常染色体及X染色体STR在乳腺癌及妇科肿瘤组织中的变异分析

发布时间：2016-12-09 20:52

  本文关键词：常染色体及X染色体STR在乳腺癌及妇科肿瘤组织中的变异分析，由笔耕文化传播整理发布。

《河北医科大学》 2014年

常染色体及X染色体STR在乳腺癌及妇科肿瘤组织中的变异分析

孙丽娟  

【摘要】：目的：在法医学实践中常会遇到一些特殊案例，肿瘤组织（通常为甲醛固定石蜡包埋组织）成为唯一的参照样本。然而肿瘤组织存在STR变异，使同一个体肿瘤组织与正常组织分型不一致。本研究旨在探讨妇科肿瘤组织和乳腺癌组织的常染色体和X染色体STR变异类型和规律，为此类肿瘤组织在法医学实践中的应用奠定基础。 方法： 1样本采集：分别采集经病理学诊断明确的63例乳腺癌和62例妇科恶性肿瘤患者的肿瘤组织和癌旁正常组织，以及10例妇科良性肿瘤组织及正常对照组织。其中40例妇科肿瘤样本包含对应的外周血。同时记录患者的年龄、肿瘤类型、组织类型、临床分期、分化程度等信息。 2DNA提取：分别用动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒和石蜡包埋组织DNA提取试剂盒提取妇科肿瘤和乳腺癌的肿瘤组织、癌旁正常组织DNA，用血液基因组小量提取试剂盒提取血液基因组DNA。用ND-1000蛋白核酸定量仪定量。 3STR分型：采用PowerPlex21System和Argus X-12试剂盒分别扩增DNA，共33个STR基因座。ABI3130Genetic Analyzer对PCR产物进行电泳分型，使用GeneMapper v3.2分析结果，得到肿瘤组织、正常组织和血液的STR分型。对比同一个体正常组织与血液的DNA分型和同一个体的肿瘤组织与正常组织的DNA分型，记录STR变异位点和类型。 4STR变异验证：用重复实验、不同试剂盒间相互验证和单基因座扩增方法验证STR变异的发生并对等位基因测序确认其发生的机制。 5显微切割：挑选存在STR变异的部分妇科肿瘤组织进行显微切割，对切取的肿瘤细胞和正常间质提取DNA，扩增并电泳分型，分别对比肿瘤细胞、正常间质细胞、肿瘤组织、正常组织DNA分型。 6统计学分析：应用Excel、SPSS v16.0软件对上述实验结果进行统计学分析，用计数法分析各种变异类型的个体水平STR变异率和基因座水平STR变异率，用χ2检验比较不同肿瘤类型、组织类型、分化程度及临床分期的STR变异差异及妇科肿瘤和乳腺癌组织STR变异的差异。 结果： 1妇科肿瘤组织STR变异 比较妇科肿瘤患者血液样本和正常对照组织的STR分型结果发现，血液样本与正常组织的STR分型一致，证实外周血液的STR分型无变异。 在妇科肿瘤组织中，观察到增加等位基因（additional alleles, Aadd）、新等位基因（new alleles, Anew）、完全杂合性丢失（complete loss ofheterozygosity, LOH）和部分杂合性丢失（partial loss of heterozygous,pLOH）4种STR变异类型。前三种可引起基因型改变（STRGA）导致误判。抽取部分确定STR变异的样本进行单基因座PCR扩增、测序，测序得到的等位基因与试剂盒分型结果一致。经过单个等位基因测序，发现大部分突变来自于重复单位数目的变化，多为整步突变，突变增长与减少均可见，符合复制滑脱机制。 统计分析结果显示，妇科肿瘤组织STR中，各变异类型的STR变异率不同，三种导致基因型改变的STR变异类型的个体检出率无显著差异，而基因座检出率在常染色体STR和33个STR中具有显著差异（P0.01）。 