1例高甲硫氨酸血症儿童的临床表型和基因型分析并文献复习
发布时间：2020-12-04 15:53
目的对1例在新生儿筛查发现血浆甲硫氨酸升高而无明显临床症状的患儿的临床资料进行回顾性分析,归纳总结该类疾病的临床特点和诊疗思路,探讨临床上遇到新生儿筛查异常和致病性未明的新基因突变时,如何对筛查报告和基因报告做出正确合理的解读,从而作出正确的干预和遗传指导。方法1.研究对象:青岛大学附属医院接诊的1例高甲硫氨酸血症儿童家庭。2.研究方法:（1）回顾性总结分析先证者的临床资料、实验室检查及血、尿代谢筛查结果;（2）归纳总结先证者疾病特点,以其典型氨基酸代谢异常指标为关键词进行文献搜索,将查获的疾病与该患儿的临床表现进行比对;（3）经医院医学伦理委员会同意,与家属沟通并签署知情同意书,收集先证者及其家庭成员的外周血,通过测序技术对相关基因外显子编码区进行直接测序,查找疑似致病基因,并对其他成员进行致病性基因的验证;结果一名2月龄女婴,新生儿血串联质谱代谢病筛查时发现血甲硫氨酸水平升高,无相关临床症状,直至就诊前生长发育均良好。查体精神反应好,无特殊疾病面容,肝脾无肿大,血检仅有肝功能轻度异常,血串联质谱分析仍提示甲硫氨酸轻度升高。由于患儿缺乏临床特异性,我们选择最合适的基因测序+MLPA技...
【文章来源】：青岛大学山东省
【文章页数】：40 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
先证者及其父母测序结果与正常对比
亲Ⅰ1携带相同错义突变，箭头所指出为突变位点。Ⅰ2、Ⅲ图分别为先证者母亲及正常氨基酸序列。图2 先证者甲硫氨酸浓度变化图3 家系图注：图 3 家系图中Ⅱ是先证者，I1、I2 分别是先证者父亲、母亲。2.4 生物信息学分析致病性“中心法则”提出DNA的改变会导致RNA的变化，并可导致其编码的氨基酸发生变化。而氨基酸的改变可能会引起蛋白质高级结构改变，并最终影响蛋白质功能。利用SIFT（Sorting Intolerant From Tolerant）和Polyphen-2（Phenotyping Version2）基于蛋白序列同源性算法的预测原理，来共同评价SNP（人类可遗传的变异中最常见的一种）对蛋白结构、功能的影响。2.4.1 Polyphen-2软件采用了Na ve Bayes的机器学习算法来评估SNP导致的氨基酸改变对蛋白质折叠、互作、构象稳定性的影响。
图2 先证者甲硫氨酸浓度变化图3 家系图注：图 3 家系图中Ⅱ是先证者，I1、I2 分别是先证者父亲、母亲。2.4 生物信息学分析致病性“中心法则”提出DNA的改变会导致RNA的变化，并可导致其编码的氨基酸发生变化。而氨基酸的改变可能会引起蛋白质高级结构改变，并最终影响蛋白质功能。利用SIFT（Sorting Intolerant From Tolerant）和Polyphen-2（Phenotyping Version2）基于蛋白序列同源性算法的预测原理，来共同评价SNP（人类可遗传的变异中最常见的一种）对蛋白结构、功能的影响。2.4.1 Polyphen-2软件采用了Na ve Bayes的机器学习算法来评估SNP导致的氨基酸改变对蛋白质折叠、互作、构象稳定性的影响。
【参考文献】：
期刊论文
[1]20027例新生儿遗传代谢病串联质谱筛查的初步报告[J]. 杨宇奇,蒋曙红,韩小亚,江丽华,虞斌,朱伟. 重庆医学. 2018(02)
[2]1例高甲硫氨酸血症基因突变分析[J]. 杨宇奇,王淮燕,江丽华,张瑜平,虞斌,朱伟,秦志强. 中国当代儿科杂志. 2017(09)
[3]遗传变异分类标准与指南[J]. 王秋菊,沈亦平,邬玲仟,陈少科,陈子江,方向东,傅松滨,龚瑶琴,黄国英,黄国宁,黄荷凤,黄山,郝晓柯,冀小平,李红,梁波,廖灿,乔杰,苏海翔,魏军,王磊,王树玉,王晓红,邢清和,徐湘民,袁慧军,杨正林,周从容,周文浩,曾勇,张学军,黄涛生,郑茜,秦胜营,于世辉,关静,王洪阳,王大勇,赵立东,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝轶君,徐君玲,王剑青,王莉,赵婷,秦一丁,夏滢颖,樊丽霞,赵丁丁,邱浩,贺林. 中国科学:生命科学. 2017(06)
[4]一例单纯性高甲硫氨酸血症患儿的MAT1A基因突变分析[J]. 孙云,马定远,王彦云,杨冰,蒋涛. 中华医学遗传学杂志. 2017 (01)
[5]五种生物信息学软件对于错义突变预测性能的评估[J]. 陈倩婷,戴聪伶,张前军,杜娟,李汶. 中华医学遗传学杂志. 2016 (05)
[6]11204例新生儿串联质谱筛查结果分析[J]. 郑文吉,王飞,余颀,陈志央,庄丹燕. 中国优生与遗传杂志. 2016(02)
[7]高通量测序数据分析和临床诊断流程的解读[J]. 黎籽秀,刘博,徐凌丽,杨琳,王慧君,周文浩. 中国循证儿科杂志. 2015(01)
