自闭症与脑发育及基因组印迹的相关性分析

发布时间：2021-02-02 19:26

　　自闭症谱系障碍（Autism Spectrum Disorder,ASD）简称自闭症,与孤独症同义,是一组以社交和言语交流缺陷、兴趣狭窄及重复刻板的行为模式为特征的神经发育障碍性疾病。流行病学估计ASD的患病率高达1%。近年来,基因组学技术的进步和大规模的人群研究促进了ASD易感基因的发现,目前基因数目已超过1000个。然而单个基因至多解释1%-2%的患者,揭示ASD的高度遗传异质性。基因组印迹是基因根据亲本来源的不同而呈现单等位基因表达的一种表观遗传现象。许多印迹基因在维持胎盘发育、调节胎儿生长、代谢、神经功能及社交行为等方面充当至关重要的作用。研究发现印迹基因的异常表达会引发一些认知相关的疾病,包括自闭症。神经病理学研究表明自闭症患者的脑呈现多种类型的畸形,包括皮质发育不良、异位和神经形态异常。脑成像研究发现脑容量过度增长与自闭症的发生及社交缺陷严重程度有关。本课题旨在从脑发育和基因组印迹的角度探索自闭症。首先我们系统地收集文献已报道的所有自闭症相关的基因及印迹基因,将获得的1905个自闭症相关基因和229个印迹基因定位到染色体上,实现可视化。滑动窗口及统计分析表明印迹基因与自闭症... 

【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

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主要缩略词表
前言
第一章 文献综述
    1.1 自闭症
        1.1.1 自闭症的定义及诊断标准
        1.1.2 自闭症的流行病学
        1.1.3 自闭症的诊断量表
        1.1.4 自闭症的影响因素
    1.2 基因组印迹与自闭症
        1.2.1 基因组印迹的定义
        1.2.2 印迹的建立、维持与消除
        1.2.3 印迹基因的表达特征
        1.2.4 印迹基因与发育相关疾病
    1.3 脑发育与自闭症
        1.3.1 人脑的发育过程
        1.3.2 人脑的成熟过程
        1.3.3 脑发育与自闭症
第二章 材料与方法
    2.1 数据收集
        2.1.1 自闭症相关基因的收集与整理
        2.1.2 印迹基因的收集与整理
        2.1.3 正常人脑芯片数据的收集
    2.2 自闭症相关基因的富集分析
    2.3 自闭症相关基因和印迹基因的相关性分析
        2.3.1 自闭症相关基因和印迹基因可视化
        2.3.2 滑动窗口的实现
    2.4 正常人脑的基因表达谱分析
        2.4.1 芯片数据预处理
        2.4.2 芯片差异表达值的筛选
    2.5 正常人脑差异基因、印迹基因和自闭症相关基因的功能分析
        2.5.1 基因的表达轨迹分析
        2.5.2 基因间相互作用的预测
    2.6 数据库的构建
第三章 结果与讨论
    3.1 自闭症相关基因的富集分析
        3.1.1 自闭症相关基因的GO分析
        3.1.2 自闭症相关基因的KEGG分析
        3.1.3 自闭症相关基因的染色体富集分析
        3.1.4 自闭症相关基因的人类疾病富集分析
    3.2 自闭症相关基因与印迹基因的关联分析
    3.3 正常人脑的基因表达谱分析
    3.4 自闭症相关基因、印迹基因与脑差异表达基因的分析
        3.4.1 自闭症、印迹与脑差异共同基因的表达轨迹分析
        3.4.2 自闭症、印迹与脑差异共同基因的相互作用预测
    3.5 数据库
    3.6 讨论
    3.7 总结与展望
参考文献
致谢
附录
作者简介



本文编号：3015246