应用RNA干涉技术阻断EBV潜伏期基因LMP1表达的实验研究
本文选题:小发夹RNA + 潜伏膜蛋白基因1 ; 参考:《青岛大学》2006年硕士论文
【摘要】:目的 构建携带针对EBV潜伏膜蛋白基因LMP1的pSUPER.retro.neo gfp RNAi逆转录病毒载体,并筛选出稳定产毒的细胞克隆,探讨LMP1特异性沉默对EBV阳性细胞凋亡的影响。 方法 采用DNA重组技术将60nt能转录产生靶向LMP1小发夹RNA(small hairpin RNA, shRNA)的寡核苷酸序列定向克隆入逆转录病毒载体pSUPER.retro.neo gfp,并用限制性内切酶酶切鉴定以及测序鉴定;脂质体法将重组逆转录病毒载体转染包装细胞系PA317,G418筛选获得稳定产生逆转录病毒的细胞克隆;收集病毒上清,感染靶细胞Raji;采用RT-PCR检测靶基因LMP1的沉默效果,流式细胞术检测Raji细胞的凋亡。 结果 ①酶切鉴定及测序鉴定结果表明插入片段的序列和方向完全正确;② 重组载体转染包装细胞,可表达绿色荧光蛋白,经G418筛选,得到抗性细胞克隆;③RT-PCR结果表明pSUPER.retro.neo gfp RNAi逆转录病毒可有效抑制Raji细胞中LMP1的表达,流式细胞仪检测表明LMP1沉默可导致Raji细胞凋亡,同时用细胞凋亡诱导剂TGF-β1处理时更为明显。 结论 成功构建了特异性沉默EBV潜伏期基因LMP1的pSUPER retro RNAi逆转录病毒载体,并筛选出稳定产毒的细胞克隆,初步实验结果表明逆转录病毒载体介导的RNA干涉能有效沉默靶基因LMP1的表达,并能诱导LMP1阳性细胞Raji的凋亡,为深入探讨LMP1基因特异性沉默对EBV阳性肿瘤的治疗作用奠定了实验基础。
[Abstract]:Objective to construct the retroviral vector of pSUPER.retro.neo gfp RNAi carrying EBV latent membrane protein gene (LMP1) and to screen the stable virulent cell clones and to investigate the effect of LMP1 specific silencing on the apoptosis of EBV positive cells. Methods the oligonucleotide sequence of 60nt which could produce LMP1 small hairpin RNA(small hairpin RNA, shRNA) was cloned into the retroviral vector pSUPER.retro.neo gfp by DNA recombination technique and identified by restriction endonuclease digestion and sequencing. The recombinant retroviral vector was transfected into the packaging cell line PA317G418 by liposome method, and the stable retroviral clones were obtained. The virus supernatant was collected and infected with Raji. the silencing effect of target gene LMP1 was detected by RT-PCR. Apoptosis of Raji cells was detected by flow cytometry. Results 1 the results of restriction endonuclease digestion and sequencing showed that the sequence and direction of the inserted fragment were completely correct. The recombinant vector transfected packaging cells and expressed green fluorescent protein. After G418 screening, the resistant cell clones were obtained. 3RT-PCR results showed that pSUPER.retro.neo gfp RNAi retrovirus could effectively inhibit the expression of LMP1 in Raji cells. Flow cytometry showed that LMP1 silencing could induce apoptosis of Raji cells, especially when treated with TGF- 尾 1. Conclusion the pSUPER retro RNAi retrovirus vector which specifically silenced the LMP1 gene of EBV latency gene was successfully constructed, and the stable virulent cell clones were screened out. The preliminary results showed that RNA interference mediated by retroviral vector could effectively silence the expression of target gene LMP1 and induce the apoptosis of LMP1 positive cells Raji. It provides an experimental basis for the further study of the therapeutic effect of LMP1 gene specific silencing on EBV positive tumors.
