环状RNA在小鼠肺发育中的连续表达及功能预测
发布时间：2021-02-03 06:51
目的探讨环状RNA（circRNA）circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359在小鼠肺发育中的连续表达及潜在功能。方法根据肺发育分期,取孕16.5 d（E16.5 d）、孕18.5 d（E18.5 d）及生后2 d（P2 d）胎鼠及新生小鼠的肺组织,利用苏木精-伊红染色观察肺组织形态学;利用qRT-PCR技术检测晚期肺发育过程中circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359的表达情况;应用miRanda和TargetScan软件预测circRNA的靶向miRNA,然后对靶基因进行GO和KEGG分析并预测相应circRNA功能。结果在E16.5 d小鼠肺组织切片中观察到Ⅱ型肺泡上皮细胞,且逐渐增多,P2 d时肺泡迅速扩张,间质变薄,肺泡结构逐渐成熟;qRT-PCR结果显示circ4:150439343|150477468相对表达量随时间推移持续上调（P<0.05）,circ15:73330849|73343359的相对表达量先下调再上调（P<0.05）;宿主基因功能...
【文章来源】：中国当代儿科杂志. 2020,22(10)北大核心
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
肺发育过程中小鼠肺发育的形态学变化
图2 与circ4:150439343|150477468、circ15:73330849|73343359相互作用的miRNA靶基因的GO功能富集分析图。3 讨论
经过与circBase数据库进行比对,发现circ4:150439343|150477468、circ15:73330849|73343359分别对应mmu＿circ＿0001213和mmu＿circ＿0005897。通过miRanda和TargetScan软件预测结果表明,circ4:150439343|150477468可能与miR-3102-5p.2-5p结合,circ15:73330849|7334335可能与miR-6769b-5p和miR-6989-3p结合。这两条circRNA从生物学过程而言,主要富集于通过质膜黏附分子黏附同质细胞、对信息素的反应、细胞间信号传导、细胞外基质组织等;从细胞成分而言,主要富集于蛋白质细胞外基质、细胞骨架、受体复合体、基底膜等;从分子功能而言,主要富集于信息素结合、信息素受体活性、细胞外基质结构成分、染色质结合等(图2)。KEGG通路分析主要涉及Notch、PI3K-Akt、NF-κB、甲状腺激素、胰岛素、内分泌抵抗等信号通路(图3)。图3 与circ4:150439343|150477468、circ15:73330849|73343359相互作用的mi RNA靶基因的KEEG富集分析图
本文编号：3016085
【文章来源】：中国当代儿科杂志. 2020,22(10)北大核心
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
肺发育过程中小鼠肺发育的形态学变化
图2 与circ4:150439343|150477468、circ15:73330849|73343359相互作用的miRNA靶基因的GO功能富集分析图。3 讨论
经过与circBase数据库进行比对,发现circ4:150439343|150477468、circ15:73330849|73343359分别对应mmu＿circ＿0001213和mmu＿circ＿0005897。通过miRanda和TargetScan软件预测结果表明,circ4:150439343|150477468可能与miR-3102-5p.2-5p结合,circ15:73330849|7334335可能与miR-6769b-5p和miR-6989-3p结合。这两条circRNA从生物学过程而言,主要富集于通过质膜黏附分子黏附同质细胞、对信息素的反应、细胞间信号传导、细胞外基质组织等;从细胞成分而言,主要富集于蛋白质细胞外基质、细胞骨架、受体复合体、基底膜等;从分子功能而言,主要富集于信息素结合、信息素受体活性、细胞外基质结构成分、染色质结合等(图2)。KEGG通路分析主要涉及Notch、PI3K-Akt、NF-κB、甲状腺激素、胰岛素、内分泌抵抗等信号通路(图3)。图3 与circ4:150439343|150477468、circ15:73330849|73343359相互作用的mi RNA靶基因的KEEG富集分析图
本文编号：3016085
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