亳州市手足口病流行特点及肠道病毒71型VP1基因特征分析

发布时间：2017-10-27 04:00

  本文关键词：亳州市手足口病流行特点及肠道病毒71型VP1基因特征分析

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【摘要】：手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)是由不同种肠道病毒引起的常见传染病,以婴幼儿发病为主。我国安徽省阜阳市2008年3月份开始流行的手足口病,经中国疾病预防控制中心(Chinese Center for Disease Control and Prevention,China CDC)检查确认主要病原体是EV71,2008年5月手足口病被卫生部按照丙类传染病进行管理。时隔多年手足口病发病形势依然严峻,亳州市作为当年较为严重的疫情地阜阳市的紧邻,该市手足口病病原体的流行情况及肠道病毒71型分子流行病学情况如何?本课题就拟对亳州市手足口病病原体情况以及该市肠道病毒71型分子分型和进化情况的进行研究,以满足临床诊治与流行病学研究需要,更有效的对HFMD进行实验室诊断与监测。目的:通过对2012年5月至2013年4月住院的疑似手足口病患儿的咽拭子提取病毒RNA的方法,应用实时荧光RT-PCR技术检测病原体类别,收集相关病历资料,并对EV71感染情况进行统计及应用聚合酶链反应技术与生物信息学方法对EV71VP1片段进行分析,研究该市手足口病流行病学特征、EV71感染者临床特点及EV71基因分型和分子进化情况,为HFMD的诊断治疗、预防监测提供可靠的科学依据结果:1、1175例疑似手足口病的住院患者的咽拭子标本中,男782例,女393例,共检出肠道病毒阳性患者562例。不同性别间肠道病毒感染差异无统计学意义(χ2=3.434,P=0.064),不同性别间EV71感染和非EV71非Cox-A16肠道病毒感染差异有统计学意义(χ2=4.765,P=0.029)。不同年龄组间感染肠道病毒的差异无统计学意义(χ2=1.603,P=0.449),但已感染肠道病毒者在不同年龄组间EV71感染和非EV71非Cox-A16肠道病毒感染差异有统计学意义(χ2=8.422,P=0.015)。在196例ev71感染病例中,男124例,女72例,男女比例为1.72:1,年龄范围为4个月~6岁,平均年龄1.8岁,其中0岁~1岁的患者96人,1岁~3岁的患者88人,3岁以上的患者12人,ev71感染病例以3岁以下儿童为主,占本次ev71感患者的93.9%;在6例cox-a16感染病例中,男5例,女1例,男女比例为5:1,年龄范围为1岁~4岁,平均年龄1.68岁,其中0岁~1岁的患者4人,2岁~3岁的患者1人,3岁以上的患者1人,cox-a16感染病例也以3岁以下儿童为主,占83.3%;360例非ev71非cox-a16肠道病毒感染者中,男260例,女100例,男女比例为2.6:1,年龄范围为1岁~9岁,平均年龄1.58岁,其中0岁~1岁的患者222人,2岁~3岁的患者123人,3岁以上的患者15人,非ev71非cox-a16肠道病毒病例也以3岁以下儿童为主,占95.8%。肠道病毒的感染在各月份的差异有统计学意义(χ2=72.324,p0.05),呈现以春夏季多发态势。在不同月份ev71和非ev71非cox-a16肠道病毒感染差异有统计学意义(χ2=42.992,p0.05)。196例ev71感染者的月份分布也以春夏季发病为主,4月份为高峰期。三型患者的发病年龄段分布差异型无统计学意义(χ2=1.038,p=0.904),不同临床分型ev71感染病例在各月份的分布差异无统计学意义(χ2=18.479,p=0.425)。2、6株来源于不同疾病程度的样本测序成功,6株ev71vp1基因间的核苷酸相似性为96.0%~99.7%,氨基酸相似性为94.6%~100%,来源不同疾病程度的ev71vp1基因未发现特异性核苷酸变异。在系统进化树上,存在多个传播链,均与c4a亚型代表株处于同一分支,核苷酸相似性为96.0%~98.6%,氨基酸相似性为98.0~99.6%。结论:1、2012年5月至2013年4月亳州市1175例疑似hfmd的患者咽拭子标本中共检出肠道病毒阳性患者562例,以非ev71非cox-a16型肠道病毒感染者为主。2、2012年5月至2013年4月亳州市手足口病肠道病毒感染在年龄段、别等人群分布特点上无统计学差异;肠道病毒核酸阳性人群不同种肠道病毒感染在性别与年龄上有统计学差异,不同性别和年龄段间易感非ev71非cox-a16肠道病毒感染者。3、2012年5月至2013年4月亳州市手足口病发病集中在4月份-6月份,呈现春夏季多发态势。非EV71非COX-A16型肠道病毒是研究期间的主要病原体。4、2012年5月至2013年4月间EV71是亳州市手足口病患者危、重症患者主要病原体。非EV71非COX-A16型肠道病毒和COX-A16型肠道病毒以普通型病例为主。5、2012年5月至2013年4月亳州市EV71流行株为C4a亚型,存在多个传播链,存在地区性差异,各毒株核苷酸与氨基酸变异相似,与周边省市的流行株为同一进化分支。6、2012年5月至2013年4月亳州市EV71感染者不同疾病分型的病毒核苷酸与氨基酸变异相似。
【关键词】：手足口病 流行病学 亳州市 肠道病毒71型 基因型
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R725.1
【目录】：

