儿童IgA肾病与紫癜性肾炎尿液蛋白质的高分辨质谱分析及临床研究
发布时间：2021-10-16 06:18
背景和目的:原发性IgA肾病（IgA nephropathy,IgAN）是儿童最常见的肾小球疾病之一,是儿童和青少年慢性肾脏病的常见病因。其病理以IgA肾小球沉积为主要特征,IgA肾小球沉积也具有其他肾脏疾病的特征,包括过敏性紫癜性肾炎（Henoch-Schonlein purpura nephritis,HSPN）以及其他的慢性肝病引起免疫复合物性肾小球肾炎等。近年来研究认为IgAN与HSPN具有类似的发病机制,尽管预后不完全相同。肾活检病理检查是诊断IgAN和HSPN的金标准,但由于有创性和出血风险性不宜为基层临床一线医务人员掌握及重复操作,临床亟需无创的生物标志物检测方法。目前,尿蛋白组学已广泛应用于肾脏疾病及生物标志物的研究。本研究首次利用非数据依赖型（data independent acquisition,DIA）高分辨液相色谱-串联质谱技术（liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS）探测 IgAN 和 HSPN 患儿的尿液差异表达蛋白质组,其结果将为两者机制、进展、预后提供重要线索,也为两者寻找尿液生物...
【文章来源】：南方医科大学广东省
【文章页数】：116 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１本研究的设计思路图??
ｉｎ／１．７３ｍ２）?３９．?１?１７８．９?１６３?３０．８??系膜增生?是?是是是??新月体?１１．８％（２／１７）?２７．８％（５／１８）?否?否??节段硬化?１１．８％（２／１７）?１１．?１％（２／１８）?否?否??ＩｇＡ系膜沉积?是?是是是??其他免疫沉积?Ｃ３?ｌｇＧ／ＩｇＭ／Ｃ３?ＩｇＭ／Ｃ３?ＩｇＭ??肾小管间质病变?轻度?正常?轻度?轻度??１．?１．?３雛基本流程??本研宄非数据依赖型液相色谱－串联质谱分析的基本实验流程如图１－１，主??要包括图谱构建和Ｄ［Ａ分析两个部分，其中包括蛋白质提娶肽段酶解、色谱??１０??
?博士学位论文???血小板激活（ｐｌａｔｅｌｅｔ?ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ）、胆固醇代谢（ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ?ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）等通路??在儿童ＩｇＡＮ机制中发挥重要的生物作用。另外，如图１－６所示，ＩｇＡＮ组尿液??差异表达蛋白质的ＫＥＧＧ通路富集分析结果显示，细胞粘附分子、ＥＣＭ－受体相??互作用以及胆固醇代谢是发生显著变化的重要通路（Ｐ＜〇．?０５），其中Ｐ值越小，??对应ＫＥＧＧ通路富集度的显著性水平越高，这些通路下包含的差异表达蛋白质??可能对疾病提供重要的线索。因此，结合这两方面因素，联系ＩｇＡＮ的病理及发??病机制，可选择较为感兴趣的富集通路以及显著性影响这些通路的尿液差异表??达蛋白质进行后续生物学实验验证或机制探讨（表卜４）。??１１丨１丨丨丨丨１丨丨ｉｉｎｉｈｉｉ??＃?＾?＞?＃＂?＃?Ｉ?／?＃?Ｉ?ｉ?＾?＾?Ｉ?／１１?＾?１１??Ｈ?ｈ?ｉ！?！?ｍ?ｆ??／?；?＂?／?＃??／?■??ＫＥＧＧ?Ｐａｔｈｗａｙｓ?（Ｔｏｐ?２０）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－５?Ｔｏｐ?２０?ｓｉｇｎａｌｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ａｃｃｏｒｄｉｎｇ?ｔｏ?ＫＥＧＧ?ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ??ｕｒｉｎｅ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ＩｇＡＮ?ｖｓ．?ｃｏｎｔｒｏｌｓ??图１－５?ＩｇＡＮ?ｖｓ．对照组尿液差异表达蛋白质ＫＥＧＧ通路注释的前２０条信号通路??注：图中纵坐标表示每个ＫＥＧＧ通路中包含的差异表达蛋白质的数量。横飧丨小？为排名前２０??的ＫＥＧＧ信号通路。??２５??
