去泛素化酶OTUD5与CacyBP的相互作用及OTUD5在宫颈癌中的生物信息学分析

发布时间：2023-05-18 19:19

　　目的研究发现,OTUD5(OTU deubiquitinase 5)作为OTU亚家族中的重要成员之一,在DNA损伤修复和免疫学领域扮演着重要角色。目前来说OTUD5的研究相对较少,并且其是否能够被调控仍未知。钙周期素结合蛋白(Calcyclin binding protein,CacyBP)在小鼠艾氏腹水细胞瘤中以S100A6蛋白的靶分子形式发现。研究发现CacyBP影响多种肿瘤的发生发展,此外已有报道表明在人胶质瘤细胞中过表达CacyBP下调p53的蛋白水平。目前,OTUD5在肿瘤中的功能尚不清楚,通过生物信息学分析OTUD5在宫颈癌中的表达给相关研究提供借鉴。去泛素化酶OTUD5是否与CacyBP相互作用和对宫颈癌的调控尚不清楚。方法利用Western blot实验检测OTUD5或CacyBP过表达后外源底物蛋白的变化。采用RNA干扰技术敲低OTUD5或CacyBP后检测内源底物蛋白的变化。采用实时定量PCR(qRT-PCR)检测OTUD5或CacyBP过表达对底物mRNA水平的影响。利用半衰期实验检测CacyBP过表达后底物蛋白OTUD5的降解速率,探讨CacyBP对OTUD5稳...

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【学位级别】：硕士

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摘要
abstract
引言
材料与方法
    1.实验材料
        1.1 细胞
        1.2 实时定量PCR引物序列
        1.3 主要试剂
    2.实验方法
        2.1 细胞培养
        2.2 细菌培养
        2.3 蛋白的提取
        2.4 体内泛素化实验
        2.5 半衰期实验
        2.6 免疫共沉淀
        2.7 RNA抽提
        2.8 反转录PCR
        2.9 GEPIA
        2.10 Oncomine分析
        2.11 UALCAN分析
        2.12 Linked Omics分析
        2.13 Gene MANIA分析
        2.14 cBio Portal分析
        2.15 GO分析和KEGG分析
        2.16 Kaplan-Meier绘图
结果
    1.去泛素化酶OTUD5与CacyBP的相互作用
        1.1 CacyBP调节OTUD5 的蛋白稳定性并促进其泛素化
        1.2 CacyBP应答DNA损伤
        1.3 OTUD5 调控CacyBP的泛素化水平并促进其入核
    2.去泛素化酶 OTUD5 在宫颈癌组织中的表达及其生物信息学功能分析
        2.1 OTUD5在CESC中异常低水平表达,预后不良
        2.2 OTUD5表达与宫颈癌临床病理特征的关系
        2.3 CESC中 OTUD5 共表达基因的富集分析
        2.4 在CESC中 ,潜在的调节OTUD5 m RNA水平的mi RNA和转录因子
        2.5 蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)和与OTUD5 相互作用的蛋白质的富集分析
结论
讨论
参考文献
综述
    综述参考文献
攻读学位期间的研究成果
缩略词表
致谢



本文编号：3818833