[8]全外显子组测序:儿童疾病诊断新思路[J]. 马丁艾遥,马丁艾路,王慧君,周文浩. 中国循证儿科杂志. 2015(01)
[9]希特林蛋白缺乏症的研究进展[J]. 堵向楠,丁岩,王向波. 疑难病杂志. 2014(09)
[10]Citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症内分泌代谢特征分析[J]. 张文,刘丽,盛慧英,彭敏芝,赵小媛,吴冬燕. 中国实用儿科杂志. 2013(01)
本文编号：2897869
【文章来源】：青岛大学山东省
【文章页数】：40 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
先证者及其父母测序结果与正常对比
亲Ⅰ1携带相同错义突变，箭头所指出为突变位点。Ⅰ2、Ⅲ图分别为先证者母亲及正常氨基酸序列。图2 先证者甲硫氨酸浓度变化图3 家系图注：图 3 家系图中Ⅱ是先证者，I1、I2 分别是先证者父亲、母亲。2.4 生物信息学分析致病性“中心法则”提出DNA的改变会导致RNA的变化，并可导致其编码的氨基酸发生变化。而氨基酸的改变可能会引起蛋白质高级结构改变，并最终影响蛋白质功能。利用SIFT（Sorting Intolerant From Tolerant）和Polyphen-2（Phenotyping Version2）基于蛋白序列同源性算法的预测原理，来共同评价SNP（人类可遗传的变异中最常见的一种）对蛋白结构、功能的影响。2.4.1 Polyphen-2软件采用了Na ve Bayes的机器学习算法来评估SNP导致的氨基酸改变对蛋白质折叠、互作、构象稳定性的影响。
图2 先证者甲硫氨酸浓度变化图3 家系图注：图 3 家系图中Ⅱ是先证者，I1、I2 分别是先证者父亲、母亲。2.4 生物信息学分析致病性“中心法则”提出DNA的改变会导致RNA的变化，并可导致其编码的氨基酸发生变化。而氨基酸的改变可能会引起蛋白质高级结构改变，并最终影响蛋白质功能。利用SIFT（Sorting Intolerant From Tolerant）和Polyphen-2（Phenotyping Version2）基于蛋白序列同源性算法的预测原理，来共同评价SNP（人类可遗传的变异中最常见的一种）对蛋白结构、功能的影响。2.4.1 Polyphen-2软件采用了Na ve Bayes的机器学习算法来评估SNP导致的氨基酸改变对蛋白质折叠、互作、构象稳定性的影响。
【参考文献】：
期刊论文
[1]20027例新生儿遗传代谢病串联质谱筛查的初步报告[J]. 杨宇奇,蒋曙红,韩小亚,江丽华,虞斌,朱伟. 重庆医学. 2018(02)
[2]1例高甲硫氨酸血症基因突变分析[J]. 杨宇奇,王淮燕,江丽华,张瑜平,虞斌,朱伟,秦志强. 中国当代儿科杂志. 2017(09)
[3]遗传变异分类标准与指南[J]. 王秋菊,沈亦平,邬玲仟,陈少科,陈子江,方向东,傅松滨,龚瑶琴,黄国英,黄国宁,黄荷凤,黄山,郝晓柯,冀小平,李红,梁波,廖灿,乔杰,苏海翔,魏军,王磊,王树玉,王晓红,邢清和,徐湘民,袁慧军,杨正林,周从容,周文浩,曾勇,张学军,黄涛生,郑茜,秦胜营,于世辉,关静,王洪阳,王大勇,赵立东,王慧君,孔令印,宣黎明,冒燕,祝轶君,徐君玲,王剑青,王莉,赵婷,秦一丁,夏滢颖,樊丽霞,赵丁丁,邱浩,贺林. 中国科学:生命科学. 2017(06)
[4]一例单纯性高甲硫氨酸血症患儿的MAT1A基因突变分析[J]. 孙云,马定远,王彦云,杨冰,蒋涛. 中华医学遗传学杂志. 2017 (01)
[5]五种生物信息学软件对于错义突变预测性能的评估[J]. 陈倩婷,戴聪伶,张前军,杜娟,李汶. 中华医学遗传学杂志. 2016 (05)
[6]11204例新生儿串联质谱筛查结果分析[J]. 郑文吉,王飞,余颀,陈志央,庄丹燕. 中国优生与遗传杂志. 2016(02)
[7]高通量测序数据分析和临床诊断流程的解读[J]. 黎籽秀,刘博,徐凌丽,杨琳,王慧君,周文浩. 中国循证儿科杂志. 2015(01)
[8]全外显子组测序:儿童疾病诊断新思路[J]. 马丁艾遥,马丁艾路,王慧君,周文浩. 中国循证儿科杂志. 2015(01)
[9]希特林蛋白缺乏症的研究进展[J]. 堵向楠,丁岩,王向波. 疑难病杂志. 2014(09)
[10]Citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症内分泌代谢特征分析[J]. 张文,刘丽,盛慧英,彭敏芝,赵小媛,吴冬燕. 中国实用儿科杂志. 2013(01)
本文编号：2897869
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