结果:三地钉螺COⅠ、Cytb 基因序列的比较结果和所构建的系统发生树显示:广西靖西与湖南岳阳钉螺COⅠ基因的同源性为94%,遗传距离为0.051;Cytb 基因的同源性为97%,遗传距离为0.031。广西靖西与云南洱源钉螺COⅠ基因的同源性为86%,遗传距离为0.158;Cytb 基因的同源性为76%,遗传距离为0.405。湖南岳阳与云南洱源钉螺COⅠ基因的同源性为87%,遗传距离为0.158;Cytb 基因的同源性为77%,遗传距离为0.391。上述结果说明两种基因序列比较及所构建的系统发生树结果一致,两种基因分别构建的系统发生树中广西靖西与湖南岳阳钉螺同属一个支系,其亲缘关系较近;而云南洱源钉螺单独形成另一支系,与广西靖西、湖南岳阳钉螺的亲缘关系都较远。三地钉螺COⅠ基因序列与Genebank 已知钉螺COⅠ基因序列的比较结果和所构建的系统发生树显示:广西靖西钉螺与湖南岳阳、湖北汉阳钉螺间的同源性为93%～94%,遗传距离为0.044～0.053;广西靖西钉螺与云南洱源、云南大理、四川绵竹钉螺间的同源性为85%～86%,遗传距离为0.148～0.151;湖南岳阳钉螺与云南洱源、云南大理间的同源性为84%～87%,遗传距离为0.153～0.155;云南洱源、云南大理钉螺与四川绵竹钉螺间的同源
[Abstract]:Objective: to analyze the genetic differences of Oncomelania hupensis in Jingxi, Eryuan and Yueyang in Guangxi, and to reveal the genetic relationship between Oncomelania hupensis in Jingxi, Yunnan and Yueyang in Hunan, so as to provide scientific basis for exploring the origin of Oncomelania hupensis in Guangxi. Methods: the cytochrome C oxidase 鈪，

本文编号：1875392