【参考文献】：
期刊论文
[1]2004—2017年单中心9925例儿童肾活检病理分析[J]. 高春林,章丹,夏正坤,樊忠民,高远赋,张沛. 中华肾脏病杂志. 2019(03)
[2]Current application of proteomics in biomarker discovery for inflammatory bowel disease[J]. Patrick PY Chan,Valerie C Wasinger,Rupert W Leong. World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 2016(01)
[3]The PI3K/AKT Pathway and Renal Cell Carcinoma[J]. Huifang Guo,Peter German,Shanshan Bai,Sean Barnes,Wei Guo,Xiangjie Qi,Hongxiang Lou,Jiyong Liang,Eric Jonasch,Gordon B.Mills,Zhiyong Ding. Journal of Genetics and Genomics. 2015(07)
[4]Urinary proteomics as a novel tool for biomarker discovery in kidney diseases[J]. Jing WU1,Yi-ding CHEN2,Wei GU1 (1Department of Endocrinology and Metabolism,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China) (2Department of Oncology,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China). Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2010(04)
本文编号：3439316
【文章来源】：南方医科大学广东省
【文章页数】：116 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１本研究的设计思路图??
ｉｎ／１．７３ｍ２）?３９．?１?１７８．９?１６３?３０．８??系膜增生?是?是是是??新月体?１１．８％（２／１７）?２７．８％（５／１８）?否?否??节段硬化?１１．８％（２／１７）?１１．?１％（２／１８）?否?否??ＩｇＡ系膜沉积?是?是是是??其他免疫沉积?Ｃ３?ｌｇＧ／ＩｇＭ／Ｃ３?ＩｇＭ／Ｃ３?ＩｇＭ??肾小管间质病变?轻度?正常?轻度?轻度??１．?１．?３雛基本流程??本研宄非数据依赖型液相色谱－串联质谱分析的基本实验流程如图１－１，主??要包括图谱构建和Ｄ［Ａ分析两个部分，其中包括蛋白质提娶肽段酶解、色谱??１０??
?博士学位论文???血小板激活（ｐｌａｔｅｌｅｔ?ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ）、胆固醇代谢（ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ?ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）等通路??在儿童ＩｇＡＮ机制中发挥重要的生物作用。另外，如图１－６所示，ＩｇＡＮ组尿液??差异表达蛋白质的ＫＥＧＧ通路富集分析结果显示，细胞粘附分子、ＥＣＭ－受体相??互作用以及胆固醇代谢是发生显著变化的重要通路（Ｐ＜〇．?０５），其中Ｐ值越小，??对应ＫＥＧＧ通路富集度的显著性水平越高，这些通路下包含的差异表达蛋白质??可能对疾病提供重要的线索。因此，结合这两方面因素，联系ＩｇＡＮ的病理及发??病机制，可选择较为感兴趣的富集通路以及显著性影响这些通路的尿液差异表??达蛋白质进行后续生物学实验验证或机制探讨（表卜４）。??１１丨１丨丨丨丨１丨丨ｉｉｎｉｈｉｉ??＃?＾?＞?＃＂?＃?Ｉ?／?＃?Ｉ?ｉ?＾?＾?Ｉ?／１１?＾?１１??Ｈ?ｈ?ｉ！?！?ｍ?ｆ??／?；?＂?／?＃??／?■??ＫＥＧＧ?Ｐａｔｈｗａｙｓ?（Ｔｏｐ?２０）??Ｆｉｇｕｒｅ?１－５?Ｔｏｐ?２０?ｓｉｇｎａｌｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ａｃｃｏｒｄｉｎｇ?ｔｏ?ＫＥＧＧ?ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ??ｕｒｉｎｅ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ＩｇＡＮ?ｖｓ．?ｃｏｎｔｒｏｌｓ??图１－５?ＩｇＡＮ?ｖｓ．对照组尿液差异表达蛋白质ＫＥＧＧ通路注释的前２０条信号通路??注：图中纵坐标表示每个ＫＥＧＧ通路中包含的差异表达蛋白质的数量。横飧丨小？为排名前２０??的ＫＥＧＧ信号通路。??２５??
【参考文献】：
期刊论文
[1]2004—2017年单中心9925例儿童肾活检病理分析[J]. 高春林,章丹,夏正坤,樊忠民,高远赋,张沛. 中华肾脏病杂志. 2019(03)
[2]Current application of proteomics in biomarker discovery for inflammatory bowel disease[J]. Patrick PY Chan,Valerie C Wasinger,Rupert W Leong. World Journal of Gastrointestinal Pathophysiology. 2016(01)
[3]The PI3K/AKT Pathway and Renal Cell Carcinoma[J]. Huifang Guo,Peter German,Shanshan Bai,Sean Barnes,Wei Guo,Xiangjie Qi,Hongxiang Lou,Jiyong Liang,Eric Jonasch,Gordon B.Mills,Zhiyong Ding. Journal of Genetics and Genomics. 2015(07)
[4]Urinary proteomics as a novel tool for biomarker discovery in kidney diseases[J]. Jing WU1,Yi-ding CHEN2,Wei GU1 (1Department of Endocrinology and Metabolism,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China) (2Department of Oncology,the Second Affiliated Hospital,School of Medicine,Zhejiang University,Hangzhou 310009,China). Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine & Biotechnology）. 2010(04)
本文编号：3439316
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