UHRF1在HPV E7介导的宫颈癌中的功能及调节机制的研究
发布时间：2022-02-17 15:06
宫颈癌是全球女性癌症死亡的主要原因之一,其发病率在女性中居第二位。高危型HPV （Human papilloma virus,人乳头状瘤病毒）是导致宫颈癌发生的主要危险因素。HPV的DNA可以在超过90%的宫颈鳞癌和超过50%的宫颈腺癌中检测到。HPV是双链环状DNA病毒,高危型的HPV编码的病毒蛋白E6和E7在癌症发生发展的过程起重要作用,影响细胞周期进程和细胞凋亡的过程。尽管多价HPV预防性疫苗早已研发成功且目前已在中国大陆上市,但对于已经感染或免疫力低下的人效果有限。高危型HPV的致病机制尚未完全阐明,因此深入理解HPV的致病机制仍然是有效防治宫颈癌及其相关癌症的重要前提。为了探索高危型HPV的致病机制,本研究通过对TCGA （The Cancer Genome Atlas - Cancer Genome）公共数据库中宫颈癌样本的生物信息学分析,建立了宫颈癌高表达基因谱及相关基因启动子DNA甲基化状态分值表;通过液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）技术对E7表达的细胞与对照细胞细胞核蛋白组进行非标记定量分析,发现了E7稳定表达的细胞与对照细胞相比差异表达的蛋白组;并对TCGA数据...
【文章来源】：山东大学山东省211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】：142 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２．?ＴＣＧＡ数据及ＲＮＡ－ｓｅｑ数据共有上调蛋白的互作网络及通路分析
?生存率低于ＵＨＲＦ１低表达组，表明ＵＨＲＦ１高表达的患者可能预后不良，提示??ＵＨＲＦ１的促癌作用（图１－３Ｃ）。??圉??Ｃ??〇??Ｉ?；．??差?：．；??爸?丨丨?；：：?＇??＾?ｉ?ｍ?：，Ｌｔ?／ｊｆ?ｌ?．」」卜！?］）?４?ｉ；〇?ｊ?．?ｉ」／）?｝ｊ?）一」ａ』／：．??ｍ聚游您潑效客％徽您效銳够效駿微微戮够效微竣软微??Ｂ?Ｃ??Ｃａｎｃｅｒ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ???Ｄｉｓｅａｓｅ?Ｆｒｅｅ?Ｓｕｒｖｉｖａｌ???２?＇ｌｙ．?——Ｌｏｗ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??ＴＡ?——Ｈｉｇｈ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??＇ｖ?Ｌｏｇｒａｎｋ?ｐ＝０．５５??ｃ〇?Ｖ｜，｜ｌｉｒｉｎ，ｉ?■，?｜?，?，?．?ＨＲ（ｈｉａｈ）＝ｌ．２??ｕ?°?ｐ（ＨＲ）＝０．５６??ｆ??Ｍ??ｌｌｌＨｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌ．．．．??ｇ！……丨??Ｍｏｎｔｈｓ??图１－３．?ＵＨＲＦ１与宫颈癌的关联分析。（Ａ）?ＵＨＲＦ１在成对肿瘤样本与正常样本中的表达。??每组点代表其在相应样本的表达量。（Ｂ）?ＵＨＲＦ１与癌症的相关性分析，其对于宫颈癌的??影响位居第五。（Ｃ）?ＵＨＲＦ１差异表达组的生存曲线。ＵＨＲＦ１高表达组的生存时间更短。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３．?ＵＨＲＰ１?ａｎｄ?ｃｅｒｖｉｃａ
??图１－４．?Ｅ７表达细胞差异表达核蛋白的基因本体（Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ，ＧＯ）和ＫＥＧＧ聚类分析。??（Ａ）差异表达核蛋白的生物过程富集分析。（Ｂ）差异表达核蛋白的ＫＥＧＧ细胞通路富集??分析。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－４．?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ?ａｎｄ?ＫＥＧＧ?ｐａｔｈｗａｙ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎ??ｉｎ?Ｅ７?ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ?ｃｅｌｌｓ．?（Ａ）?Ｂｉｏｌｏｇｙ?ｐｒｏｇｒｅｓｓ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ??ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ．?（Ｂ）?ＫＥＧＧ?ｃｅｌｌ?ｐａｔｈｗａｙ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｎｕｃｌｅａｒ??ｐｒｏｔｅｉｎｓ．??５．２差异表达蛋白的相互作用通路分析??通过ＳＴＲＩＮＧ在线数据库分析显著差异表达的核蛋白，从而构建蛋白互作网??络及所在通路。研究显示在蛋白互作网络中，Ｅ７表达细胞上调的核蛋白集中在??病毒进程（如图１－５?Ａ中红色圆点所示），ｍＲＮＡ代谢过程（如图１－５?Ａ中紫色??圆点所示），而其在方向化合物代谢和杂环代谢通路中也有较高富集。??Ｅ７表达细胞下调的核蛋白集中在细胞组分和蛋白复合体亚基通路中（如图??１－５Ｂ中紫色圆点所示），而其在分子功能方面，多富集于ＲＫＡ绑定、细胞骨架??蛋白绑定、细胞组分募集等通路中。??４Ｂ??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Epigenetic disruption of cell signaling in nasopharyngeal carcinoma[J]. Li-Li Li1,2,3,Xing-Sheng Shu2,Zhao-Hui Wang1,2,Ya Cao3,and Qian Tao1,2 1Shenzhen Key Laboratory of Cancer Nanotechnology,Institute of Biomedical and Health Engineering,Shenzhen Institutes of Advanced Technology,Chinese Academy of Sciences-CUHK,Shenzhen,Guangdong 518055,P.R.China;2Cancer Epigenetics Laboratory,Sir YK Pao Center for Cancer,Department of Clinical Oncology,The Chinese University of Hong Kong,Hong Kong and CUHK Shenzhen Research Institute,Shenzhen,Guangdong 518057,P.R.China;3Cancer Research Institute,Xiangya School of Medicine,Central South University,Changsha,Hunan 410078,P.R.China.. 癌症. 2011(04)