妇科肿瘤组织中，33个STR基因座的变异率范围为0~9.68%，常染色体STR变异检出率最高的基因座有Penta E、D5S818、FGA，分别为6.45%、9.68%、8.06%，X-STR以DXS10146的变异检出率最高，，为9.68%。在性别基因座AMEL、Penta D和HPRTB基因座未发现STR变异，其他基因座的STR变异率均大于DNA的平均突变率，影响等位基因的正确分型。检验结果显示，两种遗传标记的STR变异无显著性差异，亦无相关性。 经过χ2检验分析发现，在常染色和X染色体，不同肿瘤类型、组织类型和分化程度的妇科肿瘤组织的STR变异均无显著性差异。然而，由于良性肿瘤组织的STR基因座未发现变异，比较良、恶性妇科肿瘤组织的常染色体STR变异的差异具有统计学意义（P=0.029）。在X-STR中，两者的STR变异无显著性差异（P=0.108）。综合比较常染色体和X染色体STR变异发现，良、恶性妇科肿瘤组织的STR变异具有显著差异（P0.01）。秩和检验分析结果显示，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四个临床分期妇科肿瘤的常染色体STR、X-STR变异无显著性差异。 2乳腺癌组织STR变异 通过对比发现乳腺癌组织中也检测到4种STR变异类型，且各类型检出率存在差异。检验结果显示，三种导致基因型改变的STR变异类型的个体检出率和基因座检出率在常染色体STR和33个STR中无显著性差异，但是在X-STR的差异具有统计学意义（P0.01），Aadd检出率最高，LOH检出率最低。 在乳腺癌中，各STR基因座变异率范围是0~4.76%，发生STR变异的基因座较少，常染色体发生STR变异的基因座数低于X-STR。检验结果显示，两种遗传标记的STR变异无显著性差异，亦无相关性。 经χ2检验分析发现不同分化程度的乳腺癌组织常染色STR变异差异具有统计学意义。而X染色体及综合33个基因座的STR变异无显著差异。秩和检验结果显示，三个临床分期乳腺癌组织的STR变异差异无统计学意义。 3妇科肿瘤组织和乳腺癌STR变异差异 观察妇科肿瘤组织和乳腺癌的基因座水平的STR变异率发现，妇科肿瘤发生STR变异的基因座数显著高于乳腺癌，妇科肿瘤的基因座变异率也相对高于乳腺癌的同一基因座的变异率。在妇科肿瘤中变异多发生于常染色体STR基因座，而乳腺癌中X-STR变异更常见。经χ2检验分析结果显示，两种肿瘤的常染色体STR基因座变异存在显著性差异（P=0.003），而两种肿瘤在X染色体基因座的STR变异无显著性差异（P=0.179）。 4显微切割DNA分型结果 DNA分型结果显示，间质细胞与正常对照组织的DNA分型结果一致，肿瘤细胞与肿瘤组织的DNA分型存在差异。肿瘤细胞中只观察到3种STR变异类型：Anew、LOH和pLOH，而且检出LOH的数目多于相应的肿瘤组织。 结论： 1在常染色体STR和X-STR系统中，妇科肿瘤组织的STR基因座变异检出率、个体变异检出率显著高于乳腺肿瘤组织，乳腺癌组织的司法实践应用价值大于妇科肿瘤组织。 2在妇科肿瘤组织中，除AMEL、Penta D和HPRTB基因座外，其余基因座均检测到STR变异，说明此33个法医学常用的STR基因座在妇科肿瘤组织中的稳定性较差，不适合应用于该系统肿瘤组织的个体识别和亲子鉴定。 3本研究筛选出在乳腺肿瘤中未检测到变异的16个常染色体STR和4个X-STR基因座，可作为乳腺肿瘤个体识别的备选基因座，指导在大样本人群中深入研究。 4乳腺癌组织的常染色体STR基因座变异与肿瘤的分化程度有关，分化程度低的肿瘤组织STR变异率高，提示在实际检案中遇到此类肿瘤组织的检验需谨慎。 5通过显微切割技术可以准确分离出肿瘤组织中的正常间质细胞，能够代表肿瘤来源个体的正常DNA分型，是解决肿瘤组织身源鉴定的一种有效方法，适用于肿瘤细胞和间质细胞分界清楚的肿瘤组织。

