昆明市婴幼儿腹泻病毒分子流行病学及星状病毒特性的研究

发布时间：2017-05-20 19:15

  本文关键词：昆明市婴幼儿腹泻病毒分子流行病学及星状病毒特性的研究，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：婴幼儿腹泻病在我国儿童多发病、常见病中排第二位,在发展中国家及发达国家的发病率较高,疾病严重程度各不相同。腹泻可由多种病原体引起,包括寄生虫、细菌和病毒等,约72%婴幼儿腹泻是由病毒引起的。本文主要选取人诺如病毒(human norovirus, HNV)、人星状病毒(human astrovirus, HAstV)和人轮状病毒(human rotavirus, HRV)三种常见的腹泻病毒,对昆明地区婴幼儿腹泻进行分子流行病学的研究。通过逆转录PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)法对HAstV全基因组进行扩增；并挑取12份HAstV阳性样品扩增HAstV的衣壳蛋白ORF2,以期对昆明地区婴幼儿病毒性腹泻进行初步探讨。首先,利用RT-PCR方法对63份婴幼儿腹泻样品和42份非腹泻样品进行检测,检测可知：HNV、HAstV、HRV阳性率分别为20.63%、41.27%和34.92%,对照组中未检测出HNV和HRV感染,HAstV检测出1例感染,感染率为2.38%。其次,利用RT-PCR对HAstV基因组扩增,结果获得6.8 kb的全长基因组,命名为KM-02。通过核苷酸比对、系统进化树的构建发现,KM-02与HQ398856同源性最高为98.2%,属于HAstV1型。另外KM-02与昆明株KC342249同源性为88.7%,表明不同时间,流行的株系不同。最后,从检测HAstV阳性的样品中,通过RT-PCR的方法获得12株不同序列的HAstV ORF2。对其进行核酸及氨基酸的比对,并利用生物软件和互联网在线数据库分析ORF2的理化参数等,最后分析发现该蛋白理化参数较稳定,有较好的免疫原性。综上,本实验对2013年-2014年昆明地区婴幼儿病毒性腹泻的分子流行病学进行了调查和研究,丰富我国南方病毒性腹泻的相关资料,对我国病毒性腹泻感染、控制提供部分理论依据。对获得HAstV的全基因组和12株HAstV的ORF2进行研究和分析,为HAstV的检测、疫苗研制、起源和病毒免疫逃逸等提供理论依据。
【关键词】：婴幼儿腹泻 病毒 分子流行病学 星状病毒 ORF2
【学位授予单位】：昆明理工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R725.1
【目录】：

• 摘要6-7
• ABSTRACT7-14
• 英文缩略语索引14-15
• 第一章 绪论15-23
• 1.1 婴幼儿腹泻病15-16
• 1.1.1 婴幼儿腹泻病的起因15
• 1.1.2 婴幼儿腹泻病临床症状15-16
• 1.2 诺如病毒16-17
• 1.2.1 诺如病毒的结构及基因组特征16-17
• 1.2.2 诺如病毒基因的分型17
• 1.3 星状病毒17-19
• 1.3.1 星状病毒的结构及基因组特征18
• 1.3.2 星状病毒的衣壳蛋白18-19
• 1.3.3 星状病毒基因的分型19
• 1.4 轮状病毒19-21
• 1.4.1 轮状病毒的结构及基因组特征19-20
• 1.4.2 轮状病毒基因的分型20-21
• 1.5 HNV、HASTV,、HRV的预防和治疗21-22
• 1.5.1 HNV、HASTV、HRV的预防21
• 1.5.2 HNV、HASTV、HRV的治疗21-22
• 1.6 本论文研究目的及意义22-23
• 第二章 昆明地区病毒性小儿腹泻的分子流行病学分析23-50
• 2.1 材料和方法23-38
• 2.1.1 材料23-30
• 2.1.2 方法30-38
• 2.2 结果38-47
• 2.2.1 RT-PCR法检测婴幼儿腹泻病毒38-43
• 2.2.2 昆明地区婴幼儿腹泻病毒的流行病学统计43-47
• 2.3 讨论47-49
• 2.4 小结49-50
• 第三章 HASTV基因组的克隆50-64
• 3.1 材料和方法50-56
• 3.1.1 材料50-53
• 3.1.2 方法53-56
• 3.2 结果56-62
• 3.2.1 HASTV基因组的克隆56
• 3.2.2 HASTV基因组测序56-62
• 3.3 讨论62-63
• 3.4 小结63-64
• 第四章 HASTV衣壳蛋白ORF2的特性64-80
• 4.1 材料和方法64-69
• 4.1.1 材料64-66
• 4.1.2 方法66-69
• 4.2 结果69-78
• 4.2.1 RT-PCR法检测扩增HASTV的ORF269-71
• 4.2.2 ORF2的核苷酸序列和氨基酸序列比对71-75
• 4.2.3 HASTVORF2的系统进化分析75
• 4.2.4 HASTVORF2的理化性质分析75-76
• 4.2.5 HASTVORF2二级结构预测和分析76-78
• 4.3 讨论78-79
• 4.4 小结79-80
• 第五章 全文总结80-82
• 第六章 展望82-83
• 致谢83-84
• 参考文献84-89
• 附录A 攻读硕士期间发表论文及参与项目目录89

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 王真行;WHO关于轮状病毒疫苗的意见书[J];国外医学.预防.诊断.治疗用生物制品分册;1999年05期

2 牛雷;黄莉莉;王兰;陈庆;杨瑞宁;江淑芳;;386例婴幼儿轮状病毒感染调查[J];检验医学与临床;2010年18期

3 李克蓉;曹虹;周锦妍;汪艳;杨娟;黄永坤;;腹泻患儿诺如病毒和轮状病毒感染96例临床特点分析[J];昆明医学院学报;2011年01期

4 牛科;单思;巴彩凤;;人星状病毒Ⅰ型衣壳蛋白序列分析[J];解放军医学院学报;2013年04期

5 王森;王永全;苗元;高志勇;崔京辉;胡晓芬;靳博;;2013年北京地区5岁以下儿童病毒性腹泻病原学研究[J];疾病监测;2014年05期

6 王承训;黎伟明;孙利伟;杨显达;;长春市2013年小儿病毒性腹泻病原与临床特征研究[J];吉林医学;2014年32期

7 郝彩霞;廖雪春;谢晓丽;任敏;吕强;马小珍;;2012年成都地区婴幼儿病毒性腹泻监测结果分析[J];寄生虫病与感染性疾病;2014年01期

8 吴立梦;金子辰;王文静;;人星状病毒检测研究进展[J];检验医学;2011年03期

9 陈振明;曹晓鸥;曾红惠;梁子良;张彦丽;;佛山市南海区病毒性胃肠炎的病原体监测分析[J];现代预防医学;2012年04期

10 马袁君;程震龙;孙野青;;生物信息学及其在蛋白质组学中的应用[J];生物信息学;2008年01期

中国硕士学位论文全文数据库 前4条

1 马慧;儿童轮状病毒和星状病毒的感染情况及其型别分析[D];天津医科大学;2010年

2 李晓乐;南京地区五岁以下儿童病毒性腹泻的分子流行病学研究[D];南京大学;2012年

3 朱攀;昆明市小儿腹泻相关病毒的分子流行病学研究及病毒基因组克隆[D];昆明理工大学;2013年

4 赵进;重庆地区门诊儿童急性腹泻相关病毒的流行特征与基因特征研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2014年

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本文编号：382578