INTS10基因遗传变异与乙肝病毒感染结局的关联研究
发布时间:2024-06-10 19:42
目的:1.探讨环境因素对乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)感染结局的影响。2.探讨INTS10基因遗传变异对HBV感染结局的影响。3.探讨INTS10基因遗传变异与环境因素之间的交互作用对HBV感染结局的影响。方法:采用病例-对照研究方法,收集乙肝相关肝癌者(Hepatocellular Carcinoma,HCC)、慢性乙肝病毒感染者(Chronic HBV infection,CH)和乙肝病毒自限性清除者(Hepatitis B Virus Spontaneous Recovery,SR)作为研究对象,设立两个比较组:CH vs.SR比较组和HCC vs.CH比较组。应用标签SNP结合既往GWAS研究结果的方法选择与HBV感染有潜在关联的INTS10基因遗传变异,系统分析遗传变异和环境因素(吸烟、饮酒、恶性肿瘤家族史)对HBV感染结局的影响。应用TaqMan-PCR技术进行基因型检测;采用?2检验比较环境因素和基因型在各组之间的分布差异;采用Logistic回归模型分析环境因素对HBV感染结局的影响;采用Logistic回归模型和随机森林模型分析遗传变异对H...
【文章页数】:74 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
本文编号:3991811
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【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1-1全球乙肝病毒感染的地区分布(2011-2016年)
1.1乙肝病毒感染的流行情况乙型肝炎病毒(HepatitisBVirus,HBV)属于嗜肝DNA病毒科,是目前已知的可以感染人类的最小的DNA病毒,基因组长仅约为3200bp,是引起急、慢性肝病的主要原因[1]。研究表明,HBV导致肝损伤和炎症发生的生物机制,是....
图1-2课题思探讨INTS10基因遗传变异对HBV感染结
HCC组(N=737)吸烟饮酒恶性肿瘤家族史设立两个比较组:问卷调查血样采DNA提取CH组(N=750)基因型检
图2-1TaqMan探针原理图
则考虑重新提取DNA。.5.3基因型检测实验利用研究对象的DNA样本进行基因型检测实验,本研究共纳入2237名研究,13个SNP,共计基因型检测样本量为29081个。实验的原理和操作如下:(1)基因型检测实验原理本研究应用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-....
图2-2基因型分布散点图
分析结果包括基因型分布散点图(图2-2)和各反应孔的扩增曲线图(图2-3)。如基因型分布散点图所示:蓝色散点为GG基因型;红色散点均为AA基因型;绿色散点均为AG基因型。对于软件不能提供自动分型结果的反应孔,可根据扩增曲线图判断,如图2-3所示,FAM曲线明显上....
本文编号:3991811
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