• 缩略语表7-8
• 摘要8-11
• Abstract11-15
• 前言15-19
• 第一部分 手足.病病原体检测及流行病学特征分析19-31
• 引言19
• 1 材料与方法19-24
• 1.1 材料19-21
• 1.1.1 样本来源19-20
• 1.1.2 诊断标准20
• 1.1.3 样本的采集和处理20-21
• 1.1.4 试剂使用21
• 1.1.5 仪器与耗材21
• 1.2 方法21-24
• 1.2.1 核酸提取21-22
• 1.2.2 荧光定量RT-PCR检测样本22-23
• 1.2.3 结果判读23-24
• 1.2.4 质量控制24
• 1.2.5 统计学处理24
• 2 结果24-28
• 3 讨论28-29
• 4 结论29-31
• 第二部分EV71 VP1区核酸检测及基因序列分析31-43
• 引言31
• 1 材料与方法31-35
• 1.1 材料31-33
• 1.1.1 标本来源31
• 1.1.2 标本选取和保存31
• 1.1.3 试剂使用31-32
• 1.1.4 仪器与耗材32-33
• 1.2 方法33-35
• 1.2.1 病毒RNA的提取33
• 1.2.2 EV71 VP1区引物设计33-34
• 1.2.3 VP1区RT-PCR34
• 1.2.4 扩增产物电泳检测与序列测定34-35
• 1.2.5 核苷酸序列拼接与比对分析35
• 1.2.6 EV71VP1同源性分析与系统进化树的构建35
• 2 结果35-40
• 2.1 亳州市EV71流行株VP1区PCR扩增产物琼脂糖电泳35-36
• 2.2 亳州市EV71流行株核苷酸测序与比对分型结果36-37
• 2.3 EV71流行株与其他EV71毒株的核苷酸与氨基酸同源性与相似性分析37-39
• 2.4 亳州市EV71流行株与其他EV71毒株核苷酸系统进化树分析 .. 3339-40
• 3 讨论40-42
• 4 结论42-43
• 参考文献43-48
• 本人简历48
• 硕士在读期间发表的论文目录48-49
• 致谢49-50
• 综述50-56
• 参考文献54-56

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前5条

1 陈贤丰;邓列华;;广州天河区手足口病流行病学和临床上的某些特点[J];暨南大学学报(自然科学与医学版);1990年04期

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本文编号：1101793