基于oncomine和qPCR筛选高度鳞状上皮内病变相关基因

发布时间：2017-03-23 19:07

  本文关键词：基于oncomine和qPCR筛选高度鳞状上皮内病变相关基因，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的： 利用Oncomine数据库筛选在宫颈鳞癌患者中高表达的基因,用实时荧光定量PCR (Real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction, qPCR)技术比较这些基因在高度鳞状上皮内病变(HSIL)患者中的表达情况,寻找表达异常的基因,探索与早期宫颈癌相关的基因。 方法： 利用Oncomine数据库挖掘在宫颈鳞癌中高表达的基因,加权计算后,重新排序,筛选出表达差异显著的基因；选择本地区12例高度鳞状上皮内病变(HSIL)病人,均行宫颈锥切术治疗,在已切下的宫颈组织中,分别选择病变组织和正常的官颈组织,分别提取组织中的RNA,逆转录成cDNA,采用qPCR技术检测,以公式：2△△ct＝2△Ct病变组织/2△ct正常组织(Ct值是指反应时收集的实时荧光强度达到设定阈值时所经历的扩增循环数)计算各基因表达的差异倍数,并用配对t检验,对比其在宫颈鳞癌病人中的表达。 结果： 在Oncomine数据库中挖掘出8个(MMP1, SPP1, APOC1, MMP12, NEK2, ECT2, IDO1, HELLS)在宫颈鳞癌病人中高表达的基因；在HSIL病人中,通过qPCR技术检测及数据统计分析后,发现有7个在宫颈鳞癌中高表达的基因(MMP1,SPP1, APOC1, MMP12, ECT2, IDO1, HELLS),在HSIL病人中同样呈高表达,差异具有统计学意义(P0.05),只有一个基因(NEK2)在本次实验的HSIL病人中表达无差异。 结论： 利用Oncomine的大样本数据,能迅速准确地挖掘出与宫颈鳞癌相关的基因。在宫颈鳞癌和在HSIL中共同高表达的7个基因,可能参与HSIL转化为宫颈鳞癌的过程,丰富了宫颈鳞癌的早期预警指标体系,为宫颈癌的早发现、预防及有效治疗提供科学依据,在可能为今后的深入研究奠定基础。
【关键词】：Oncomine数据库 qPCR 高度鳞状上皮内病变 宫颈鳞癌
【学位授予单位】：浙江大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R737.33
【目录】：

• 致谢4-5
• 中文摘要5-7
• Abstract7-9
• 目录9-10
• 1 绪论10-13
• 2 材料和方法13-20
• 2.1 实验器材与仪器13-16
• 2.2 实验方法16-19
• 2.3 数据分析19-20
• 3 结果20-43
• 3.1 oncomine数据库相关基因筛选20-33
• 3.2 各样本RNA质检报告33-34
• 3.3 每一个病人不同组织中基因的表达差异结果34-38
• 3.4 每一个基因在不同病人不同组织中的表达差异结果38-43
• 4 讨论43-46
• 5 总结46-47
• 参考文献47-53
• 综述53-59
• 参考文献56-59
• 作者简历及在读期所取得的科研成果59

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前5条

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  本文关键词：基于oncomine和qPCR筛选高度鳞状上皮内病变相关基因，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：264379