本文编号：3629626
【文章来源】：山东大学山东省211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】：142 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－２．?ＴＣＧＡ数据及ＲＮＡ－ｓｅｑ数据共有上调蛋白的互作网络及通路分析
?生存率低于ＵＨＲＦ１低表达组，表明ＵＨＲＦ１高表达的患者可能预后不良，提示??ＵＨＲＦ１的促癌作用（图１－３Ｃ）。??圉??Ｃ??〇??Ｉ?；．??差?：．；??爸?丨丨?；：：?＇??＾?ｉ?ｍ?：，Ｌｔ?／ｊｆ?ｌ?．」」卜！?］）?４?ｉ；〇?ｊ?．?ｉ」／）?｝ｊ?）一」ａ』／：．??ｍ聚游您潑效客％徽您效銳够效駿微微戮够效微竣软微??Ｂ?Ｃ??Ｃａｎｃｅｒ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ???Ｄｉｓｅａｓｅ?Ｆｒｅｅ?Ｓｕｒｖｉｖａｌ???２?＇ｌｙ．?——Ｌｏｗ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??ＴＡ?——Ｈｉｇｈ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??＇ｖ?Ｌｏｇｒａｎｋ?ｐ＝０．５５??ｃ〇?Ｖ｜，｜ｌｉｒｉｎ，ｉ?■，?｜?，?，?．?ＨＲ（ｈｉａｈ）＝ｌ．２??ｕ?°?ｐ（ＨＲ）＝０．５６??ｆ??Ｍ??ｌｌｌＨｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌ．．．．??ｇ！……丨??Ｍｏｎｔｈｓ??图１－３．?ＵＨＲＦ１与宫颈癌的关联分析。（Ａ）?ＵＨＲＦ１在成对肿瘤样本与正常样本中的表达。??每组点代表其在相应样本的表达量。（Ｂ）?ＵＨＲＦ１与癌症的相关性分析，其对于宫颈癌的??影响位居第五。（Ｃ）?ＵＨＲＦ１差异表达组的生存曲线。ＵＨＲＦ１高表达组的生存时间更短。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３．?ＵＨＲＰ１?ａｎｄ?ｃｅｒｖｉｃａ
??图１－４．?Ｅ７表达细胞差异表达核蛋白的基因本体（Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ，ＧＯ）和ＫＥＧＧ聚类分析。??（Ａ）差异表达核蛋白的生物过程富集分析。（Ｂ）差异表达核蛋白的ＫＥＧＧ细胞通路富集??分析。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－４．?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ?ａｎｄ?ＫＥＧＧ?ｐａｔｈｗａｙ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎ??ｉｎ?Ｅ７?ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ?ｃｅｌｌｓ．?（Ａ）?Ｂｉｏｌｏｇｙ?ｐｒｏｇｒｅｓｓ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ??ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ．?（Ｂ）?ＫＥＧＧ?ｃｅｌｌ?ｐａｔｈｗａｙ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｎｕｃｌｅａｒ??ｐｒｏｔｅｉｎｓ．??５．２差异表达蛋白的相互作用通路分析??通过ＳＴＲＩＮＧ在线数据库分析显著差异表达的核蛋白，从而构建蛋白互作网??络及所在通路。研究显示在蛋白互作网络中，Ｅ７表达细胞上调的核蛋白集中在??病毒进程（如图１－５?Ａ中红色圆点所示），ｍＲＮＡ代谢过程（如图１－５?Ａ中紫色??圆点所示），而其在方向化合物代谢和杂环代谢通路中也有较高富集。??Ｅ７表达细胞下调的核蛋白集中在细胞组分和蛋白复合体亚基通路中（如图??１－５Ｂ中紫色圆点所示），而其在分子功能方面，多富集于ＲＫＡ绑定、细胞骨架??蛋白绑定、细胞组分募集等通路中。??４Ｂ??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Epigenetic disruption of cell signaling in nasopharyngeal carcinoma[J]. Li-Li Li1,2,3,Xing-Sheng Shu2,Zhao-Hui Wang1,2,Ya Cao3,and Qian Tao1,2 1Shenzhen Key Laboratory of Cancer Nanotechnology,Institute of Biomedical and Health Engineering,Shenzhen Institutes of Advanced Technology,Chinese Academy of Sciences-CUHK,Shenzhen,Guangdong 518055,P.R.China;2Cancer Epigenetics Laboratory,Sir YK Pao Center for Cancer,Department of Clinical Oncology,The Chinese University of Hong Kong,Hong Kong and CUHK Shenzhen Research Institute,Shenzhen,Guangdong 518057,P.R.China;3Cancer Research Institute,Xiangya School of Medicine,Central South University,Changsha,Hunan 410078,P.R.China.. 癌症. 2011(04)
本文编号：3629626
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