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昆明地区2002~2004年轮状病毒性肠炎分子基因特征研究

发布时间:2022-01-21 18:50
  目的:研究昆明地区2002~2004年210例轮状病毒性肠炎患儿的轮状病毒分子基因特征。 方法:收集昆明医学院第一附属医院2002年、2003年、2004年9月~12月儿科住院部和门诊的急性肠炎患儿的粪便标本210份。采用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳法检测轮状病毒基因组,用逆转录—聚合酶链反应(RT-PCR)以及巢式—聚合酶链反应(net-PCR)对五种主要的VP7的血清型(G1、G2、G3、G4和G9)进行分型。并采用RT-PCR对VP7阳性标本进行NSP4(非结构蛋白4)的基因扩增,选取30份标本用net-PCR扩增出NSP4 cDNA 500bp并送去测序。测序结果用DNA assist软件包进行翻译,并用直接计数法和x2检验来处理数据。 结果:1、用PAGE电泳法检测的210份标本中,轮状病毒基因阳性有143份,检出率为68%;其中长型143份(100%),未发现短型和混合型。2、143份PAGE阳性标本有134份可以用RT-PCR扩增VP7基因全长,占93.7%,其中G1、G2、G3、G4、G9血清型检出率分别是28.4%(38/134),... 

【文章来源】:昆明医科大学云南省

【文章页数】:38 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

昆明地区2002~2004年轮状病毒性肠炎分子基因特征研究


尺VVP7的电泳图形

序列,序列


04K44株的NSp4序列

序列,序列,碱基序列,软件包


图504K50株的NSp4序列对测序的碱基序列用DNAassist软件包进行翻译,结果显示NSP4cDNA位,137位,139位氨基酸有变异,其变异位点为-VI,R一S,-VI。三年表4所示。

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3600775

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