长链非编码RNA Tug1与新生大鼠肺发育的关系及其潜在作用机制的研究
发布时间:2021-08-21 15:08
目的:支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)是一种早产儿中非常常见的并发症。伴随着围产医学的迅速发展,呼吸支持策略的不断优化,肺表面活性物质的及时应用,极低和超低出生体重儿的存活率逐渐升高,而BPD的发病率也逐年上升。其遗留的短期或长期不良结局不仅会给患儿的生命和生活质量带来影响,还会给患儿的家庭乃至整个社会带来沉重的经济负担。新型BPD的发生与肺发育不成熟有着密切的关系,胎龄小,出生体重低的早产儿更易患BPD。胚胎肺发育分为五个时期,其中肺泡期为肺泡发育成熟的关键时期,大多数早产儿出生时肺发育处于囊泡期,肺部解剖结构及生理功能尚不成熟,极易受高氧、机械通气压力等因素的影响,使肺泡发育进程受阻,表现为肺发育停滞、肺泡简单化和肺小血管发育不良。近年,有研究证实lncRNA可以与转录因子相互作用参与肺发育的调控及BPD的发生发展。LncRNA Tug1是一个与发育相关的指标,已被证实在大脑皮层、神经元及视网膜发育中扮演重要角色。但是Tug1与肺发育的关系尚未有相关报道。本研究通过生物信息学分析、PCR、WB、相关性分析与Chirp-MS等方法,旨在...
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
基因差异表达火山图
GO与KEGG分析
中国医科大学硕士学位论文143.3肺组织与肺泡Ⅱ型上皮细胞发育相关基因分析GEO数据库中选取肺组织和肺泡Ⅱ型上皮细胞mRNA表达数据集(GSE20954、GSE49346)(表3),以成年期为对照组,胚胎18天为实验组,利用GEO2R以P<0.05且|logFC|≥0.9为标准计算差异表达基因(图5)。两个数据集所得结果与32个基因取交集得到14个与包括肺组织及肺泡Ⅱ型上皮细胞在内的7种不同组织细胞共同存在的差异表达基因(图6),其中有五个基因:Tug1、Fubp1、Smarca1、Meg3及Igf2bp3在新生儿期的表达均高于成年期(图7)。Tug1在胚胎18天的肺组织和肺泡Ⅱ型上皮细胞的表达均高于成年期表达的1.5倍(表4)。图5.差异表达基因火山图A:GSE20954小鼠肺组织成年期VS胚胎18天B:GSE49346小鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞成年期VS胚胎18天表4.Tug1在两个数据集中的logFC值DatasetsP.ValuelogFCGSE493463.13E-020.992GSE209545.37E-050.8455
本文编号:3355834
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
基因差异表达火山图
GO与KEGG分析
中国医科大学硕士学位论文143.3肺组织与肺泡Ⅱ型上皮细胞发育相关基因分析GEO数据库中选取肺组织和肺泡Ⅱ型上皮细胞mRNA表达数据集(GSE20954、GSE49346)(表3),以成年期为对照组,胚胎18天为实验组,利用GEO2R以P<0.05且|logFC|≥0.9为标准计算差异表达基因(图5)。两个数据集所得结果与32个基因取交集得到14个与包括肺组织及肺泡Ⅱ型上皮细胞在内的7种不同组织细胞共同存在的差异表达基因(图6),其中有五个基因:Tug1、Fubp1、Smarca1、Meg3及Igf2bp3在新生儿期的表达均高于成年期(图7)。Tug1在胚胎18天的肺组织和肺泡Ⅱ型上皮细胞的表达均高于成年期表达的1.5倍(表4)。图5.差异表达基因火山图A:GSE20954小鼠肺组织成年期VS胚胎18天B:GSE49346小鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞成年期VS胚胎18天表4.Tug1在两个数据集中的logFC值DatasetsP.ValuelogFCGSE493463.13E-020.992GSE209545.37E-050.8455
本文编号:3355834
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