结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析

发布时间：2017-10-06 07:40

  本文关键词：结核分枝杆菌RD12区T细胞表位分布情况预测及分析

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【摘要】：目的预测并分析结核分枝杆菌(MTB)RD12区4个抗原的CD4+T和CD8+T细胞表位分布情况。方法在NCBI数据库上查询并获得各个抗原的氨基酸序列,用Blast分析其与MTB复合群及人类蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原CD8+T细胞表位的分布情况;利用NetMHC数据库预测并分析MTB的RD12区抗原的CD4+T细胞表位的分布情况。然后,综合CD4与CD8表位预测,筛选出优势表位肽段。结果通过预测与分析,初步筛选出MTB的RD12区4个抗原的CD8+T细胞候选表位16个;CD4+T细胞的强结合候选表位234个,弱结合候选表位505个,综合CD4与CD8表位预测并分析,最终筛选出13个优势表位肽段。结论预测出来的T细胞候选表位将为结核病的特异性诊断及新的抗结核多表位疫苗的研究奠定基础。
【作者单位】： 河南中医学院医学免疫学重点实验室;上海交通大学基础医学院免疫学与微生物学系;
【关键词】： 结核分枝杆菌 RD区 T细胞 表位分析
【基金】：“十二五”国家科技重大专项(2013ZX10003002-005) 国家自然基金项目(81271794) 上海市科委技术支撑项目(12441903300)~~
【分类号】：R392
【正文快照】： 结核病是目前危害全球人类健康的主要传染病之一,是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)所致的一种以呼吸道感染为主的慢性传染性疾病。据2012年WHO[1]报道,2011年全球估计有870万新增结核病患者,其中有13%共感染人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,H

【参考文献】

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本文编号：981564