云南恶性疟病例疟原虫Pfhrp2基因序列多态性分析
本文关键词:云南恶性疟病例疟原虫Pfhrp2基因序列多态性分析
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【摘要】:目的分析云南省恶性疟病例疟原虫虫株的富组氨酸蛋白Ⅱ(Histidine-rich protein-2,HRPⅡ)基因(Pfhrp2)序列的多态性,为研究疟原虫抗原基因缺失奠定基础。方法搜集2012年8月-2015年9月云南省恶性疟现症病例的滤纸血样和相关信息,用PCR技术扩增血样中恶性疟原虫Pfhrp2基因exon2区并测序,测序成功序列与AY816237、AY816240、AY816301参比序列比对;用Mega 5.04分析Pfhrp2基因exon2区序列多态性,计算序列间保守位点、遗传距离等;根据氨基酸序列间遗传距离绘制聚类树状图。结果共收集云南省15个州(市)的恶性疟现症病例血样218份,病例感染来源地包括云南本地、非洲、缅甸等流行区。其中155份Pfhrp2基因exon2区扩增阳性和测序成功,编码氨基酸数在115~298之间,平均为239.7 aa,非洲(239.9 aa)、缅甸(239.5 aa)、云南(241.6 aa)感染虫株的氨基酸残基均数差异无统计学意义(F=0.025,P0.05)。所有氨基酸残基序列均以12型重复作为结尾,以1型、2型重复为起始,比例各占98.1%(152/155)和1.9%(3/155),2型重复次数最多,为12.9次。155条Pfhrp2基因exon2区DNA序列的同源位点为894 bp,保守位点占20.8%(186/894),变异位点占78.2%(699/894),非洲虫株序列间遗传距离为0.000~0.741,缅甸为0.000~0.948,云南为0.000~0.750。所有155条序列按氨基酸序列大小聚类成3个大类,同一个层级的序列具有近似的序列长度和氨基酸重复类型。结论云南省恶性疟现症病例所感染疟原虫的Pfhrp2基因exon2区存在高度多态性,恶性疟原虫株主要按Pfhrp2基因exon2区的氨基酸序列长度进行聚类。
【作者单位】: 云南省寄生虫病防治所、云南省疟疾研究中心、云南省虫媒传染病防控研究重点实验室;大理大学基础医学院;
【关键词】: 恶性疟 恶性疟原虫 富组氨酸蛋白Ⅱ Pfhrp基因 多态 云南省
【基金】:上海市2015年度“科技创新行动计划”国内合作项目(15495800400)
【分类号】:R531.3
【正文快照】: 截至2014年云南仍是中国尚未消除恶性疟的省份[1],亦是全国仅有本地感染病例的两个省份之一,2014年,该省的疟疾病例数仍占全国疟疾病例总数的17.3%(533/3078)[2-3],2015年该省疟疾病例数较上一年增加了22.5%。因此,在云南省继续落实媒介控制、传染源及时诊断及抗疟药敏感性监
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