【关键词】：
【学位授予单位】：河北医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R737.9;R737.3
【目录】：

下载全文 更多同类文献

CAJ全文下载

(如何获取全文？ 欢迎：购买知网充值卡、在线充值、在线咨询)

CAJViewer阅读器支持CAJ、PDF文件格式

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 颜坤,王明荣,房殿春,杨康;食管癌微卫星DNA不稳定性及其与临床病理的关系研究[J];第三军医大学学报;2004年17期

2 刘开会,季安全,邱宁,王坚,王传海,郭燕霞,常彩琴,王占海,王建国,曹侠;肿瘤组织9个STR基因座及Amelogenin基因座突变[J];中国法医学杂志;2002年02期

3 柳燕;李莉;赵珍敏;林源;阙庭志;;人体组织在非缓冲福尔马林固定剂中的STR检测时限[J];中国法医学杂志;2010年01期

4 方建新;李成涛;肖立;;13个STR位点在人消化系统肿瘤组织中的变异分析[J];法医学杂志;2007年04期

5 张晓华;微卫星不稳定性与胃癌发生[J];临床与实验病理学杂志;2004年06期

6 霍亚兰;刘风玲;;食管癌微卫星不稳定的研究进展[J];实用癌症杂志;2011年04期

7 王建平,李军;肺癌支气管冲洗液微卫星DNA的检测及意义[J];中国实用内科杂志;2003年02期

8 吴颜晖,陈汉春,刘新发,李新梅,曹燕飞;中国人食管鳞癌10q23微卫星不稳定和杂合性缺失初步探讨[J];中国肿瘤临床;2004年08期

9 丛文铭;肿瘤抑制基因变异的分子病理学研究进展[J];中华病理学杂志;2001年01期

10 游攀;黄如欣;倪宏英;张忠英;陈长荣;刘广发;陈锦萍;;15个短串联重复序列基因座基因频率在原发性胃腺癌患者和正常人群间分布的比较[J];中华检验医学杂志;2006年12期

中国博士学位论文全文数据库 前1条

1 李成涛;消化系统肿瘤组织身源鉴定策略探索[D];复旦大学;2010年

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 吴钊;陈小鱼;张能;王子卫;;KLF4蛋白在胃癌组织中的表达及临床意义[J];癌变.畸变.突变;2009年05期

2 张丹妍;张丹媚;万凌;吕静;陈晓星;赵乐天;李练兵;;亲子鉴定中Identifiler~(TM)系统15个STR基因座突变分析[J];癌变·畸变·突变;2011年03期

3 胡骏;彭开桂;;食管癌中抑癌基因PTEN研究进展[J];蚌埠医学院学报;2010年05期

4 刘光箭;刘虹;尹建平;朱远雁;沈钢;吴剑媚;章俊华;;单个STR等位基因真假突变分析[J];中国输血杂志;2009年06期

5 胡锡阶;万卫红;陈代雄;余丽梅;刘金伟;;Identifiler体系在276例单亲亲权鉴定中的应用分析[J];重庆医学;2010年09期

6 陈健刚;付志敏;石鸣;张建忠;史继伟;张丽萍;;新疆阿勒泰地区哈萨克族人群15个STR基因座的遗传多态性[J];重庆医学;2011年35期

7 丛文铭,吴孟超;肝癌基因组不稳定性的研究现状与展望[J];第二军医大学学报;2002年01期

8 丛文铭;21世纪分子病理诊断的发展与展望[J];第二军医大学学报;2003年04期

9 张保生;常林;;2010年中国证据法治前进的步伐[J];证据科学;2012年02期

10 夏其雨;杨小龙;;PTEN在消化道肿瘤的研究进展[J];放射免疫学杂志;2010年05期

中国重要会议论文全文数据库 前5条

1 张丹妍;张丹媚;万玲;吕静;陈晓星;赵乐天;李练兵;;亲子鉴定中Identifiler~(TM)系统15个STR基因座基因突变分析[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会（第三卷）[C];2010年

