急性白血病儿童丝氨酸羟甲基转移酶1基因多态性及临床研究

发布时间：2018-11-11 20:59

【摘要】：目的通过检测中国深圳地区汉族儿童丝氨酸羟甲基转移酶1(serinehydroxymethyltransferase1，SHMT1)基因蛋白编码区（coding sequence，CDS）和3'-非翻译区(untranslated region，，UTR)的单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism，SNP)，了解其基因型及等位基因频率分布，分析其与儿童急性白血病（acute leukemia，AL）发病风险及急性淋巴细胞白血病（acute lymphocytic leukemia，ALL）儿童大剂量甲氨蝶呤（high-dose methotrexate，HD-MTX）化疗毒副作用的关系。方法从外周静脉血提取信使核糖核酸（messenger ribonucleic acid，mRNA），经逆转录制备反向转录脱氧核糖核酸（complementarydeoxyribonucleic acid，cDNA）。用聚合酶链反应(polymerase chainreaction，PCR)结合变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gelelectrophoresis，DGGE)及DNA测序的方法检测110例AL及120例健康儿童SHMT1基因CDS和3'-UTR的多态性，并用χ2检验、风险度比值（odds ratio，OR）、95%可信区间（confidence intervals，CI）分析其与AL发病风险的关系。以其中51例诊断ALL接受GZ-2002-ALL或GD-2008-ALL标准方案HD-MTX化疗患儿为研究对象（HD-MTX治疗组），回顾性分析HD-MTX治疗后产生的毒副反应，在此基础上应再用上述统计学方法研究其与SHMT1基因多态性基因型及等位基因频率分布的相关性。结果 1)筛查AL组、对照组儿童SHMT1基因多态性发现四个已知SNP位点，一个突变位点位于蛋白CDS即rs1979277(CT)，其他三个突变位点位于3'-UTR，即rs3783(CG)、rs1979276(CT)和rs12952556(AG)。而且此四个位点具有相同的基因型分布状态，任意两者间的连锁不平衡系数均为D'=1和r2=1。因此本实验以rs1979277(CT)多态性为代表进行相关性分析。 2) AL组与对照组儿童中rs1979277(CT)位点CC、CT及TT基因型频率分别为：80.9%(89/110)与87.5%(105/120)，17.3%(19/110)与10.8%(13/120)，1.8%(2/110)与1.7%(2/120)；相应的等位基因频率分别是10.5%与7.1%。两组中基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义。 3)其中，接受HD-MTX化疗患儿，SHMT1rs1979277(CT)位点CC、CT及TT基因型频率分别为：86.2%(44/51)，11.8%(6/51)，2.0%(1/51)。其化疗产生的严重毒副反应主要表现为中性粒细胞减少和肝功能损害。rs1979277(CT)多态性与中性粒细胞减少的发生风险无关（P0.05），但CT及TT基因型可以降低肝功能损害的发生风险(CT：OR=0.129，95%CI=0.020-0.817， P=0.03； TT： OR=0.103，95%CI=0.017-0.620，P=0.013)。 4）本研究中，深圳地区汉族儿童与荷兰、美国、西班牙、波兰、印度、英国等地区人群SHMT1rs1979277(CT)多态性存在显著差异性（P0.01），与中国北方汉族人群该基因型频率分布无差异（P0.05），但其等位基因频率存在差异（P0.05）。 5）本研究未发现GenBank数据库中已记录或尚未记录的其他多态性位点。结论 1）中国深圳地区汉族儿童SHMT1存在4个已知突变，即rs1979277(CT)、rs3783(CG)、rs1979276(CT)和rs12952556(AG)，且它们之间可能呈完全连锁不平衡。 2）上述四个多态性位点联合作用可能与AL发病风险无关。 3）上述四个多态性位点联合作用可能与HD-MTX化疗后中性粒细胞减少无关（P0.05），但对肝功能具有保护作用（P0.05），它们中一个或几个位点可能降低HD-MTX化后肝功能损害的发生风险。 4）SHMT1rs1979277(CT)多态性具有种族及地域差异性。
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【学位授予单位】：重庆医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R733.71

【参考文献】