【学位授予单位】:青岛大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:R346
【相似文献】
相关期刊论文 前10条
1 杨明夏,朱昌亮;RNA干涉及其在寄生虫学研究中的应用[J];中国寄生虫学与寄生虫病杂志;2002年06期
2 刘宁;;“RNA干扰”的功能调控机制[J];国外医学情报;2004年02期
3 袁成福;;RNA干扰及其实验方法[J];湖北民族学院学报(医学版);2005年04期
4 ;第四届全国RNA学术研讨会讯息[J];国际医药卫生导报;2005年02期
5 纪虹;孙开来;;小RNA的研究现状[J];国际遗传学杂志;2006年01期
6 陈柳青;曾学思;孙建方;;石蜡包埋皮肤组织标本中提取RNA进行逆转录PCR的研究[J];中国麻风皮肤病杂志;2006年01期
7 ;重组RNA的表达——tRNA支架的巧妙运用[J];生物医学工程研究;2007年03期
8 张义玲;魏旭斌;蔡荣;钱程;;抑制RNA沉默现象的机理及其在生物医学领域内的应用[J];生物化学与生物物理进展;2007年12期
9 赵轶卓;孙妙囡;孙德军;;牛胰脏RNA Ⅱ的制备[J];吉林大学学报(医学版);2007年06期
10 万春鹏;周寿然;左爱仁;;RNA干扰机制及其应用研究进展[J];现代生物医学进展;2008年02期
相关会议论文 前10条
1 王蕾;王秦虎;单卫星;;大豆疫霉菌小RNA通路核心组件的识别分析及突变体筛选[A];2010年中国菌物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
2 蒋锋;王传跃;陈晓岗;;RNA干扰技术及其应用[A];中国神经科学学会精神神经专业委员会成立大会暨第一届学术会议论文集[C];2004年
3 李艳;严明;;RNA干扰[A];第一届全国化学工程与生物化工年会论文摘要集(下)[C];2004年
4 宋尔卫;;RNA干扰疗法的开发应用:靶点选择和靶向导入[A];第四届全国RNA进展研讨会论文集[C];2005年
5 ;RNA-interference-based functional research on rat epididymis-specific gene 16 and human paternally expressed gene PEG10 and the therapeutic applications of RNA interference in HBV,SARS,liver cancer,liver fibrosis and keloid fibroblast[A];第四届全国RNA进展研讨会论文集[C];2005年
6 郭晓红;周忠孝;吴明煜;;RNA干涉的分子机制及技术研究进展[A];中国生理学会论文汇编2005年第一期[C];2005年
7 李涛;李前忠;;Prediction of RNA binding sites in proteins from sequence[A];第四届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2010年
8 Jian-Hua Yang;Liang-Hu Qu;;ChIPBase:decoding transcriptional regulation of long non-coding RNA and microRNA genes from ChIP-Seq data[A];生命的分子机器及其调控网络——2012年全国生物化学与分子生物学学术大会摘要集[C];2012年
9 戚益军;;植物小RNA和长非编码RNA[A];生命的分子机器及其调控网络——2012年全国生物化学与分子生物学学术大会摘要集[C];2012年
10 陈润生;;非编码RNA和RNA组学[A];第11届全国脂质与脂蛋白学术会议论文汇编[C];2012年
相关重要报纸文章 前10条
1 记者 冯卫东;研究人员发现可破坏肿瘤抑制基因的小RNA[N];科技日报;2009年
2 记者 储笑抒 通讯员 盛伟;人体微小RNA有望提前发出癌症预警[N];南京日报;2011年
3 泸州医学院副教授、科普作家 周志远;“大头儿子”与环状RNA[N];第一财经日报;2014年
4 麦迪信;小分子RNA可能有大作用[N];医药经济报;2003年
5 董映璧;美发现基因调控可回应“RNA世界”[N];科技日报;2006年
6 张忠霞;特制RNA轻推一下,就能“唤醒”基因[N];新华每日电讯;2007年
7 聂翠蓉;RNA:纵是配角也精彩[N];科技日报;2009年
8 冯卫东;RNA干扰机制首次在人体中获得证实[N];科技日报;2010年
9 冯卫东 王小龙;英在地球早期环境模拟条件下合成类RNA[N];科技日报;2009年
10 记者 常丽君;新技术让研究进入单细胞内RNA的世界[N];科技日报;2011年
相关博士学位论文 前10条
1 邬开朗;RNA干扰在抑制病毒基因表达与复制中的作用研究[D];武汉大学;2005年
2 王立坤;RNA-seq数据的处理与应用[D];吉林大学;2012年
3 高爱保;重金属诱导长江华溪蟹RNA差异显示及定量分析[D];山西大学;2011年
4 沈梅;RNA沉默抑制子的生化和结构研究[D];北京协和医学院;2009年
5 陈祖玉;水稻内源非编码小RNA的多样性[D];武汉大学;2005年
6 刘振栋;包含假结的RNA结构预测算法研究[D];山东大学;2014年
7 李振亚;人肝脏特异性表达的小RNA-miR-122表达调控机制与功能的研究[D];中国协和医科大学;2010年
8 吕欣;嵌合型重组HCV cDNA的构建及体外转录RNA的感染特性研究[D];第四军医大学;2005年
9 赵阳洋;对具有复杂结构的伪扭结RNA的组合分析[D];南开大学;2012年
10 林美娟;茶尺蠖小RNA病毒RNA依赖的RNA聚合酶功能研究及全长cDNA克隆构建[D];武汉大学;2009年
相关硕士学位论文 前10条
1 孙晓娜;针对HIV-1 vpr基因的RNA干扰作用研究[D];北京工业大学;2010年
2 樊梅娜;几种RNA沉默抑制蛋白的表达纯化及沉默抑制特性分析[D];山东农业大学;2012年
3 侯继业;RNA干扰技术用于流感病毒防治的探索研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2010年
4 林园园;乙型肝炎病毒RNA上La protein结合位点的缺失对其自身稳定性影响的实验研究[D];华中科技大学;2006年
5 周芳;家蚕细胞中RISC复合物结合小RNA的分离、鉴定与分析[D];浙江理工大学;2013年
6 黄守均;鸡的小RNA文库构建和非编码RNA的规模筛选[D];中国协和医科大学;2008年
7 陈志强;二甲亚砜通过作用于靶标RNA聚合酶提高转录活性[D];武汉大学;2005年
8 苏杨;LMW RNA分离方法改进及与人类胚胎发育相关miRNA的克隆表达[D];暨南大学;2007年
9 丁月芹;五种鼠基因组中4.5S RNA基因拷贝数的鉴定与分析[D];曲阜师范大学;2011年
10 刘中成;枣总RNA提取及mRNA差异显示技术体系的建立[D];河北农业大学;2005年
,本文编号:1926262
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/binglixuelunwen/1926262.html