可视化膜芯片技术用于结核分枝杆菌基因分型的研究

发布时间：2023-02-08 16:03

　　目的建立用于结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型的膜芯片技术,并评估其应用价值。方法根据结核分枝杆菌直接重复序列43间隔子设计特异的分型探针并制作膜芯片,通过直接重复序列特异引物扩增基因组间隔子相应区段的DNA。扩增引物用生物素标记,扩增标记后的产物与芯片的探针杂交,根据显色后产生的斑点确定标本的基因亚型。对175株临床分离菌株用该方法进行分型,用传统膜杂交法作对照。结果 H37Rv和BCG菌株DNA扩增产物与膜芯片杂交,43条探针均出现杂交斑点。用膜芯片技术杂交获得H37Rv和BCG菌株的基因亚型,与传统固相膜杂交结果一致。用该法对175株临床分离菌株进行分型,其中167株属于4个已知的基因家族,最大的一个为北京家族,占62.9%(110/175)。北京家族中有107株为典型北京家族(1-34间隔区缺失),3株为北京样基因型(Beijing-like),即非典型北京家族(35-43间隔区也有缺失)。T家族占30.9%(54/175),包括34株T1,14株T2,6株T3。2株Manu2和1株LAM9;未匹配8株,占4.6%(8/175)。膜芯片技术杂交结果与传统膜杂交结果完全相同,耗时由膜...

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【文章目录】：
材料与方法
    1 材料
        1.1 菌株来源
    2 方法
        2.1 DNA提取
        2.2 传统Spoligotyping分型
        2.3 可视化膜芯片技术的建立及应用
            2.3.1 膜芯片制备
            2.3.2 膜芯片检测
            2.3.3 灵敏度实验
        2.4 统计学处理
结 果
    1 标准菌株H37Rv和BCG的杂交
    2 临床MTB菌株膜杂交分型
    3 膜芯片技术与膜杂交结果一致性比较
    4 试验操作所需时间比较
    5 试验的灵敏度
讨 论



本文编号：3737968