NLGN3基因与泰巴山区儿童精神发育迟滞相关性分析

发布时间：2017-08-18 04:05

  本文关键词：NLGN3基因与泰巴山区儿童精神发育迟滞相关性分析

  更多相关文章： NLGN3基因 精神发育迟滞 秦巴山区 关联分析

【摘要】：精神发育迟滞(Mental retardation,MR)是在生命早期,由遗传与环境因素共同作用所导致的综合症。我国贫困地区特别是中西部贫困地区发病率比较高,秦巴山区就是其中之一。因此,深入研究该地区MR形成的遗传病因,对建立有效的遗传监控措施具有重要的意义。 本研究以先期研究为基础,在课题组初步发现的染色体区段Xq12-Xq23之中选择了其中的NLGN3基因,采用病例-对照样本,对NLGN3基因与该地区MR的相关性进行了探讨。NLGN3基因编码神经细胞表面蛋白家族成员中的一种,该蛋白家族的成员可以作为β-细胞黏附因子的一种配体,并且涉及到中枢神经系统中突触的形成和重塑,进而可能通过调节突触间神经信号传导而与MR相关。 本研究在NLGN3基因上共选择了6个SNPs标记位点,采用PCR-SSCP结合测序结果,对187例MR儿童及213例对照组儿童的基因各位点进行分型,进而通过关联分析法对两组儿童各位点等位基因及基因型频率分布的差异性进行分析。结果如下： (1)除了rs4844287位点在中国人群中只有两种型以外,其它的5个SNPs位点各等位基因和基因型频率在不同性别儿童的分布中均无明显差异。 (2)各位点单位点分析结果显示rs11795613位点的等位基因频率与基因型频率在MR与对照组间均存在显著性差异(P值分别为0.0009,0.006),Bonferroni校正后其显著性依然存在,两组儿童的其它5个标记均未有显著性差异(P0.05)。 (3)单倍型分析表明,rs5981077-rs11795613组成的单倍型块和秦巴山区MR显著相关(P=0.0004),经校正后显著性依然存在,与单位点分析结果一致。 本研究结果提示,NLGN3基因与秦巴山区儿童MR有关,在该基因的rs1795613位点以及rs5981077-rs11795613单倍型块所标记的染色体区段中,可能存在着致病突变位点,需要做进一步的检测分析。
【关键词】：NLGN3基因 精神发育迟滞 秦巴山区 关联分析
【学位授予单位】：西北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R749.94;Q75
【目录】：

• 中文摘要3-4
• Abstract4-6
• 目录6-8
• 第一部分 理论8-23
• 1.1 精神发育迟滞综述8-17
• 1.1.1 精神发育迟滞的定义8
• 1.1.2 精神发育迟滞的分级8-10
• 1.1.3 精神发育迟滞的病因10-13
• 1.1.4 精神发育迟滞的诊断13-15
• 1.1.5 精神发育迟滞的治疗和预防方法15-17
• 1.2 秦巴山区MR概述17-19
• 1.2.1 秦巴山区基本情况和人群特点17-18
• 1.2.2 秦巴山区MR的患病情况及病因分析18-19
• 1.3 MR的遗传学研究19-23
• 1.3.1 连锁分析与关联分析19-20
• 1.3.2 Hardy-Weinberg平衡20-21
• 1.3.3 单倍型分析21
• 1.3.4 大规模关联分析中要注意的问题21-23
• 第二部分 实验设计与实现23-35
• 2.1 候选基因的选取23-24
• 2.1.1 候选基因的选取23-24
• 2.1.2 NLGN3基因情况介绍24
• 2.2 遗传标记的选择24-29
• 2.2.1 本研究所选择的遗传标记24-25
• 2.2.2 NLGN3基因上SNP的选择25-29
• 2.3 实验材料与方法29-35
• 2.3.1 研究对象29
• 2.3.2 实验主要仪器设备及试剂29
• 2.3.3 样品的采集及保存29-30
• 2.3.4 基因组DNA的提取30
• 2.3.5 目标片段的获取30-31
• 2.3.6 琼脂糖电泳检测31
• 2.3.7 PAGE电泳分型31-33
• 2.3.8 数据的统计分析33-35
• 第三部分 结果及其分析35-52
• 3.1 NLGN3基因的各个SNP分型情况35-42
• 3.1.1 rs7886134位点的基因分型结果35-36
• 3.1.2 rs11795613位点的基因分型结果36-37
• 3.1.3 rs5981077位点的基因分型结果37-39
• 3.1.4 rs7051529位点的基因分型结果39-40
• 3.1.5 rs4844285位点的基因分型结果40-41
• 3.1.6 rs4844287位点的基因分型结果41-42
• 3.2 NLGN3基因各个SNP标记的遗传学检验42-52
• 3.2.1 各个基因型频率的地域分布43-44
• 3.2.2 哈德-温伯格平衡检验44-45
• 3.2.3 各SNP等位基因频率分布的性别差异45-46
• 3.2.4 单位点等位基因频率与MR的关联分析46-47
• 3.2.5 各个位点基因型的组间分布47-48
• 3.2.6 NLGN3基因六个SNP位点的连锁不平衡检测结果48-49
• 3.2.7 单倍型分析49-51
• 3.2.8 统计效力分析51-52
• 第四部分 讨论52-54
• 参考文献54-59
• 附录59-63
• 致谢63

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前9条

1 陈建树;刘跃琴;刘筱英;阳伟红;刘丽君;;家长参与对儿童精神发育迟滞康复训练效果的影响[J];当代护士(专科版);2010年01期

2 张富昌,李瑞林,高晓彩,郑子健,黄绍平,宋合义,席恒,李芬;秦巴山区(宁强、柞水、安康试验区)0～14岁儿童精神发育迟滞患病状况调查[J];第四军医大学学报;2004年06期

3 龚耀先,戴晓阳;韦氏智力量表的简式用法[J];湖南医学院学报;1984年04期

4 王s，

本文编号：692560