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天津地区先天性巨结肠RET基因13号外显子基因多态性研究

发布时间:2020-06-11 04:12
【摘要】: 目的:先天性巨结肠(Hirschsprung's Disease,HSCR)是小儿常见的先天性消化道疾病,以消化道神经节细胞缺失为主要特征。目前的研究显示多种基因与其发病有关,其中RET原癌基因(RET proto-oncogen)是最主要的基因。RET基因多态性和单倍型,包含疾病相关的突变,可能作为基因修饰因子存在,并且可能增加神经嵴胚细胞发育过程中发生紊乱的危险性。基因多态性在正常人群中相对常见,在基因突变较少的高外显率疾病中可增加普通人群患病的危险性。本实验研究天津地区先天性巨结肠RET基因13号外显子基因表达情况,探讨其与HSCR发病的关系。 资料和方法:收集2003年5月至2007年8月在天津市儿童医院外科诊治的HSCR患儿的静脉全血标本73例,其中男59例,女14例,长段型13例,短段型60例,年龄24天—8岁,均为散发,无家族性HSCR遗传病史。所有患者均经术后病理证实为HSCR。收集10例与胃肠道疾病无关的患儿静脉全血标本作为对照组。术前抽取研究样本静脉全血2ml用盐析法提取血样本基因组DNA,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增RET基因13号外显子,应用直接测序方法分析13号外显子的基因多态性改变,比较基因多态性位点等位基因频率在两组中的差异。 结果:RET基因13号外显子存在T769G单核苷酸多态性(Single nucleotidepolymorphisms,SNP)改变,等位基因G较等位基因T的频数高,T769G等位基因的频率在HSCR组中为G89.0%,T11.0%;在对照组中为G50.0%,T50.0%。两组的等位基因频率差异有统计学意义(χ~2=17.449,P<0.001)。HSCR组中两种临床表型的等位基因频数之间比较无显著差异(χ~2=0.837,P>0.05)。 结论:RET基因13号外显子T769G位点基因多态性改变与HSCR的发生密切相关,且存在种族差异,等位基因频率与HSCR的临床表型不相关。
【图文】:

DNA电泳,紫外图像,中观,凝胶


(4.)照相和图象分析将凝胶移入紫外图像成像仪中观察,是否有荧光条带出现,,进而可以移入凝胶成像仪中进行照相和图象分析(见图1)。图1提取的静脉血标本DNA电泳图3)目的基因体外扩增聚合酶链式反应(PCR)

电泳图,号外,电泳图,基因


图3RET基因13号外显子PCR产物电泳图序产物送上海生工生物工程有限公司,进行纯化,双向测序IpRIsM3730,测序试剂为BigDyeterminatorv3,l。分析Chromas软件分析直接测序结果,结合测序图判断测序结况下,除了开始约10至30个碱基,在650bp以内可以达到,但仪器及软件有时也会发生错读或漏读碱基的情况,此么碱基。所以,一般只有进行正反链同时测序,在两个序,才能确保所得序列100%可靠),必要时送另一公司(大重复测序,以避免测序公司系统误差。
【学位授予单位】:天津医科大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2009
【分类号】:R726.5

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本文编号:2707353

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