昆明地区2002~2004年轮状病毒性肠炎分子基因特征研究
发布时间:2022-01-21 18:50
目的:研究昆明地区2002~2004年210例轮状病毒性肠炎患儿的轮状病毒分子基因特征。 方法:收集昆明医学院第一附属医院2002年、2003年、2004年9月~12月儿科住院部和门诊的急性肠炎患儿的粪便标本210份。采用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳法检测轮状病毒基因组,用逆转录—聚合酶链反应(RT-PCR)以及巢式—聚合酶链反应(net-PCR)对五种主要的VP7的血清型(G1、G2、G3、G4和G9)进行分型。并采用RT-PCR对VP7阳性标本进行NSP4(非结构蛋白4)的基因扩增,选取30份标本用net-PCR扩增出NSP4 cDNA 500bp并送去测序。测序结果用DNA assist软件包进行翻译,并用直接计数法和x2检验来处理数据。 结果:1、用PAGE电泳法检测的210份标本中,轮状病毒基因阳性有143份,检出率为68%;其中长型143份(100%),未发现短型和混合型。2、143份PAGE阳性标本有134份可以用RT-PCR扩增VP7基因全长,占93.7%,其中G1、G2、G3、G4、G9血清型检出率分别是28.4%(38/134),...
【文章来源】:昆明医科大学云南省
【文章页数】:38 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
尺VVP7的电泳图形
04K44株的NSp4序列
图504K50株的NSp4序列对测序的碱基序列用DNAassist软件包进行翻译,结果显示NSP4cDNA位,137位,139位氨基酸有变异,其变异位点为-VI,R一S,-VI。三年表4所示。
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国人轮状病毒不同基因型NSP4的致病性研究[J]. 王大燕,王健伟,魏强,屈建国,洪涛. 中国病毒学. 2005(03)
[2]两株Wa株人源轮状病毒NSP4蛋白的表达及其致ICR小鼠腹泻的毒力比较[J]. 庞伟,黄永坤,孟明耀,王萍,刘建生,徐冬蕾,戚勤,侯宗柳. 医学分子生物学杂志. 2005(02)
[3]昆明市儿童医院1998~2001年轮状病毒哨点监测分析[J]. 张丽杰,杜曾庆,章青,康宏宇,郑丽舒,刘晓梅,谢华萍,杨红雁,王艳春,Ivanoff B,GlassRI,BreseeJS,Jiang X,Kilgore PE,方肇寅. 中华流行病学杂志. 2004(05)
[4]昆明地区A组轮状病毒感染状况调查与VP7血清型分析[J]. 赵亚玲,黄永坤,侯宗柳,魏群德,周丽芳. 中华流行病学杂志. 2004(05)
[5]上海地区婴幼儿腹泻的轮状病毒分子流行病学研究[J]. 曾玫,朱启镕,张又,李国华,陈冬梅,丁雅馨,钱渊. 中华儿科杂志. 2004(01)
[6]中国轮状病毒非结构蛋白NSP4基因变异特征的分析[J]. 王大燕,王健伟,徐倏燊,温乐英,毛宇荣,于修平,洪涛. 中华实验和临床病毒学杂志. 2003(01)
[7]兰州地区婴幼儿腹泻轮状病毒的分型特点[J]. 张春芳,金玉,张又,钱渊. 中华儿科杂志. 2002(07)
[8]广州地区婴幼儿腹泻轮状病毒感染及其型别的研究[J]. 常如虚,潘瑞芳,朱冰,张又,肖玮,钱渊. 中华儿科杂志. 2002(07)
[9]人轮状病毒NSP4基因变异与功能关系的初步研究[J]. 徐倏燊,王健伟,何雅青,姜慧英,洪涛. 病毒学报. 2002(02)
[10]卢龙县1998年婴幼儿腹泻轮状病毒血清型调查[J]. 唐景裕,方肇寅,郝玉军,杨辉,宁剑,齐锦,赵振梅,章菁,胡海宽,谢华萍,高凤洁,林思恩,王秀军. 中华实验和临床病毒学杂志. 2001(03)
本文编号:3600775
【文章来源】:昆明医科大学云南省
【文章页数】:38 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
尺VVP7的电泳图形
04K44株的NSp4序列
图504K50株的NSp4序列对测序的碱基序列用DNAassist软件包进行翻译,结果显示NSP4cDNA位,137位,139位氨基酸有变异,其变异位点为-VI,R一S,-VI。三年表4所示。
【参考文献】:
期刊论文
[1]我国人轮状病毒不同基因型NSP4的致病性研究[J]. 王大燕,王健伟,魏强,屈建国,洪涛. 中国病毒学. 2005(03)
[2]两株Wa株人源轮状病毒NSP4蛋白的表达及其致ICR小鼠腹泻的毒力比较[J]. 庞伟,黄永坤,孟明耀,王萍,刘建生,徐冬蕾,戚勤,侯宗柳. 医学分子生物学杂志. 2005(02)
[3]昆明市儿童医院1998~2001年轮状病毒哨点监测分析[J]. 张丽杰,杜曾庆,章青,康宏宇,郑丽舒,刘晓梅,谢华萍,杨红雁,王艳春,Ivanoff B,GlassRI,BreseeJS,Jiang X,Kilgore PE,方肇寅. 中华流行病学杂志. 2004(05)
[4]昆明地区A组轮状病毒感染状况调查与VP7血清型分析[J]. 赵亚玲,黄永坤,侯宗柳,魏群德,周丽芳. 中华流行病学杂志. 2004(05)
[5]上海地区婴幼儿腹泻的轮状病毒分子流行病学研究[J]. 曾玫,朱启镕,张又,李国华,陈冬梅,丁雅馨,钱渊. 中华儿科杂志. 2004(01)
[6]中国轮状病毒非结构蛋白NSP4基因变异特征的分析[J]. 王大燕,王健伟,徐倏燊,温乐英,毛宇荣,于修平,洪涛. 中华实验和临床病毒学杂志. 2003(01)
[7]兰州地区婴幼儿腹泻轮状病毒的分型特点[J]. 张春芳,金玉,张又,钱渊. 中华儿科杂志. 2002(07)
[8]广州地区婴幼儿腹泻轮状病毒感染及其型别的研究[J]. 常如虚,潘瑞芳,朱冰,张又,肖玮,钱渊. 中华儿科杂志. 2002(07)
[9]人轮状病毒NSP4基因变异与功能关系的初步研究[J]. 徐倏燊,王健伟,何雅青,姜慧英,洪涛. 病毒学报. 2002(02)
[10]卢龙县1998年婴幼儿腹泻轮状病毒血清型调查[J]. 唐景裕,方肇寅,郝玉军,杨辉,宁剑,齐锦,赵振梅,章菁,胡海宽,谢华萍,高凤洁,林思恩,王秀军. 中华实验和临床病毒学杂志. 2001(03)
本文编号:3600775
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