子宫内膜异位症患者阴道菌群特征性研究与功能预测

发布时间：2022-10-31 21:16

　　目的:探讨内异症患者阴道内特征性细菌群落,找出相关细菌种类,通过功能预测探索细菌与内异症患者交联的相关功能通路。方法:纳入受试者58例,每例患者分别于宫颈口和阴道后穹窿取样,最终诊断根据其手术记录和病理结果分类,其中内异症患者32例（55.17%）,对照组患者26例（44.83%）。对采样标本进行PCR扩增,其中1例后穹窿标本扩增失败,共115例样本。使用一代Illumina测序对于细菌16s核糖体RNA（16s-rRNA）的高变区V3V4片段测序,原始数据经拼接、过滤后进行可视化操作并且挖掘细菌组学相关数据,使用KEGG作为参考数据库进行功能预测。结果:内异症患者与对照组的α多样性无显著差异,PCoA距离矩阵分析也并未见显著差异。内异症患者中,阴道奇异菌（Atopobium Vaginalis）和Howardella Ureilytica显著增多,短双歧杆菌（Bifidobaterium Breve）和阴道加德纳菌（Gardnerella Vaginalis）显著减少。功能预测方面,磷酸转移酶系统、乳果糖与甘露糖代谢、氨基糖与核苷酸糖代谢这三种功能在内异症患者中显著增加,而半胱氨酸与... 

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【文章目录】：
1 资料与方法
    1.1 资料与方法
    1.2 方法
        1.2.1 标本收集
        1.2.2 16s核糖体RNA(16s ribosomal RNA)测序
    1.3 数据处理
2 结 果
    2.1 样本收集
    2.2 阴道微生物组学特征性研究
        2.2.1 微生物组学α多样性
        2.2.2 β多样性的差异
        2.2.3 多维度距离矩阵的比较
        2.2.4 统计学方面
        2.2.5 微生物的功能预测(Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States,PICRUSt)
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]胃肠道微生物与子宫内膜异位症发生发展的关系及其临床意义[J]. 徐晓璇,冷金花.  中华妇产科杂志. 2018 (07)



本文编号：3699731