幽门螺杆菌cag致病岛CagⅠ蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-10-01 10:04

  本文关键词：幽门螺杆菌cag致病岛CagⅠ蛋白的生物信息学分析

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【摘要】：目的用生物信息学分析方法对幽门螺杆菌(HP)cag致病岛中的CagⅠ蛋白进行综合分析,推断其结构和功能,并探索其在HP致病中的作用。方法用antherprot V5.0软件和网络数据库等分析预测其结构,BLAST程序搜索其同源序列;用PROSITE SCAN和Fingerprint服务器分析推测其潜在的功能。结果 CagⅠ蛋白有361个氨基酸残基,分子量(Mr)为39 370,理论等电点为5.56;N'端20个氨基酸残基为信号肽,有三段跨膜区,二级结构和三级结构中螺旋结构为主体(约80%);CagⅠ为稳定的疏水蛋白,保守性很强,有N-糖基化作用位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和豆蔻酰化作用位点;存在膜蛋白、菌毛蛋白、转运蛋白、ATP/GTP酶、转录调节因子、分泌系统蛋白等多个蛋白质标签。结论 CagⅠ蛋白定位于HP外膜,是Ⅳ型分泌系统重要组成蛋白质,在信号转导和物质转运过程中充当信使或载体,可能具有水解酶及ATP/GTP酶活性。
【作者单位】： 江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室;北京市中西医结合医院检验科;武汉塞力斯生物技术有限公司;
【关键词】： 幽门螺杆菌 cag致病岛 生物信息学 结构预测 功能分析
【基金】：国家自然科学基金项目(81271795) 2012年第十一批省级科技创新与成果转化(生命健康科技)专项基金(BL2012047) 2012年度高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)项目(20123227110008)
【分类号】：R378
【正文快照】： 有限公司,武汉430040)幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)在约58 000年前随着人类从东非迁往世界各地并与人类共同进化,越来越适应人体胃内环境[1]。HP已成为胃病的一个研究热点[2]。HP感染呈全球性分布,全球感染率超过50%[3],尽管近年来胃癌的发病率有所下降,但仍然是全球的

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 郭杨;方刚;;DNA疫苗研究进展[J];微生物学免疫学进展;2013年05期

2 暴艳敏;马桂兰;乔自林;于国伟;;顶复门原虫蛋白质棕榈酰化的研究进展[J];中国兽医科学;2013年09期

3 Filipa F Vale;Mónica Oleastro;;Overview of the phytomedicine approaches against Helicobacter pylori[J];World Journal of Gastroenterology;2014年19期

中国博士学位论文全文数据库 前2条

1 陈智浩;减毒沙门菌介导的基于甲病毒复制子载体的自杀基因系统的抗肿瘤效应研究[D];华中科技大学;2013年

2 谢立苹;幽门螺杆菌CagM、CagI蛋白的生物信息学分析[D];江苏大学;2012年

中国硕士学位论文全文数据库 前2条

1 刘佳文;TGEV S/M双基因减毒沙门氏菌核酸疫苗株初步构建研究[D];四川农业大学;2012年

2 韦葳;玉米ZmSTOMAGEN基因的克隆及表达特性分析[D];广西大学;2013年

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本文编号：952809