龙岩市一起暴发性脑炎疫情分离的埃可病毒6型基因特征分析
发布时间:2017-06-15 10:04
本文关键词:龙岩市一起暴发性脑炎疫情分离的埃可病毒6型基因特征分析,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:对2010年福建省龙岩市长汀县埃可病毒6型(ECHO6)肠道病毒引起的暴发性脑炎,进行病原学分析,为该病的防控提供有价值的信息。对病例脑脊液标本进行荧光RT-PCR、病毒分离(RD细胞)、中和鉴定进行病原确认,再经PCR法对其中4株毒株进行VP1片段或全基因组核苷酸序列测定,用DNAStar软件中的MegAlign等软件进行同源性分析,Mega 4.0软件进行进化树分析。经病原学检测方法确认为ECHO6型肠道病毒,VP1片段核苷酸序列分析显示为C2亚型。全基因组序列共7 407个核苷酸,与其他ECHO病毒和CVB(Coxsackie virus B)病毒基因组构成相似,同源性为78.5%~87.3%。此次暴发性脑炎是由肠道病毒ECHO6C2亚型引起,病毒株全基因组序列长度与标准株(U16283)相近,同源性达80.4%。
【作者单位】: 龙岩市疾病预防控制中心;福建医科大学龙岩市疾病预防控制中心教学点;
【关键词】: 脑脊液 ECHO 肠道病毒 脑炎 RT-PCR 核苷酸序列
【分类号】:R373.31
【正文快照】: 人类肠道病毒(Human enteroviruses,HEVs)隶属小核糖核酸病毒(Ribonucleic acid,RNA)目小RNA病毒科肠道病毒属,是常见的病原体之一。2011年11月,国际病毒分类委员会(Intenationalcommitteeon taxonomy of viruses,ICTV)发表了最新的病毒分类第九次报告,将人类鼻病毒(Humanrhin
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本文编号:452104
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