2 张丹妍;张丹媚;马明福;吕静;李新生;杨玉有;李练兵;;Identifiler~(TM)体系在唐氏综合征中的应用分析[A];第十四届中国科协年会第17分会场：环境危害与健康防护研讨会论文集[C];2012年

3 王顺霞;张敏;唐晖;杨任霏;赵学智;;近红外数码照相技术在深色衣料上潜血检验中的应用[A];中国法医学理论与实践创新成果精选——全国第九次法医学术交流会论文集[C];2013年

4 杨鑫;孙红兵;哈飞;盛清平;马宏;杨佳;;福尔马林固定肋软骨DNA提取初探[A];中国法医学理论与实践创新成果精选——全国第九次法医学术交流会论文集[C];2013年

5 周建东;;亲权鉴定DNA数据库查询结果解释中存在问题简议[A];中国法医学理论与实践创新成果精选——全国第九次法医学术交流会论文集[C];2013年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 解晨昊;食管鳞癌的田野癌化现象研究[D];四川大学;2005年

2 赵岩;子宫内膜癌中错配修复基因hMLH1与PTEN突变、微卫星不稳定性的相关性研究[D];中国医科大学;2006年

3 张喆;成人乳腺干细胞体外分离、培养、生物学特性鉴定及基因组不稳定性的研究[D];吉林大学;2007年

4 范天黎;AIF和Bit1在食管鳞癌中的表达及其在TAp63γ诱导细胞凋亡中的作用[D];郑州大学;2007年

5 杜冰;常染色体三个miniSTR同步检测和mt-SNP的微测序检测研究[D];四川大学;2007年

6 倪海峰;鼻咽癌中微卫星不稳定与错配修复基因启动子甲基化研究[D];广西医科大学;2008年

7 刘国辉;错配修复基因、抑癌基因及微卫星不稳定性与乳腺癌相关性研究[D];吉林大学;2008年

8 于舰;酪氨酸羟化酶基因多态性与精神疾病关联性及法医学和人类遗传学意义[D];中国医科大学;2008年

9 章宗籍;人肝癌相关基因表观遗传学的基因表达调控异常机制研究[D];昆明医学院;2009年

10 吕丽琼;乳腺癌微卫星不稳定性和DNA错配修复基因突变的研究[D];广西医科大学;2009年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 洪美;应用SNP敏感性分子开关检测线粒体DNA编码区单核苷酸多态性的研究[D];南京医科大学;2009年

2 刘芳;建立LCM分离精子细胞的DNA检测方法及其法医学应用[D];山西医科大学;2011年

3 郭剑章;从近亲干扰角度对亲缘鉴定标准的研究[D];山西医科大学;2011年

4 张佑蕊;胃癌中KLF4的表达与Sp1、Notch1表达的关系及意义[D];山西医科大学;2011年

5 佘亮;MAC30蛋白、COX-2蛋白在食管鳞状细胞癌中的表达意义及相关性研究[D];河北医科大学;2011年

6 董春楠;四个X-STR基因座四色荧光复合分型体系构建及群体遗传学调查[D];河北医科大学;2011年

7 侯伟光;山东汉族17个Y染色体STR遗传多态性调查及姓氏渊源研究[D];辽宁医学院;2011年

8 周贝贝;‘鲁果2号’亲缘关系分析[D];中国林业科学研究院;2011年

9 桂程;武汉汉族群体24个mtDNA编码区SNPs研究[D];华中科技大学;2009年

10 杜芳芳;大口黑鲈POU1F1，PSSSNPs位点的筛选及与生长的关联性分析[D];上海海洋大学;2011年

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 谢发君;陈玮莹;温博贵;;微卫星不稳定性与结肠癌的研究进展[J];癌变.畸变.突变;2007年01期

