miR-92a-2-5p/PRKCA/β-catenin在ETU诱导的肛门直肠畸形胎鼠中作用的研究
发布时间:2021-11-08 17:33
目的:肛门直肠畸形(Anorectal malformations,ARMs)是小儿消化系统最常见的消化系统先天畸形之一,通常表现为肛门闭锁、异位肛门、直肠尿道瘘等,疾病发生率约1/50001/1500。ARMs通常合并其他系统畸形,大多ARMs患者需要进行手术治疗,但是长期随访结果发现,很多ARMs患者术后存在便秘、便失禁等并发症,严重影响生活质量和心理健康。所以,深入了解ARMs的发病机理并基于此提供更好的治疗方法意义十分重大。在肛门直肠发育过程中,尿道直肠隔与泄殖腔膜的融合、直肠和尿道的完全分离以及直肠末端与外界贯通是肛门形成的必要条件。当这一过程在内外界因素下受阻时,就可能出现发育异常而形成肛门直肠畸形。在研究ARMs时,因临床标本难以获取,一般采用实验动物模型进行研究,其中,ETU(Ethylenethiourea,乙烯硫脲)诱导的肛门直肠畸形大鼠胚胎是研究ARMs最常用的动物模型。形态学研究发现,ARMs畸形胚胎的主要表型包括:(1)尿道直肠隔和泄殖腔膜未融合;(2)尾肠退化延迟;(3)泄殖腔壁异常细胞凋亡;(4)背侧泄殖腔及背侧泄殖腔膜发育缺陷。而在...
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:105 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
GD14-16中正常组和ARMs胎鼠后肠组织中761个大鼠miRNA的聚类热图
中国医科大学博士学位论文在图 2A 中,我们将三个时间点中,正常组和 ARMs 组所有差异表达的 miRNA进行了层次聚类和热图绘制,可见整体上 GD14-16 正常组的 miRNA 表达水平明显低于 ARMs 组。为了解在不同时间点中均存在表达差异的 miRNA,我们进行了GD14-16 三个时间点正常组和 ARMs 各自差异 miRNA 交集分析。如图 2B 所示,分别有 34、41、30 个 miRNA 仅仅在 GD14、GD15、GD16 某 个时间点差异表达;4 个 miRNA(miR-143-5p、miR-125b-2-3p、miR-92a-2-5p、miR-99a-5p)同时在 GD14和 GD16 差异表达,8 个 miRNA(miR-125b-5p、miR-125a-5p、miR-191a-5p、miR-129-2-3p、miR-204-3p、miR-702-5p、miR-187-5p、miR-3542)同时在 GD15和 GD16 差异表达。
图 3. miRNA-靶基因调控网络图。绿色菱形代表 miRNA;紫色和蓝色圆形分别代表数据库预测的和实验验证的靶基因。灰色线条表示 miRNA 与靶基因之间潜在的靶向调控关系。3.3 GO 和 KEGG 富集分析,以及 miRNA-靶基因-信号通路互作网络的构建预测的和实验验证的 18 个 miRNA 的靶基因被用于后续生物信息学分析。首先我们对 18 个 miRNA 的靶基因进行了 GO 功能富集分析,该分析分为生物过程(Biological process,BP)、细胞成分(Cellular component,CC)和分子功能(Molecularfunction,MF)三个方面。结果显示:这些靶基因在 DNA 结合和基因调控、生物分子代谢和合成、神经元分化和投射、转录调控等方面被显著富集。图 4 所示为GO 分析中 BP、CC 和 MF 中排名前 15 位的条目。
本文编号:3483927
【文章来源】:中国医科大学辽宁省
【文章页数】:105 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
GD14-16中正常组和ARMs胎鼠后肠组织中761个大鼠miRNA的聚类热图
中国医科大学博士学位论文在图 2A 中,我们将三个时间点中,正常组和 ARMs 组所有差异表达的 miRNA进行了层次聚类和热图绘制,可见整体上 GD14-16 正常组的 miRNA 表达水平明显低于 ARMs 组。为了解在不同时间点中均存在表达差异的 miRNA,我们进行了GD14-16 三个时间点正常组和 ARMs 各自差异 miRNA 交集分析。如图 2B 所示,分别有 34、41、30 个 miRNA 仅仅在 GD14、GD15、GD16 某 个时间点差异表达;4 个 miRNA(miR-143-5p、miR-125b-2-3p、miR-92a-2-5p、miR-99a-5p)同时在 GD14和 GD16 差异表达,8 个 miRNA(miR-125b-5p、miR-125a-5p、miR-191a-5p、miR-129-2-3p、miR-204-3p、miR-702-5p、miR-187-5p、miR-3542)同时在 GD15和 GD16 差异表达。
图 3. miRNA-靶基因调控网络图。绿色菱形代表 miRNA;紫色和蓝色圆形分别代表数据库预测的和实验验证的靶基因。灰色线条表示 miRNA 与靶基因之间潜在的靶向调控关系。3.3 GO 和 KEGG 富集分析,以及 miRNA-靶基因-信号通路互作网络的构建预测的和实验验证的 18 个 miRNA 的靶基因被用于后续生物信息学分析。首先我们对 18 个 miRNA 的靶基因进行了 GO 功能富集分析,该分析分为生物过程(Biological process,BP)、细胞成分(Cellular component,CC)和分子功能(Molecularfunction,MF)三个方面。结果显示:这些靶基因在 DNA 结合和基因调控、生物分子代谢和合成、神经元分化和投射、转录调控等方面被显著富集。图 4 所示为GO 分析中 BP、CC 和 MF 中排名前 15 位的条目。
本文编号:3483927
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