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南京地区2010~2011急性呼吸道感染患儿的病毒病原学研究

发布时间:2020-07-14 06:29
【摘要】:实验目的: 对2010-2011南京地区急性呼吸道感染患儿的鼻咽抽吸物及咽拭子进行13种常见呼吸道感染相关病毒的检测,了解该地区儿童急性呼吸道感染相关病毒的分子流行病学特点;对湖南22例以高热、喘憋为主要症状,抗生素治疗无效的重症肺炎患儿进行病毒病原学检测,探讨其潜在的病因。 研究对象及方法: 1.收集2010年8月至2011年7月在南京儿童医院因急性呼吸道感染就诊的住院患儿鼻咽抽吸物(NPA)381份及门诊患儿咽拭子(NPS)263份,共644份。门诊患儿于就诊当天,住院患儿在住院当日或次日采集标本。 2.采集的NPA及NPS保存在病毒运输液中(含200U/ml青霉素,200U/ml链霉素,200U/ml两性霉素B及0.125%BSA),低温运送至中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所并冻存于-80℃低温冰箱。 3.采用巢氏聚合酶链反应(nested-PCR)对腺病毒(ADV)、博卡病毒(HBoV)及副流感病毒1、2和4(PIV1、2、4)进行筛查,采用普通逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对其余呼吸道病毒进行检测,其中包括呼吸道合胞病毒(RSV),鼻病毒(HRV),流感病毒A、B(IFVA-B),副流感病毒3(PIV3),人偏肺病毒(HMPV),冠状病毒HKU1及NL63(HCoV-HKU1、HCoV-NL63)。 4.对22份湖南特殊标本分别进行ADV, HBoV, RSV, HMPV, HRV, PIV1,PIV3,IFVA, IFVB,NL63和HKU1的分子检测,对其中2例ADV7阳性标本进行全基因组序列测定。 结果: 1.通过巢氏PCR对644份标本分别进行PIV1、PIV2、PIV4的筛查,分别检出PIV142份(42/644,6.52%),PIV29份(9/644,1.40%),PIV438份(38/644,5.90%);PIV1和PIV2检出率明显高于同实验室南京地区一年及兰州地区四年检出率(均为0)。 2.采用巢氏PCR对ADV进行筛查及hexon分型,644例标本中共检出ADV阳性扩增产物171份,检出率为26.55%。分型结果显示:3型120例(70.18%,120/171),7型16例(9.36%,16/171),1型12例(7.02%,12/171),2型10例(5.85%,10/171),5型6例(3.51%,6/171),6型3例(1.75%,3/171),57型3例(1.75%,3/171),41型1例(0.58%,1/171)。ADV呈全年散发,其发病高峰主要在4-7月。以7岁以内儿童多见(96.49%)。171例ADV感染患儿中有99例(57.89%)存在混合感染,其中以RSV、HRV多见。 3.本研究中病毒总检出率为75.62%(487/644)。RSV检出率最高,为27.17%(175/644),其次分别为ADV26.55%(171/644),HRV15.68%(101/644),PIV313.51%(87/644),HBoV6.68%(43/644),PIV16.52%(42/644),PIV45.90%(38/644),HMPV4.97%(32/644),IFVB2.95%(19/644),NL631.86%(12/644),PIV2及HKU1均为1.40%(9/644),IFVA1.24%(8/644)。487例呼吸道病毒阳性患儿中,男童352例,女童135例,男女病毒检出率差异无统计学意义(χ2=3.595,P=0.058)。487例阳性患儿中,年龄最小为0.004月,最大为151月,中位年龄为9月,平均年龄为18.3月。3岁以下患儿病毒检出率(78.24%)高于3岁以上患儿(64.17%),差异有统计学意义(χ2=10.496,P=0.001)。 4.湖南22份特殊呼吸道标本中,19份检出ADV,其中3型1份,1型1份,余17份均为7型。其他病毒检出结果:RSV7份,PIV33份,HRV2份,HBoV4份,HKU11份,PIV12份,HMPV、IFVA、IFVB及NL63均未检出。对编号为h5和h6的2份只有ADV7型感染的标本进行全基因组序列测定,结果与Genbank中已知ADV7型全基因组序列比对及系统进化分析,与7型同源性为99%,亲缘性最近。 结论: 1.2010-2011年南京地区急性呼吸道感染患儿标本病毒检出率为75.62%,提示病毒病原是该地区呼吸道感染的主要致病病原,其中RSV, ADV和HRV是该年度儿童呼吸道感染中居前三位被检出的病毒病原。 2.ADV的检出在本年度居第二位,其感染全年均有发生,本年度的优势流行株为3型,且检测到3株最近新发现的型别57型,提示我们要继续加强对该病毒的流行监测。 3.与以往同实验室南京和兰州的研究结果相比,本研究首次运用巢氏PCR检出了PIV1,PIV2和PIV4,检出率分别为6.52%,1.40%和5.90%,表明PIV亦是儿童呼吸道感染中的重要病毒病原。 4.腺病毒7型是导致湖南以高热、喘憋为主,经抗生素治疗无效的重症肺炎患儿的致病病原,全基因组序列的测定和分析表明其与JN860677、AY601634两株7型毒株的亲缘性最近。
【学位授予单位】:兰州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:R725.6

【参考文献】

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本文编号:2754626

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