2 闫峰,李宗芳;激光捕获显微切割技术应用研究新进展[J];癌症;2004年07期

3 颜坤,王明荣,房殿春,杨康;食管癌微卫星DNA不稳定性及其与临床病理的关系研究[J];第三军医大学学报;2004年17期

4 亓冰;李万水;刘冰;张丽娟;刘海东;仪军玲;李彩霞;胡兰;;激光捕获显微切割技术在法医学中的应用[J];证据科学;2008年06期

5 刘开会,李兆隆,常彩琴;用Chelex100法及有机溶剂提取法联合提取DNA扩增STR基因座的比较研究[J];中国法医学杂志;2001年02期

6 叶健,郑秀芬,季安全,Esteban J Parra,Donna M Sosnoski,Mark D Shriver;用熔解曲线法分析插入/缺失多态性和Y染色体SNPs多态性[J];中国法医学杂志;2001年04期

7 刘开会,季安全,邱宁,王坚,王传海,郭燕霞,常彩琴,王占海,王建国,曹侠;肿瘤组织9个STR基因座及Amelogenin基因座突变[J];中国法医学杂志;2002年02期

8 王保捷,丁梅,赵东,庞灏,李春梅;Y染色体3个SNP基因座及其单倍型的遗传多态性和群体差异[J];中国法医学杂志;2002年04期

9 黄如欣,游攀,周娟娟;福建汉族群体15个STR基因座频率分布[J];中国法医学杂志;2002年04期

10 邓志辉,吴国光,程良红,魏天莉,苏宇清,郝桂琴;13个STR基因座在亲子鉴定案例中的基因突变观察[J];中国法医学杂志;2003年03期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 ;中国抗癌协会妇科肿瘤专业委员会第五次学术会议征文通知[J];现代妇产科进展;2000年01期

2 ;中国抗癌协会妇科肿瘤专业委员会第6次学术会议征文通知[J];现代妇产科进展;2001年01期

3 李广太;介入技术在妇科肿瘤诊治中的应用[J];当代医学;2001年04期

4 段娥,王芳,李英勇;维生素D及其受体与妇科肿瘤[J];国外医学.妇产科学分册;2005年04期

5 ;新书介绍[J];中国实用妇科与产科杂志;2009年03期

6 周莉萍;;妇科肿瘤患者的临床心理护理[J];中国现代医生;2010年11期

7 张士伟;李昭;;妇科肿瘤病人血清中五种微量元素测定[J];天津医药;1989年07期

8 马群，赵秀升，李选民，赵敏;妇科肿瘤的综合治疗（附152例临床分析）[J];河南肿瘤学杂志;1996年04期

9 李萍;交流技巧在妇科肿瘤病人整体护理中的应用体会[J];广西医科大学学报;2001年S1期

10 路平,王平,郑全庆,李明众;nm23基因与妇科肿瘤关系的研究进展[J];国外医学.妇幼保健分册;2001年01期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 宿树兰;王团结;陈婷;段金廒;唐于平;;没药提取物及化合物分离与体外抗妇科肿瘤研究(英文)[A];全国第9届天然药物资源学术研讨会论文集[C];2010年

2 张全玲;;妊娠并存妇科肿瘤的诊断与处理[A];纪念卓越的人民医学家林巧稚大夫诞辰100周年——全国妇产科高级学术论坛论文集[C];2001年

3 马丁;;基础研究对妇科肿瘤临床的推动[A];第八次全国妇产科学学术会议论文汇编[C];2004年

4 耿毅;;妇科肿瘤分子生物学基本研究方法[A];纪念卓越的人民医学家林巧稚大夫诞辰100周年——全国妇产科高级学术论坛论文集[C];2001年

5 孙婉华;;妇科肿瘤护士临床带体会[A];全国肿瘤护理学术交流暨专题讲座会议论文汇编[C];2003年

6 曾运娴;邢红梅;;妇科肿瘤合并糖尿病手术前后健康教育[A];全国妇产科护理学术交流暨专题讲座会议论文汇编[C];2003年

7 沈铿;;妇科肿瘤的人性化治疗[A];中华医学会第一届全球华人妇产科学术大会暨第三次全国妇产科中青年医师学术会议论文汇编[C];2007年

8 张敬勉;赵新明;王建方;王颖晨;张召奇;李德志;戴春暖;孙莉;江志华;;~(18)F-FDG PET/CT显像对妇科肿瘤化疗后复发转移的诊断价值[A];第四届全国中青年核医学学术会议论文汇编[C];2008年

