通过全外显子组测序技术鉴别同时性子宫内膜及卵巢原发双癌与转移性癌
发布时间:2024-05-19 16:21
背景女性生殖道原发双癌较少见,约占所有妇科肿瘤的1%-2%。相对于单发的卵巢癌或子宫内膜癌患者,原发双癌患者具有独特的完全不同于单发肿瘤的临床特点及预后,故同时性原发性双癌需与转移性肿瘤患者严格鉴别,明确的诊断对患者的治疗决策及预后紧密相关。但目前原发的诊断标准及与转移癌的鉴别诊断标准尚存在诸多争议。目的本研究的目的是通过全外显子测序研究子宫内膜与卵巢原发双癌肿瘤基因突变模式,从共有差异基因、突变特征、克隆起源等寻找克隆联系,从分子特征上描述双发癌,与转移癌区别,辅助临床诊断,进而为建立原发双癌的分子学诊断标准提供理论依据。方法根据病历记录及病理报告,选取1年内临床诊断的子宫内膜与卵巢原发双癌患者共6例。6例患者均符合传统病理学标准诊断的独立性原发性子宫内膜与卵巢原发双癌,卵巢肿瘤及子宫内膜肿瘤的病理类型均为子宫内膜样肿瘤,取每位患者两部位肿瘤病灶石蜡切片行二代全外显子测序。本研究分析和报道了所有成对样本的克隆结构、遗传异质性和进化轨迹,将测序结果进行点突变比对,找出可能存在的点突变差异,作为分子标记物鉴别分子学上的转移癌和双发癌,并进一步利用单核苷酸变异重建了两部位肿瘤的进化史。结果...
【文章页数】:72 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本文编号:3978166
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【学位级别】:博士
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图2.样本突变数
补充图2.样本突变数。??
图3.肿瘤细胞的纯度和倍性分析
?中国医学科学院北京协和医学院博士研宄生学位论文补充图3.肿瘤细胞的纯度和倍性分析。EC为子宫内膜癌样本,OC为卵巢癌
图1.SE0C中EC?(A)及OC?(B)的突变谱,包括SNVs及Indels
?2.点突变及小的插入缺失??EC和0C的总体突变情况如图1所示。7个EC和9个0C样本的突变谱简要??介绍如下,从变异分类、变异类型、SNV分级、每个样本的变异数、转位/置换百??分比及突变最多的基因等多个方面进行了分析。总的来说,EC和0C的体细胞总??变异类型显示出显著的相....
图3.配对样本的拷贝数变异及比较
?<〇?!??3.拷贝数变异??EC和OC样本的拷贝数变异如图3所示。不同于SNVs和小的Indels,?CNVs的变异??情况在EC和0C之间表现出更多的差异。总体来说,在群组层面,EC样本与0C样本??相比包含更多反复出现的缺失而轻微减少的扩增,并且反复出现的SNVs在两组样....
本文编号:3978166
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