基因芯片比较基因组杂交技术检测Dandy-Walker综合症染色体异常的研究

发布时间：2020-05-09 08:42

【摘要】： 目的 Dandy-walker综合症(DWS)是一类先天性神经系统发育异常的疾病,是由于小脑发育畸形和第四脑室中侧孔闭锁,引起第四脑室囊性扩大和继发梗阻性脑积水,预后不良。目前,由于尚未发现DWS与某特定基因具有决定性的联系,很多DWS与染色体异常有关的报道,几乎涵盖了人类全部染色体。因此,产前诊断时对DWS病例进行分子遗传学及细胞遗传学检验尤为重要。现在大部分医学研究机构对DWS的遗传学检测手段主要为染色体核型分析,荧光原位杂交等方法,发现部分病例有染色体的三体,部分三体,部分缺失等染色体异常。本研究是在染色体核型分析,荧光原位杂交及多色荧光原位杂交技术等基础上,对DWS病例进行DNA提取,采用最新的基因芯片比较基因组杂交技术,诣在寻找更小片段的不平衡染色体异常及特定基因片段的丢失以期发现与其相关的致病基因,同时探讨简便、准确的产前诊断手段。方法 1、细胞培养,并用秋水仙素阻断有丝分裂,进行核型分析外周血取加入长氏培养液,37℃温箱中孵育二天,加秋水仙素,后孵育1天。收取细胞,甲醇-冰醋酸固定液固定,滴片,干燥24小时后G-显带,核型分析。 2、荧光原位杂交将外周血加入细胞裂解液,37℃水浴锅中20分钟,甲醇-冰醋酸固定液固定,滴片,干燥后加入探针,放入杂交炉内杂交。 3、基因芯片比较基因组杂交苯酚法提取外周血,或羊水或死胎组织中DNA,用数字声裂仪(用1.0档)裂解与病人相同性别的WT DNA及病人DNA。病人的基因用Cy3标记。WTDNA用Cy5标记。将样品放入PCR仪中10分钟(98℃)使其变性。在冰水中冷去1分钟,加入Klenow反应混合物。放入PCR仪中37℃孵化2小时,加入10.5M EDTA结束Klenow反应,将每个样本置于暗室中10分钟,最大转数离心10分钟,用冰冻的80%酒精冲洗平板,最大速离心2分钟。再用20ul HPLC水再次脱水干燥平板。轻轻拍打使其重新悬起,测量。将13病人的与WT样本混合在一起,在95℃下5分钟使之变性后加样到Nim385 VI基因芯片上后加上Maui SL盖。将密封的芯片放入Maui杂交装置中42℃孵化,运用B程序(前后混合程序)16到20小时杂交。后洗片,扫描,采用Nimblescan v2进行数据分析。结果在24例染色体分析中,核型为46,XX 12例,46,XY 7例,检出染色体异常5例,其中9例基因芯片检测中,未发现染色体微缺失及微扩增病例。其中两例羊水标本存在染色体非整倍体异常：一例13三体(47,XX,+13),一例47,XXX；一例死胎组织标本为三倍体：69,XXX；一例MVA综合症病例；及一例复杂染色体3,4,6,8,9平衡易位(46,XY,t(3,4,6,8,9))。结论我们的24例Dandy-Walker综合症患儿中发现了5例具有染色体异常,约占患儿的20.83%,实验表明1.部分DWS由染色体数目异常引起；2.DWS并非由特定基因片段拷贝数异常所致；3.Array-CGH可快速,精确的对基因拷贝数异常导致的先天畸形做出诊断,是可靠准确先进的最新检测技术,可以为更好地产前诊断胎儿染色体异常提供了一个有益的手段。
【图文】：

碱基序列,比较基因组杂交,基因芯片,技术

加入10ulTE溶解DNA{用Nano一drop测DNA浓度4、基因芯片比较基因组杂交(Array一CGH)腼ay一CGH技术是将病人DNA与对照DNA(购买的商品正常男性或女性全基因组DNA)分别标记为红色荧光与蓝色荧光，等量杂交在DNA芯片上以取代原来的分裂中期的染色体，如果病人的DNA拷贝数增多，则红色荧光较多;如果病人DNA拷贝数减少，则蓝色荧光较多(见图llz]);后运用软件分析，比较病人DNA与对照DNA，描绘线性图，可直观的分析出基因片段的丢失或扩增(见图2)。采用高密度的基因芯片一比较基因组杂交技术可以发现细微到50一100kb的碱基序列，，而一般致病基因多在lookb左右，是目前最为精准的基因诊断技术。

碱基序列,结果分析,比较基因组杂交,基因芯片

果病人DNA拷贝数减少，则蓝色荧光较多(见图llz]);后运用软件分析，比较病人DNA与对照DNA，描绘线性图，可直观的分析出基因片段的丢失或扩增(见图2)。采用高密度的基因芯片一比较基因组杂交技术可以发现细微到50一100kb的碱基序列，而一般致病基因多在lookb左右，是目前最为精准的基因诊断技术。图1，基因芯片一比较基因组杂交技术(Array一CGH)
【学位授予单位】：中国医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2010
【分类号】：R748

【共引文献】