9 王巧兮;胡红耀;区家乐;饶珉;童世平;;子宫动脉栓塞在妇科肿瘤疾病中的应用价值[A];2010湖北省肿瘤介入治疗学术大会论文汇编[C];2010年

10 陈乐真;梁晓俐;;妇科肿瘤医生的病理学理论培训[A];中华医学会全国妇科肿瘤医生培训研讨会讲义[C];2006年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 肖鸣;[N];北京日报;2002年

2 张梅珍;[N];中国医药报;2002年

3 ;[N];中国高新技术产业导报;2001年

4 吴正芝 副主任医师;[N];医药经济报;2009年

5 尤志军;[N];中国中医药报;2002年

6 北京妇产医院 孔为民;[N];大众卫生报;2009年

7 钱进;[N];中国中医药报;2007年

8 衣晓峰;[N];健康报;2001年

9 泰山医学院附属医院 赵云霞 赵玲 徐燕 刘霞;[N];健康报;2009年

10 张献怀;[N];中国医药报;2009年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 潘灵辉;妇科肿瘤腹腔镜手术CO2气腹与麻醉对机体和颈癌细胞生物学行为的影响[D];广西医科大学;2008年

2 陈律;浏阳农村居民健康状况与农村卫生服务现状综合研究[D];中南大学;2009年

3 熊世钢;人卵巢癌细胞株COC1 COC2的建立及自分泌TGF-β促生长和对肿瘤免疫的影响[D];中国协和医科大学;1993年

4 沈铿;子宫内膜和卵巢原发性双癌的临床和病理研究[D];中国协和医科大学;1993年

5 杨文清;巨噬细胞集落刺激因子及其受体发病学意义的探讨[D];中国协和医科大学;1999年

6 刘淑娟;DOC-2分子功能的初步研究[D];中国人民解放军第四军医大学;2003年

7 高萌;代谢应激时妇科肿瘤细胞的存活依赖于AKT特异性位点的激活[D];山东大学;2013年

8 刘凤;以健保数据库探讨妇癌患者中药处方[D];广州中医药大学;2013年

9 韩世愈;扶正愈瘤饮抗肿瘤减毒增效机理的实验及临床研究[D];黑龙江中医药大学;2004年

10 李鹏;人类磷脂酰乙醇胺结合蛋白在TRAIL诱导的卵巢癌凋亡中的作用[D];山东大学;2004年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 杨安娜;21个单核苷酸多态性位点与妇科肿瘤相关性的遗传学研究[D];大连医科大学;2010年

2 冯飞;妇科肿瘤中医古文献整理及特色疗法挖掘研究[D];成都中医药大学;2013年

3 乔丽华;妇科肿瘤患者血清自体荧光光谱的分析[D];郑州大学;2010年

4 孙丽娟;常染色体及X染色体STR在乳腺癌及妇科肿瘤组织中的变异分析[D];河北医科大学;2014年

5 罗兵;联合检测肿瘤标志物在妇科肿瘤临床诊断中的评价及Toll样受体接头蛋白SARM、MyD88、TRIF在妇科肿瘤中表达情况的研究[D];安徽医科大学;2012年

6 倪千喜;妇科肿瘤后装逆向调强放射治疗的剂量学研究[D];清华大学;2013年

7 李颖;莉芙敏与更年安加减治疗妇科肿瘤患者卵巢去势症状的临床对比观察[D];辽宁中医药大学;2011年

8 李霞;211例妇女生殖系肿瘤治疗后性生活状况临床分析[D];新疆医科大学;2008年

9 王露颖;转录因子FOXC1在妇科肿瘤中的表达及临床意义[D];重庆医科大学;2010年

10 李慧灵;宫颈癌根治术后全盆腔调强适形放射治疗降低直肠、膀胱、骨髓剂量学研究[D];福建医科大学;2008年

  本文关键词：常染色体及X染色体STR在乳腺癌及妇科肿瘤组织中的变异分析，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：208944