新生儿神经发育与肠道菌群关系的初步探讨

发布时间：2021-07-16 15:10

　　目的通过16S rDNA高通量测序技术比较神经发育正常及神经发育不良的新生儿肠道菌群的特点及差异,进一步探讨肠道菌群与神经发育的潜在联系,发现特定菌群对神经发育的作用。方法共纳入符合标准的94例新生儿,收集94例新生儿入院第1次的粪便样本。将94份粪便样本根据胎龄及神经发育情况分成四组（第1、2、3、4组分别对应早产神经发育正常组、早产神经发育不良组、足月神经发育正常组、足月神经发育不良组）,提取粪便样本总DNA,对目前区域DNA进行PCR扩增,采用Miseq平台进行双端测序,分析各组间肠道菌群的组成和多样性。结果1、共有新生儿粪便样本96份送检,94份样本DNA测序分析成功,2份样本扩增失败。94份样本测序共得到722个OTU,共发现23个门,45个纲,58个目,111个科,203个属,200个种。2、早产神经发育正常组Chao指数、ACE指数、Shannon指数分别为47.2（31.6,120.1）,51.5（37.6,151.6）,0.89（0.41,1.51）,早产神经发育不良组Chao指数、ACE指数、Shannon指数分别为45.5（31.8,76.7）,56.2（34.3... 

【文章来源】：南华大学湖南省

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

优化序列长度分布图

第 2 章结果2.3 肠道菌群多样性分析2.3.1 曲线分析通过样本的稀释曲线（见图 2.2）可以看出，所有样本间菌群种类丰富度差异较小，各样本抽取的序列数大于 20000 时，随着序列数的增加，所代表的 OUT数目增加缓慢，曲线总体趋于平缓，说明本研究样本测序数据量合理，可基本覆盖样本中所含菌群种类，满足进一步分析要求。

图 2.2 样本稀释曲线图通过样本的 Shannon-Wiener 曲线（见图 2.3）可以看出，各样本的 Shannon曲线不同，说明每个样本之间的菌群多样性有区别，从总体的趋势来看，当测序列数大于 10000 时，各样本的 Shannon 指数基本不变，曲线呈平台期改变，与样本稀释曲线的趋势相吻合，说明本次研究样本菌群种类检出率趋于饱和，再次证明本研究样本测序数据合理且深度足够，有利于后续生物信息学分析。

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3287249