子宫内膜癌预后相关差异表达基因筛选及其生物信息学分析

发布时间：2025-01-06 00:28

　　 目的筛选子宫内膜癌(EC)预后相关的差异表达基因(DEGs),并对其进行生物信息学分析。方法从癌症基因组图谱(TCGA)收集临床病理学参数及生存资料完整的EC患者140例,与基因表达综合(GEO)数据库联合筛选DEGs。以各基因表达水平的中位数作为高低表达的截断值,通过COX回归和Kaplan-Meier曲线筛选预后相关DEGs,并比较不同临床病理参数EC患者预后相关DEGs表达水平。使用基因本体论(GO)及基因组百科全书(KEGG)对预后相关DEGs进行功能通路富集分析。结果 TCGA联合GEO数据库共筛选出5个DEGs,即ASPA、MYBL2、TROAP、CCNB2和CDC25C(P均<0.05); 5个DEGs中,仅MYBL2基因高低表达EC患者总生存期和无病生存期差异有统计学意义(P均<0.05),且组织低分化、Ⅱ型EC患者MYBL2基因高表达比例分别高于高分化、Ⅰ型患者(P均<0.05)。GO功能富集分析结果显示,MYBL2基因在生物学过程层面主要参与细胞代谢、生物调节等过程,在细胞组成层面主要参与细胞膜、细胞核、大分子复合物等的形成,在分子功能层面主要参与...

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【文章目录】：
1 资料与方法
    1.1 数据库及软件
    1.2 方法
        1.2.1 数据来源
        1.2.2 EC中DEGs的筛选从TCGA数据库中
        1.2.3 EC预后相关DEGs的筛选
        1.2.4 不同临床病理参数EC患者预后相关DEGs表达分析
        1.2.5 EC预后相关DEGs的功能与通路富集分析
2 结果
    2.1 EC中DEGs的筛选结果
    2.2 EC预后相关DEGs的筛选结果
    2.3 不同临床病理参数EC患者MYBL2基因表达水平比较
    2.4 MYBL2的GO和KEGG富集分析结果
3 讨论



本文编号：4023506