人博卡病毒2基因组扩增及序列分析
本文关键词:人博卡病毒2基因组扩增及序列分析
【摘要】:为获得人博卡病毒2(Human bocavirus 2,HBoV2)基因组序列,以2010年HBoV2单阳粪便标本为材料,PCR方法扩增HBoV2基因组不同区域,经序列拼接后得到5444bp的全基因组序列(HBoV2-NC)。系统进化分析显示,HBoV2-NC与兰州株HBoV2亲缘关系最近;DINAMelt末端回文结构预测证实,HBoV2-NC 5′末端存在反向互补序列,具有典型的细小病毒末端的茎环样结构;接头法PCR扩增得到HBoV2-NC部分末端侧翼序列。
【作者单位】: 兰州大学第一医院;南京医科大学附属南京儿童医院;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部病毒病防治重点实验室;
【关键词】: 人博卡病毒 基因组扩增 进化分析
【分类号】:R373.9
【正文快照】: 人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)隶属细小病毒科博卡病毒属,无包膜的、具有二十面体结构的衣壳蛋白,基因组为单链、线型DNA[1-2]。HBoV目前划分为HBoV1-4型[1,3-5],全基因组序列最长的HBoV为HBoV1,长5 543bp。HBoV2是在腹泻标本中检出率较高的HBoV,检出率为9%~26%[4,6],然而
【共引文献】
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,本文编号:816757
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