结核分枝杆菌Rv1385的抗原表位预测分析

发布时间：2021-02-15 03:01

　　结核分枝杆菌生长缓慢,难以获得足量的天然蛋白抗原。而利用基因工程技术制备重组蛋白抗原,存在着表达量低、不易纯化,以及特异性较低等不利因素。随着生物信息技术的发展,研究者可根据生物信息学软件预测,选择合成优势抗原肽段,而不需克隆整个蛋白,具有简便、经济、特异性高等特点。因此,本研究应用生物信息学方法,预测结核分枝杆菌Rv1385蛋白的抗原表位并分析其优势表位,对了解Rv1385蛋白的免疫学特性及其与结核分枝杆菌致病的关系具有重要意义。首先,从NCBI数据库下载Rv1385的氨基酸序列,然后采用生物信息学软件PSIPRED Server预测蛋白质二级结构;BepiPred 1.0 Server和ABCpred预测该蛋白的B细胞抗原表位;BIMAS、SYFPEITHI及NetCTLpan 1.1 Server预测该蛋白的CTL表位;SYFPEITHI和NetMHCIIpan 3.2 Server预测该蛋白的Th细胞表位。最后综合分析预测结核分枝杆菌Rv1385的优势候选抗原表位。结果显示,Rv1385蛋白二级结构中,α螺旋占51.8%,β折叠占41.6%,无规卷曲占6.6%;共有4个B细胞抗... 

【文章来源】：生物信息学. 2019,17(03)

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 氨基酸序列
    1.2 Rv1385的二级结构预测
    1.3 Rv1385的B细胞抗原表位预测
    1.4 Rv1385的CTL抗原表位预测
    1.5 Rv1385的Th抗原表位预测
    1.6 Rv1385氨基酸序列的同源性预测
2 结果与分析
    2.1 Rv1385的二级结构
    2.2 Rv1385的B细胞抗原表位
    2.3 Rv1385的CTL表位
    2.4 Rv1385的Th表位
    2.5 Rv1385的氨基酸序列同源性分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]结核分枝杆菌pyrF基因的生物信息学分析[J]. 黄劲,王洁,牛雪可,邱文,赵亮,王梅竹,康颖倩,冯永红,秦莲花.  中国病原生物学杂志. 2019(02)
[2]翻译后修饰与结核分枝杆菌耐药调控网络[J]. 谢龙祥,党艺方,谢建平.  生物工程学报. 2018(08)
[3]结核分枝杆菌BfrB蛋白的生物信息学分析[J]. 袁秋露,付玉荣,伊正君.  中国病原生物学杂志. 2018(02)



本文编号：3034311