先天性甲状腺功能低下患儿16个已知候选致病基因遗传学研究

发布时间：2020-12-18 08:46

　　目的探究先天性甲状腺功能低下(CH,congenital hypothyroidism)患儿的已知候选致病基因突变的类型和特点,对基因突变的频率及其组合方式进行统计分析,以揭示遗传因素在CH致病机制中的作用,从而为新生儿CH的遗传筛查和早期诊断奠定理论基础。方法选取山东地区新生儿筛查中心的377例CH病例,其中包括288例甲状腺发育不全(TD,thyroid dysgenesis)患儿和89例原位甲状腺(GIS,gland in situ)型CH患儿,所有患儿都经过B超检查或甲状腺放射性锝元素扫描明确了甲状腺形态。对患儿基因组DNA的16个已知CH候选致病基因的外显子进行测序,以获取原始测序信息;利用ANNOVAR软件将所得数据和1000 Genome,GRCh37/hg19及DbSNP进行序列比对,对基因突变位点的突变类型和保守性分析结果进行了注释,并对患者各突变位点的信息进行了全面分析。利用SIFT、Polyphen 2、Mutation Taster、CADD等软件预测其致病性,对筛查出的致病突变进行突变频率分析,并对双等位基因和多基因联合突变进行统计分析,以构建各临床表型的候选... 

【文章来源】：青岛大学山东省

【文章页数】：53 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

突变基因在患儿中的分布

20图 2 双基因突变组合4 热点突变及新发突变在本研究中检出的168 个突变中有57个为新发突变，其中12 个位于TG 基因；DUOX2 中有 11 个新发突变；TSHR 中有 8 个新发突变；DUOXA1 中有 5 个新发突变；PAX8，SLC5A5 和 TPO 中各有 3 个新发突变；GLIS3，DUOXA2，THRB 和 NKX2-1中各有 2 个新发突变；在 FOXE1，NKX2-5，IYD 和 SLC26A4 中各有 1 个新发突变（表 5）。此外，我们还发现在此次筛查的候选基因中有 10 个位点突变率较高，可能是山东 CH 群体中的突变热点（表 6）。DUOXA2 中的无义突变（p.Y246X）具有极高的突变率，在 377 例患儿中有 68 例（18.04%）存在该突变，包括 20 例 GIS 患


本文编号：2923709