人工喷泉中一株军团菌的系统遗传学鉴定

发布时间：2021-12-24 11:21

　　目的检测喷泉水中的1株军团菌并进行分子生物学鉴定和系统发育分析。方法采集潍坊市一处人工喷泉水水样,用细菌基因组试剂盒提取水样中的总细菌基因组DNA,使用针对军团菌属16S rRNA基因片段的特异性引物PCR扩增军团菌属16S rRNA基因片段并测序,与从GenBank获得的另外41株军团菌的16S rRNA的基因序列进行对比分析,采用PAUP*4.0b10软件对16S rRNA基因片段序列数据矩阵进行最大简约法分析并绘制基因进化树。结果 PCR扩增喷泉水提取物中军团菌属特异性16S rRNA基因片段,片段碱基数654 bp。测序分析该菌株（命名为WF-B）的16S rRNA基因序列与Legionella beliardensis 16S rRNA基因序列的遗传距离较近,相似度达99.8%,在构建的最大简约进化树中该菌与L.beliardensis以自检值97%聚类为一枝。结论该喷泉水中检出的军团菌WF-B与L.beliardensis的亲缘关系较近,相关部门应加强监管力度,降低其感染风险。 

【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2019,14(05)北大核心CSCD

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
材料与方法
    1 样品的采集和DNA提取
    2 目的基因PCR 扩增测序
    3 序列分析
    4 系统发育分析
结 果
    1 16S rRNA基因PCR产物电泳鉴定
    2 基于16S rRNA基因的序列分析
    3 基于16S rRNA基因的系统发育分析
讨 论


【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3550394