全基因测序法分析肺炎克雷伯菌JM45株对喹诺酮类药物耐药基因

发布时间：2017-09-27 07:10

  本文关键词：全基因测序法分析肺炎克雷伯菌JM45株对喹诺酮类药物耐药基因

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【摘要】：目的分析泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株携带的喹诺酮类药物耐药基因,研究其对喹诺酮类药物的耐药机制。方法采用Roche454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),分析喹诺酮类耐药基因携带状况,再将gyrA与parC全长基因与其他6株肺炎克雷伯菌做分子进化分析。结果最终得到JM45株一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列;基因组(染色体)序列大小为5 273 812bp(GC含量65.8%),质粒1序列大小为317 156bp(GC含量53.0%),质粒2序列大小为12 209bp(GC含量55.3%);在基因组(染色体)序列中携带了gyrA基因(全基因组Feature ID:KPN_1614),parC基因(Feature ID:KPN_0743);与肺炎克雷伯菌喹诺酮类药物敏感株相比较,gyrA基因第83位密码子由TCC→ATC,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile),parC基因第80位密码子由AGC→ATC,翻译成氨基酸序列后丝氨酸(Ser)→异亮氨酸(Ile)。结论肺炎克雷伯菌JM45株喹诺酮类药物耐药是gyrA基因和parC基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变所致;gyrA与parC全长基因的分子进化分析提示JM45株与肺炎克雷伯菌HS11286关系最为接近(序列相同),与肺炎克雷伯菌342关系最远。
【作者单位】： 杭州市余杭区中医院检验科;宁波市第一医院检验科;浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室;
【关键词】： 肺炎克雷伯菌 泛耐药 全基因组测序 完成图 喹诺酮类
【基金】：国家“十一五”科技重大专项基金项目(2008ZX100-03-004) 杭州市科技计划引导基金资助项目(2012028)
【分类号】：R346
【正文快照】： 据卫生部全国细菌耐药监测网(MOHNARIN)的双年度监测报告(2009-2010年),肺炎克雷伯菌(KPN)的临床分离率仅次于大肠埃希菌而居第2位。产ESBLs已占48.9%,产ESBLs KPN对环丙沙星的耐药率已达30.8%。国内虽然已有多个喹诺酮类药物作用靶位细菌DNA回旋酶A亚单位编码基因(gyrA)和拓

【参考文献】

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本文编号：928300