基于Illumina测序分析宫腔粘连患者子宫内膜菌群多样性

发布时间：2022-02-14 09:45

　　目的:从菌群总体角度分析比较不同严重程度宫腔粘连（IUA）患者与健康育龄期女性的子宫内膜菌群的差异。方法:采集20例轻度IUA患者（IUA-L）、26例中重度IUA（IUA-M/H）及21例子宫内膜正常女性（对照组）的子宫内膜组织,对样本进行细菌基因组DNA提取、16S rRNA V4区基因扩增及采用Illumina高通量测序,比较3组子宫内膜菌群物种丰度结构及多样性。结果:在菌门水平,所有研究对象的子宫内膜菌群主要由变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门组成,三个组中变形菌门高达67.16%。在菌属水平,IUA组子宫内膜克雷伯氏菌属、希瓦氏菌属、乳酸杆菌属的相对丰度较对照组增加（31.44%、15.50%、8.77%,9.51%、15.32%、4.53%,7.11%、16.00%、6.95%）。IUA-L组和IUA-M/H组的Alpha多样组明显低于对照组（P=0.012,P=0.030）;轻度IUA组与对照组的子宫内膜菌群构成在总体上可区分（P=0.022）。结论:IUA患者与子宫内膜正常女性的子宫内膜菌群构成存在差异,主要改变优势菌群的组成比例,且分布欠均匀、群落结构相似度较低。... 

【文章来源】：现代妇产科进展. 2020,29(08)北大核心CSCD

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

3组间子宫内膜菌群Alpha多样性比较

Beta多样性是指不同样本间的微生物群落构成的相似度。基于Weighted Unifrac距离,IUA-L组与对照组的子宫内膜群菌在总体上可显著区分(P=0.022),表明两者的子宫内膜群菌结构的相似度相差最大,见图2。3组比较,虽然两两比较组内之间仍具有一些结构相似的菌群,但同时也有分开的趋势。2.4 菌群结构比较

基于Illumina测序方法,所有样本共检测到61个门,1429个属。在菌门水平,对照组、IUA-L组、IUA-M/H组患者子宫内膜的菌群中最丰富的前四个门是变形杆菌门(Proteobacteria),分别占68.11%、73.30%和67.16%;其次是厚壁菌门(Firmicutes),所占比例分别是16.06%、12.79%和20.25%;拟杆菌门(Bacteroidetes),各占8.38%、6.59%和5.80%;放线菌门(Actinobacteria),分别占比5.73%、5.50%和4.73%。见图3A。在菌属水平,对照组以不动杆菌属(Acinetobacter)为主,占22.68%,其次是克雷伯氏菌(Klebsiella),占8.77%,乳酸杆菌属(Lactobacillus)占6.95%,希瓦氏菌(Shewanella)占4.53%和其他一些总体含量相对较低的菌属。与对照组相比,IUA组子宫内膜克雷伯氏菌属、希瓦氏菌属、乳酸杆菌属的相对丰度增加(31.44%、15.50%、8.77%,9.51%、15.32%、4.53%,7.11%、16.00%、6.95%)。其中,IUA-L组克雷伯氏菌属明显增加(31.44%),不动杆菌属明显减少(12.74%),两者都是IUA-L组的优势菌属之一。见图3B。A:门水平;B:属水平

【参考文献】：
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本文编号：3624323