新生儿TLR4基因多态性与G-菌感染的相关性

发布时间：2020-10-17 11:50

　　 目的筛查新生儿TLR4基因的多态性位点(SNP),并进一步检测SNP与新生儿G-菌感染的相关性。 方法取上海地区出生的汉族新生儿外周血0.5 ml,依次进行DNA提取、聚合酶链反应(PCR)和基因测序检测SNP位点；组与组之间的连续性变量比较应用方差分析,计数资料采用卡方检验。 结果共检测上海地区出生的465例汉族新生儿,包括早产儿205例(26～32周早产儿133例,33～36周早产儿172例)和足月儿160例；其中G-菌感染186例,非感染279例；极低出生体重儿68例,低出生体重儿274例,小于胎龄儿96例。 1、TLR4常见的SNP位点集中在启动子部位6个位点,包括T-1418C、A-1837G、G-1892A、-2242C、A-2381G、A-2415G,未发现在欧美人群比较常见的编码区SNP位点。 2、465例新生儿均进行了上述6个SNP位点的检测,其中345例新生儿具有上述一个或多个SNP位点(SNP组),120例没有发现上述SNP位点(非SNP组)： (1)SNP与G-菌感染：早产儿中,SNP组G-菌感染率为41.8%(94／225),非SNP组为25%(20／80),两组之间差异有显著性意义(P=0.008,OR=2.153),足月儿两组之间差异无显著性意义；低出生体重儿中,SNP组G-菌感染率为45.8%(93/203),非SNP组为23.9%(17／71),两组之间差异有显著性意义(P=0.001,OR=2.686),而足月儿以及BW2500g的新生儿,SNP组和非SNP组之间差异无显著性意义。465例不同胎龄的新生儿,A-2381G的A／A基因型组,G-菌感染率为33.7%(56／166),而非A／A基因型组感染率为43.4%(130／299),两组之间差异有显著性意义(P=0.040,OR=0.662)；根据胎龄不同分层检验：GA33w的新生儿,A-2381G的A/A基因型组感染率为41.3%(19／46),而非A／A基因型组感染率为59.8%(52／87),两组之间差异有显著性意义(P=0.042)；胎龄33-36w早产儿,A-1837G的A／A基因型组感染率为15.6%(10／64),而非A/A基因型组感染率为30.6%(33／108),两组差异有显著性意义(P=0.029),足月儿人群中没有发现启动子各SNP位点与G-菌感染存在相关性；根据出生体重不同进行分层检验：出生体重1500g的新生儿,T-1418C的T／T基因型组感染率为61%(25/41),而非T／T基因型组感染率为85.2%(23／27),两组之间差异有显著性意义(P=0.032,OR=0.272；A-1837G的G／G基因型组感染率为100%(10／10),而非G／G基因型组感染率为65.5%(38／58),两组之间差异有显著性意义(P=0.027,OR=1.526)；A-2415G的G／G基因型组感染率为100%(12／12),而非G／G基因型组感染率为64.2%(36／56),两组差异有显著性意义(P=0.014,OR=1.556)；BW：1500～2500g的新生儿,A-1837G的A/A基因型组感染率为18.8%(13／69),而非A／A基因型组感染率35.8%(49／137),两组差异有显著性意义(P=0.012,OR=0.417)；T-2242C的T／T基因型组感染率为20.5%(15／73),而非T／T基因型组感染率为35.3%(47／133),两组差异有显著性意义(P=0.027,OR=0.473)；A-2381G的A／A基因型组感染率为18.4%(14／76),而非A／A基因型组感染率为36.9%(48／130),两组有差异有显著性意义(P=0.005,OR=0.386)；A-2415G的A／A基因型组感染率为20.3%(15／74),而非A/A基因型组感染率为35.6%(47／132),两组差异有显著性意义(P=0.021,OR=0.460)；对于BW2500g的新生儿,没有发现TLR4启动子部位各SNP位点与G-菌感染存在相关性。 (2)SNP与早产的相关性：启动子部位常见的6种SNP位点不同基因型组早产率无统计学差异(P0.1)。 (3)SNP与出生体重的相关性：T-2242C的C／C基因型组极低出生体重儿的发生率为18.8%(15／80),低出生体重儿的发生率为73.8%(59/80),而其他基因型极低出生体重儿的发生率为13.8%(53／385),低出生体重的发生率为55.8%(215／385),R×C表卡方检验P=0.012。C／C基因型组体重为2170.3±722.2g；非C／C基因型组体重为2402.7±822.6g；两组差异有显著性意义(P=0.019)。 (4)SNP与宫内发育迟缓的相关性：465例不同胎龄的新生儿,6个SNP位点各基因型对应的SGA发生率差异无显著性意义；根据胎龄不同分层检验,结果显示：早产儿TLR4启动子部位常见的SNP位点不同基因型人群SGA的发生率无明显差异；足月儿中,T-1418C的C／C基因型人群SGA的发生率为50%(5／10),T／C杂合子人群SGA的发生率为27.1%(16／59),T／T基因型为15.8%(13／82),三组之间差异有显著性意义,P=0.028；C／C基因型是SGA的高危因素,OR=3.862,T／T则是SGA的对抗因素,OR=0.431；G-1892A的G／G基因型SGA的发生率为15.9%(14／88),而非G／G基因型SGA的发生率为31.7%(20／63),两组之间差异有显著性意义(P=0.022),G／G基因型表现为SGA的对抗因素,OR=0.407；足月儿中,T-1418C的C／C基因型组体重为2994.1±653.9g；T／C组体重为3165.5±455.1g,T／T组体重为3251.7±557.4g；三组之间差异有显著性意义；G-1892A的A/A基因型组体重为2838.0±546.0g；G／A：3201.2±529.1g；G／G：3276.2±552.2g；三组之间差异有显著性意义(P=0.024) 结论TLR4基因多态性存在明显的种族差异性,我国汉族新生儿人群中常见的SNP位点集中在启动子部位,编码区SNP的频率分布偏低；启动子部位常见的6个SNP位点可能与G-菌感染、低出生体重和宫内发育迟缓等存在相关性。
【学位单位】：复旦大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2010
【中图分类】：R722.1
【部分图文】：

C/T0.372 T/T0.574T:0，760图2是本研究发现的TLR4启动子区域一3000bp范围内，样本的6个常见SNP位点的峰图，均选择杂合标本为代表。
【参考文献】

相关期刊论文 前1条

1 王永堂;蒋建新;段朝霞;顾玮;曾灵;陈客宏;;TLR4基因启动子区多态性及其对蛋白表达的影响[J];现代生物医学进展;2009年07期

本文编号：2844738